rs12252的多态性在检测流感病毒抗体中的应用制造技术

技术编号:18545009 阅读:26 留言:0更新日期:2018-07-28 05:57
本发明专利技术公开了rs12252的多态性在检测流感病毒抗体中的应用。本发明专利技术所保护的技术方案是检测人基因组中rs12252的多态性或基因型的物质在制备检测或辅助检测青年人中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平的产品中的应用、在制备筛查建议接种预防H1N1pdm09流感病毒引起的流行性感冒的疫苗的青年人的产品中的应用或在制备检测青年人对H1N1pdm09流感病毒的抵抗力的产品中的应用。本发明专利技术可用于筛查需要建议注射预防H1N1pdm09流感病毒引起的流行性感冒的疫苗的青年人。

【技术实现步骤摘要】
rs12252的多态性在检测流感病毒抗体中的应用
本专利技术涉及生物医学领域中rs12252的多态性在检测流感病毒抗体中的应用。
技术介绍
单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)指基因组单个核苷酸的变异,它是最微小的变异单元,是由单个核苷酸对置换、颠换、插入或缺失所形成的变异形式。单核苷酸多态性是基因组上高密度的遗传标志,在人类基因组中已发现的SNP数量超过3000万。作为第三代遗传标记SNP数量众多、分布密集,易于检测,因而是理想的基因分型目标。rs12252是人染色体11p5.5上的一个二等位多态性的SNP位点,该变异是转换(T/C,在其互补链上则为A/G),该位点位于干扰素诱导跨膜蛋白3(IFITM3)基因中。干扰素诱导的跨膜蛋白3(IFITM3,也被称为1-8U)的基因最初确定于1984年,系从INF治疗神经母细胞瘤筛选cDNA过程中发现,其克隆来源于人淋巴细胞的cDNA文库。IFITM3可在大多数组织中翻译表达,并高度诱导干扰素表达。以往的研究表明IFITM3属于鼠基因家族,其较短,含有2个跨膜结构域的蛋白(5-18kDa),具有较高的核心序列相似性,但N和C-末端存在进化差异。人类的同源基因(IFITM1,IFITM2,和IFITM3)均聚集在11号染色体上一个18-kb的基因组序列内,并介导细胞的发育过程,包括细胞粘附,免疫细胞调节,生殖细胞归巢和成熟。2009年甲型H1N1/2009流感(H1N1pdm09)在墨西哥爆发,并且迅速蔓延感染全球其他国家地区的人和猪群。H1N1pdm09流感病毒来源于猪,是一种人、猪、禽三源重组病毒。目前,疫苗接种是防控流感的主要方法。儿童、老人、慢性病患者、孕妇都建议接种疫苗,避免他们因为感染流感导致严重疾病,以及并发症的发生。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是如何检测青年人中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平、如何筛查建议接种疫苗的青年人或如何检测青年人对H1N1pdm09流感病毒的抵抗力。为解决上述技术问题,本专利技术首先提供了下述1-3中任一应用:1、检测人基因组中rs12252的多态性或基因型的物质在制备检测青年人中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平的产品中的应用;2、检测人基因组中rs12252的多态性或基因型的物质在制备筛查建议接种疫苗的青年人的产品中的应用;所述疫苗为预防H1N1pdm09流感病毒引起的流行性感冒的疫苗;3、检测人基因组中rs12252的多态性或基因型的物质在制备检测青年人对H1N1pdm09流感病毒的抵抗力的产品中的应用。rs12252是人染色体11p5.5上的一个二等位多态性的SNP位点,该变异是转换(T/C,在其互补链上则为A/G)。上述应用中,所述青年人可为年龄为17-23岁的人。所述青年人可为3个月内既未感染流感病毒又未接种流感疫苗的年龄为17-22岁的人。所述青年人还可为在12-18个月前接种流感疫苗的年龄为18-23岁的人。上述应用中,所述流感疫苗可为预防H1N1pdm09流感病毒引起的流行性感冒的疫苗。所述流感疫苗还可为预防H1N1pdm09流感病毒、甲型H3N2流感病毒和B型流感病毒引起的流行性感冒的疫苗。上述应用中,所述流感疫苗是流感病毒灭活疫苗。所述流感疫苗的活性成分为灭活的甲型H3N2流感病毒、灭活的H1N1pdm09流感病毒和灭活的B型流感病毒。上述应用中,所述rs12252基因型是CC、CT或TT。其中,CC是rs12252位点为C的纯合型,TT是rs12252位点为T的纯合型,CT是rs12252位点为T和C的杂合型。上述应用中,当所述青年人为3个月内既未感染流感病毒又未接种流感疫苗的年龄为17-22岁的人时,所述CC基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平高于所述TT基因型的青年人群和所述CT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平;所述CT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平与所述TT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平没有统计学差异。上述应用中,当所述青年人为在12-18个月前接种流感疫苗的年龄为18-23岁的人时,所述CC基因型的青年人群和所述CT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平高于所述TT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平;所述CC基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平与所述CT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平没有统计学差异。实验证明,在3个月内既未感染流感病毒又未接种流感疫苗的年龄为17-22岁的青年人群中,所述CC基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平高于所述CT基因型的青年人群和所述TT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平;所述CT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平与所述TT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平没有统计学差异。在12-18个月前接种流感疫苗的年龄为18-23岁的青年人群中,所述CC基因型的青年人群和所述CT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平高于所述TT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平;所述CC基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平与所述CT基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平没有统计学差异。在14-28天前接种流感疫苗的年龄为17-22岁的青年群中,所述CC基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平与所述TT基因型的青年人群和所述CC基因型的青年人群中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平没有统计学差异。实验证明,在3个月内既未感染流感病毒又未接种流感疫苗的年龄为17-22岁的青年人群中,CC基因型在接种流感疫苗后第14天和第28天针对H1N1pdm09流感病毒的抗体效价均增长了2倍,远远低于TT基因型人群接种疫苗后针对H1N1pdm09流感病毒的抗体效价增长的倍数(在接种后第14天针对H1N1pdm09流感病毒的抗体效价增长10倍,在接种后第28天针对H1N1pdm09流感病毒的抗体效价增长8倍);接种流感疫苗后第14天CC基因型人群产生针对H1N1pdm09流感病毒的抗体效价增长大于等于4倍人数比例为48.6%,远低于TT基因型(产生针对H1N1pdm09流感病毒的抗体效价增长大于等于4倍人数比例为78.6%)。说明预防H1N1pdm09流感病毒引起的流行性感冒的疫苗对TT基因型人群分泌针对H1N1pdm09流感病毒的特异性抗体更有效。上述应用中,所述检测人基因组中rs12252的多态性或基因型具体可通过检测rs12252的核苷酸种类确定。上述应用中,检测人基因组中rs12252的多态性或基因型的物质可为通过下述至少一种方法确定rs12252的多态性或基因型所需的试剂和/或仪器:DNA测序、限制性酶切片段长度多态性、单链构象多态性、变性高效液相色谱、SNP芯片、TaqMan探针技术和SequenomMassArray技术。其中,本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.检测人基因组中rs12252的多态性或基因型的物质在制备检测或辅助检测青年人中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平的产品中的应用。

【技术特征摘要】
1.检测人基因组中rs12252的多态性或基因型的物质在制备检测或辅助检测青年人中针对H1N1pdm09流感病毒的抗体水平的产品中的应用。2.检测人基因组中rs12252的多态性或基因型的物质在制备筛查建议接种疫...

【专利技术属性】
技术研发人员:覃岭张永宏赵艳李宁
申请(专利权)人:首都医科大学附属北京佑安医院
类型:发明
国别省市:北京,11

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