基于基因表达预测FIGO IIIC期浆液性卵巢癌预后的方法技术

本发明专利技术属于医学分子生物学技术领域，具体为一种基于基因表达预测FIGO IIIC期浆液性卵巢癌预后的方法。本发明专利技术方法包括如下步骤：提取病人组织样本中的mRNA，对其中的靶基因进行定量，并对所获取的基因进行去背景和归一化处理；对样本所在样本集进行z‑score转化，得到初始靶基因表达相对量；根据所描写的方程和方程中所测的靶基因的相对表达量，计算风险系数；并根据阈值判断病人术后的危险程度。本方法具有稳健性强，检测速度快，不依赖于已有临床指标和治疗药物的特点。通过本方法可为病人的预后，随访和治疗提供指导。

Prediction of the prognosis of FIGO IIIC serous ovarian cancer based on gene expression

【技术实现步骤摘要】
基于基因表达预测FIGOIIIC期浆液性卵巢癌预后的方法
本专利技术属于医学分子生物学
，具体涉及多基因表达定量对预后的指导作用的处理方法，包括基因芯片技术，二代测序技术和实时定量PCR技术对卵巢癌预后的模型。
技术介绍
目前，FIGOIIIC期浆液性卵巢癌用于临床的预后指标主要以传统临床病理特征为基础，依赖手术和治疗方式。其中包括病人的病理分级，年龄等信息（参见：BristowRE,ZahurakML,AlexanderCJ,etal.FIGOstageIIICendometrialcarcinoma:resectionofmacroscopicnodaldiseaseandotherdeterminantsofsurvival[J].InternationalJournalofGynecologicalCancer,2003,13(5):664-672.）。临床信息能够反映出癌症的进展，却不能反映癌症本身的异质性，因而无法给出全面的预测效果（参见：BakkarR,GershensonD,FoxP,etal.StageIIICovarian/peritonealserousc本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种基于基因表达预测FIGO IIIC期浆液性卵巢癌预后的方法,其特征在于，具体步骤为：（1）对病人术后新鲜或冷冻组织样本抽提RNA，然后对所需的七个靶基因进行定量分析；这里，所述七个靶基因，是从表达谱20000多个基因中优化组合选择出的，具体为IL2RG，CXCL9，TSPAN13，CXCL13，GADD45G，RAB36和CD3D；（2）再通过对应的去背景和标准化的方法对数据进行进一步处理，随后用z‑score转化的方法计算样本在样本集中的相对分布位置；（3）根据下述风险预测模型，预测该病人的风险系数：风险系数值=(0.1074*CD3D)+(‑0.2262*RAB36) +(‑0.174...

【技术特征摘要】
1.一种基于基因表达预测FIGOIIIC期浆液性卵巢癌预后的方法,其特征在于，具体步骤为：（1）对病人术后新鲜或冷冻组织样本抽提RNA，然后对所需的七个靶基因进行定量分析；这里，所述七个靶基因，是从表达谱20000多个基因中优化组合选择出的，具体为IL2RG，CXCL9，TSPAN13，CXCL13，GADD45G，RAB36和CD3D；（2）再通过对应的去背景和标准化的方法对数据进行进一步处理，随后用z-score转化的方法计算样本在样本集中的相对分布位置；（3）根据下述风险预测模型，预测该病人的风险系数：风险系数值=(0.1074*CD3D)+(-0.2262*RAB36)+(-0.1740*G...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘刚，刘雷，程玺，陈丽华，
申请(专利权)人：复旦大学，
类型：发明
国别省市：上海,31