基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统及其方法技术方案

本发明专利技术公开了一种基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统及其方法，该系统包括项目管理模块、基础分析任务提交模块和交互式结果分析模块；首先，向本地集群服务器上传测序数据，在项目管理模块中建立项目，同时在本地集群服务器上传客户的数据库或者选择使用线上的数据库，并且在该项目管理模块中可以进行项目锁定或者共享给他人操作；然后，在基础分析任务提交模块中，用户可以通过可视化界面对测序数据进行参数分析，分析之后产生项目文件；分析之前，先进行判定数据质控是否合格，若合格则进行参数分析；若不合格则直接返回报错；产生的项目文件传送至交互式结果分析模块中进行交互式分析，得到直观呈现的报告。

Eukaryotic nonparametric transcriptome interaction analysis system and its method based on computational cloud platform

The invention discloses an interactive analysis system and method reference group of cloud computing based on transcription of eukaryotic based, project management module, analysis module and interactive task submission analysis module including the system; first, to the local server to upload the sequencing data, the establishment of the project in the project management module, also in the local server cluster upload the customer database or choose to use the online database, and can be locked or project is shared with others in the project operation management module; then, based on analyzing the task module, the user can analysis the parameters of sequencing data through the visual interface, analysis after the project file; before the analysis, advanced judge data quality control if it is qualified, qualified for parameter analysis; if not qualified directly return error The generated project files are sent to the interactive result analysis module for interactive analysis, and an intuitive presentation of the report is obtained.

【技术实现步骤摘要】
基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统及其方法
本专利技术涉及生物信息分析
，尤其涉及一种基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统及其方法。
技术介绍
转录组又称转录物组或表达谱，指特定物种、组织或细胞类型在某一时期内表达的所有RNA的总和，包括编码蛋白质的mRNA和各种非编码的RNA(rRNA、tRNA、snoRNA、snRNA、microRNA等)。转录组包含了时间和空间的限定，它是基因组与外部物理特征的动态联系，转录组反映的是特定条件下活跃表达的基因，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。转录组学是从RNA水平研究基因表达变化的学科，对于尚不能得到全基因组序列的物种而言，进行转录组测序，已成为沟通表型和基因型的重要桥梁。转录组的研究可以提供特定条件下基因的表达信息，从而推断未知基因的功能，揭示特定调节基因的作用机制，还可以确定不同种类的细胞和组织的基因在何时何地被激活或进入休眠，对转录本的定量可以了解特定基因的活性和表达量，用于疾病的诊断和治疗。相对于真核生物全基因组而言，转录组序列不含有内含子及其它非编码序列，能给出更高效的有用信息。转录组测序及分析技术可以解决新基本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统，其特征在于：包括项目管理模块，用于对项目信息进行查看和管理，通过项目、任务、应用和文件对所有状态的分析项目进行综合管理；基础分析任务提交模块，用于设置基础参数运行任务，并将结果以及原始数据按照预设格式整合封装成相应的项目文件，基础参数运行任务包括测序数据质控、转录组拼接、基因功能注释、表达量分析和基因结构分析；交互式结果分析模块，用于根据用户请求生成分析结果，并将结果可视化展示，包括高级生物信息学分析和个性化生物信息学分析；所述项目管理模块通过基础分析任务提交模块与交互式结果分析模块相连接。

【技术特征摘要】
1.一种基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统，其特征在于：包括项目管理模块，用于对项目信息进行查看和管理，通过项目、任务、应用和文件对所有状态的分析项目进行综合管理；基础分析任务提交模块，用于设置基础参数运行任务，并将结果以及原始数据按照预设格式整合封装成相应的项目文件，基础参数运行任务包括测序数据质控、转录组拼接、基因功能注释、表达量分析和基因结构分析；交互式结果分析模块，用于根据用户请求生成分析结果，并将结果可视化展示，包括高级生物信息学分析和个性化生物信息学分析；所述项目管理模块通过基础分析任务提交模块与交互式结果分析模块相连接。2.根据权利要求1所述的基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统，其特征在于，所述交互式结果分析模块中高级生物信息学分析和个性化生物信息学分析，包括基因共表达网络构建、Ipath整合分析、蛋白互作网络分析、转录因子分析、模式物种同源注释分析、基于时间序列的基因表达分析、利用转录组数据构建系统发育树、近缘物种直系同源分析、Divergent同源基因GO/KEGG分析、Conserved同源基因GO/KEGG分析、GO分类水平的选择压力分析、树假设检验分析。3.一种如权利要求1所述基于计算云平台的真核无参转录组交互分析系统的分析方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1，创建项目；步骤2，向本地集群服务器上传测序数据，在项目管理模块中建立项目，在该项目管理模块中可以进行项目锁定或者共享给他人操作；步骤3，建立任务；步骤4，在基础分析任务提交模块中，用户可以通过可视化界面对测序数据进行参数分析，分析之后产生项目文件；分析之前，先进行判定数据质控是否合格，若合格则进行参数分析；若不合格则直接返回报错；参数分析包括测序数据质控、转录组拼接、基因功能注释、表...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘彬旭，余果，郭权，任一，史彩萍，曾静，石今，周玄，
申请(专利权)人：上海桑格信息技术有限公司，
类型：发明
国别省市：上海,31