The present invention discloses a method for analyzing the relationship between gene and locus based on multi omics analysis, belonging to the field of biological information and computer data analysis. The method comprises the following steps: the collected patient samples, respectively, using transcriptome analysis, CHIP analysis, Seq miRNA analysis and GWAS analysis to analyze the etiology, gene mutation or loci and confidence were obtained (G1, x1), (G2, x2), (G3, x3) and (G4, x4); using the estimated function H theta (x) = 0.2+0.7*x1+0.6*x2+0.3*x3+0.9*x4 to the above analysis result is integrated to control the analysis of the relationship between genes or loci and disease. The accuracy of the estimated function for disease related gene analysis was 87%.
【技术实现步骤摘要】
基于多组学分析基因或位点对疾病调控关系的方法
本专利技术涉及生物信息和计算机数据分析领域，具体涉及一种基于多组学分析基因或位点对疾病调控关系的方法。
技术介绍
转录组分析，是在整体水平上对细胞中基因转录的情况及转录调控规律进行分析。简而言之，转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。CHIP-seq，指的是结合位点分析法，作用为研究体内蛋白质与DNA的相互作用关系。染色质免疫共沉淀技术(ChromatinImmunoprecipitation，CHIP)也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将CHIP与第二代测序技术相结合的CHIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。MicroRNA(miRNA)是一类内生的、长度约为20-24个核苷酸的小RNA，其在细胞内具有多种重要的调节作用。每个miRNA可以有多个靶基因，而几个miRNA也可以调节同一个基因。这种复...
【技术保护点】
一种基于多组学分析基因或位点对疾病调控关系的方法，其特征在于：包括如下步骤：采集到病人数据后，分别使用转录组分析、CHIP‑Seq分析、miRNA分析以及GWAS分析对病因进行分析，得到的突变基因或位点和置信度分别为(g1，x1)、(g2，x2)、(g3，x3)和(g4，x4)；使用估计函数hθ(x)＝0.2+0.7*x1+0.6*x2+0.3*x3+0.9*x4对上述分析结果进行整合，以分析基因或位点和疾病之间的调控关系。
【技术特征摘要】
1.一种基于多组学分析基因或位点对疾病调控关系的方法，其特征在于：包括如下步骤：采集到病人数据后，分别使用转录组分析、CHIP-Seq分析、miRNA分析以及GWAS分析对病因进行分析，得到的突变基因或位点和置信度分...
【专利技术属性】
技术研发人员：袁晓辉，
申请(专利权)人：武汉古奥基因科技有限公司，
类型：发明
国别省市：湖北,42
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