一种基于芯片数字PCR的反应通孔数优化分析算法制造技术

本发明专利技术公开了一种基于芯片数字PCR的反应通孔数优化分析算法，其利用C语言生成随机数集的方法得到目标粒子个数和干扰粒子个数，通过模拟目标粒子在干扰粒子作用下在芯片反应通孔中的分布情况得到芯片反应通孔个数。该反应通孔数优化分析算法通过C程序的模拟计算可以得到数字PCR芯片反应通孔的最佳个数，使其在芯片数字PCR的设计过程中，通过分析计算得到芯片反应通孔的个数优化值，从而得到芯片反应通孔的最佳个数，进而在保证灵敏度的前提下，降低了实验成本，避免了反应通孔数量的非限性增长引发的设计难题与成本问题。

An algorithm for optimizing the number of through holes based on chip digital PCR

The invention discloses a digital chip PCR reaction via number optimization analysis algorithm based on the C language generated by the method of random number set to obtain the target particle number and particle number of interference, through the simulation of target particles in the particle under the action of interference in the chip reaction distribution through hole in the chip reaction through hole the number of. The reaction via number optimization analysis algorithm can obtain the best number of digital PCR chip reaction through hole through simulation of C program, the PCR digital chip design process, to get the chip hole number reaction optimization value through analysis and calculation, so as to get the best number of chip reaction through hole, and then in the premise of ensuring the sensitivity, reduce the cost, avoid the problem of design and cost problems of non limiting growth reaction caused by the number of holes.

【技术实现步骤摘要】
一种基于芯片数字PCR的反应通孔数优化分析算法
本专利技术涉及生物反应中的数值模拟计算
，尤其是涉及一种基于芯片数字PCR的反应通孔数优化分析算法。
技术介绍
PCR是指聚合酶链式反应，其是一种用于放大扩增特定的DNA片段的分子生物学技术，它可看作是生物体外的特殊DNA复制，PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加。芯片数字PCR(cdPCR)是近年来正在迅速发展的一种全新的核酸检测技术。与传统的定量PCR相比，数字PCR不依赖于扩增曲线的循环阈值(Ct)，也无需采用看家基因和标准曲线，因此具有高灵敏度、高精度、高耐受性、绝对定量等优点。cdPCR通过把反应液均匀分到芯片上的反应通孔中进行PCR反应，然后根据泊松分布和荧光信号阳性比例来计算目的核酸的拷贝数。在cdPCR具体的设计过程中，确定芯片最佳反应通孔数对cdPCR的设计至关重要。若芯片反应通孔数过低，则芯片数字PCR的检测灵敏度无法满足要求；而芯片反应通孔数过高，则将带来工艺难度的提升与设计成本的增加，特对是对于目的核酸片段较少、检测灵敏度要求不高的实验，高昂的PCR仪显然与实际需求相违背。因此，提供一种反应通孔数优化本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种基于芯片数字PCR的反应通孔数优化分析算法，其特征在于，利用C语言生成随机数集的方法得到目标粒子个数和干扰粒子个数，通过模拟目标粒子在干扰粒子作用下在芯片反应通孔中的分布情况得到芯片反应通孔个数。

【技术特征摘要】
1.一种基于芯片数字PCR的反应通孔数优化分析算法，其特征在于，利用C语言生成随机数集的方法得到目标粒子个数和干扰粒子个数，通过模拟目标粒子在干扰粒子作用下在芯片反应通孔中的分布情况得到芯片反应通孔个数。2.根据权利要求1所述的反应通孔数优化分析算法，其特征在于，包括以下步骤：S11:在C语言算法程序中生成m+n个随机数，该随机数的生成区间为[0，(m+n)*h/m]，其中m为目标粒子个数、n为干扰粒子个数，h为芯片反应通孔个数；S12:统计区间[0，h-1]内非重复随机数的总数N；S13：将S1和S2过程重复R次，统计不同N对应的出现次数Y；S14:根据不同h对应的N-Y曲线重叠度得到最佳通孔数。3.根据权利要求1所述的反应通孔数优化分析算法，其特征在于，包括以下步骤：S21:在C语言算法程序中生成m+n个随机数，该随机数的生成区间为[0，(m+n)*h...

【专利技术属性】
技术研发人员：叶锋，
申请(专利权)人：北京旌准医疗科技有限公司，
类型：发明
国别省市：北京,11