一种水体微生物污染来源定量解析方法技术

技术编号:16030246 阅读:272 留言:0更新日期:2017-08-19 11:41
本发明专利技术公开了一种水体微生物污染来源定量解析方法,选取针对目标区域具有特异性强、灵敏度高且可定量分析的特异性生物标记引物,通过qPCR扩增技术构建标准曲线方程。再采集实际水域样品,提取水样品中的基因组DNA;采用区域特异性引物进行qPCR扩增,结果代入标准曲线方程进行计算,得出目标水域中各微生物的浓度值,根据各微生物的浓度值来解析区域目标水域的污染源。通过本发明专利技术的方法可识别低浓度的目标微生物,适用于不同水质的环境水体,为环境水体的监测、溯源和治理提供了可靠的依据。

【技术实现步骤摘要】
一种水体微生物污染来源定量解析方法
本专利技术总体涉及环境监测技术,具体涉及一种水体微生物污染来源定量解析方法。
技术介绍
未经处理(或未完全处理)人和畜禽粪便污染是造成水体微生物污染的最主要原因,如何快速准确区分水体中微生物污染的主要来源并及时有效的进行针对性源头控制是解决问题的关键环节。目前我国基本符合标准的饮用水水源仅占30%左右,且类型以生物污染为主(69.1%),远高于化学污染的比例。世界各国通常将粪大肠菌群或大肠埃希氏菌作为指示微生物,以反映水体微生物污染状况,但这些传统指标仅能反映出粪便污染的程度,不能识别污染的确切来源,更不能评价不同污染源的各自贡献率。由于缺乏粪便污染来源的准确信息使得目前治理仍停留在见污治污阶段,极大增加了污染治理的难度与成本。近年来,欧美等发达国家纷纷开展了以宿主特异性生物标记为基础的水体微生物污染源解析的研究工作,并已开发出了猪、牛、人、鸡、野禽等动物的多种特异性引物,及时提供粪便污染来源的准确信息以及时有效的进行针对性源头控制。然而,宿主消化道内各种肠道菌群之间的相互作用极为复杂,并且外界环境的差异性易导致消化道内菌群的基因发生变化,造成不同本文档来自技高网...
一种水体微生物污染来源定量解析方法

【技术保护点】
一种水体微生物污染来源定量解析方法,包括以下步骤:(1)引物区域性验证:在区域目标水域周边采集不同生物的粪便样品,样品采集后保存于冰盒中,送回实验室进行后续处理;采用粪便基因组DNA提取试剂盒通过悬浮、破碎、吸附柱纯化步骤从粪便样品中提取基因组DNA,置于冰箱低温储存;以各生物粪便中提取的基因组DNA为模板,选取已有的各生物拟杆菌特异性引物分别进行qPCR扩增,分析引物的灵敏度与特异性;选取灵敏度和特异性较高的引物作为区域特异性引物;(2)标准曲线制作:以区域特异性引物对提取的基因组DNA进行PCR扩增,对扩增后的目标产物进行纯化回收,连接到pMD 19‑T Vector载体上,转化DH5α感...

【技术特征摘要】
1.一种水体微生物污染来源定量解析方法,包括以下步骤:(1)引物区域性验证:在区域目标水域周边采集不同生物的粪便样品,样品采集后保存于冰盒中,送回实验室进行后续处理;采用粪便基因组DNA提取试剂盒通过悬浮、破碎、吸附柱纯化步骤从粪便样品中提取基因组DNA,置于冰箱低温储存;以各生物粪便中提取的基因组DNA为模板,选取已有的各生物拟杆菌特异性引物分别进行qPCR扩增,分析引物的灵敏度与特异性;选取灵敏度和特异性较高的引物作为区域特异性引物;(2)标准曲线制作:以区域特异性引物对提取的基因组DNA进行PCR扩增,对扩增后的目标产物进行纯化回收,连接到pMD19-TVector载体上,转化DH5α感受态细胞,采用含有氨苄抗生素的平板培养基挑取阳性克隆,提取质粒DNA,测定其浓度;将质粒梯度稀释,并以此为模板,进行qPCR扩增;反应结束之后,进行标准曲线的制作;(3)污染源解析:从区域目标水域进行水样品采集,所有样品采集后进行编号并保存于冰盒中,在实验室中提取水样品中的基因组DNA;采用区域特异性引物进行qPCR扩增,结果经标准曲线公式进行计算,得出目标水域中各微生物的浓度值,根据各微生物的浓度值来解析区域目标水域的污染源。2.根据权利要求1所述的水体微生物污染来源定量解析方法,其中所述qPCR扩增条件:扩增体系为20ul:PremixExTaqTMII(2×)10ul;ddH2O,...

【专利技术属性】
技术研发人员:吴仁人周伟坚张杨汪光
申请(专利权)人:环境保护部华南环境科学研究所
类型:发明
国别省市:广东,44

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