【技术实现步骤摘要】
一种真核生物来源成分的分子鉴定方法及系统
本专利技术属于生物
,具体涉及一种真核生物来源成分的分子鉴定方法及系统。
技术介绍
现有鉴定真核生物来源成分的分子生物学方法几乎都是基于特异性核酸探针的方法。例如,基于特异性引物的聚合酶链式反应(PCR)扩增,或者特异性寡聚核苷酸探针(生物芯片)的方法。通过考察PCR反应扩增产物的电泳条带/测序结果,或是根据探针的杂交信号进行有限的成分来源判断。这些方法的缺陷是一个测试中能鉴定物种的分类阶元范围有限,通用性差,通量低并且假阴性率高(分子探针脱靶)。面对检材成分完全未知的情况下,往往无法选择合适的探针进行工作。
技术实现思路
技术问题是为真核生物来源成分的分子鉴定提供一种适用范围广、通用性强的分子鉴定方法及系统。有鉴于此,本专利技术实施例提供一种真核生物来源成分的分子鉴定方法及系统用以解决上述的技术问题。问题的解决方案:本专利技术提供了一种真核生物来源成分的分子鉴定方法,包括步骤:将检材DNA的全基因组鸟枪法测序序列作为输入数据进行输入;对输入数据进行特征计算;使用预存在数据库中的标准序列对输入数据特征进行查询,获得输入数 ...
【技术保护点】
一种真核生物来源成分的分子鉴定方法,其特征在于,包括步骤:将检材DNA的全基因组鸟枪法测序序列作为输入数据进行输入;对输入数据进行特征计算;使用预存在数据库中的标准序列特征对输入数据特征进行查询,获得输入数据特征同标准序列的比对结果;根据比对结果进行物种判定。
【技术特征摘要】
1.一种真核生物来源成分的分子鉴定方法,其特征在于,包括步骤:将检材DNA的全基因组鸟枪法测序序列作为输入数据进行输入;对输入数据进行特征计算;使用预存在数据库中的标准序列特征对输入数据特征进行查询,获得输入数据特征同标准序列的比对结果;根据比对结果进行物种判定。2.如权利要求1所说的分子鉴定方法,其特征在于,所述检材DNA的全基因组鸟枪法测序序列包括原始测序序列和序列拼装。3.如权利要求2所说的分子鉴定方法,其特征在于,所述输入数据是由高通量并行测序设备输出的。4.如权利要求1所说的分子鉴定方法,其特征在于,所述使用标准序列对输入数据特征进行查询,获得输入数据特征同标准序列的比对结果的步骤包括:将输入数据特征和数据库中标准序列的标准分子标记序列特征进行匹配、距离计算和打分排序;进行统计推断,得到输入数据中含有的分子标记序列特征的来源推断和相对含量;从输入数据中获取标记分子序列,并和标准分子标记序列进行对比,确认来源成分。5.如权利要求4所说的分子鉴定方法,其特征在于,所述根据比对结果进行物种判定的步骤包括:对来源成分进行定性和定量分析,输出物种判定结果。6.如权利要求4所说的分子鉴定方法,其特征在于,所述标准分子标记序列包括细胞器基因组中的序列如CO1基因序列、rbcl基因序列和matK基因序列中的一种或多种;所述标准分子标记序列特征包括使...
【专利技术属性】
技术研发人员:王俊宁,
申请(专利权)人:泽塔生物科技上海有限公司,
类型:发明
国别省市:上海,31
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