一种猪伪狂犬病毒变异毒株的PCR鉴别方法技术

技术编号:14966861 阅读:115 留言:0更新日期:2017-04-02 21:29
本发明专利技术涉及生物毒株鉴别技术领域,特别涉及一种猪伪狂犬病毒变异毒株的PCR鉴别方法,提取待鉴别病毒DNA,进行第一步扩增,扩增出两条条带的为变异株或HB98疫苗毒株,扩增出1条条带的为经典毒株;扩增出两条条带的病毒DNA再进行第二步扩增,扩增产物分子量大小为293bp的为变异株,扩增产物分子量大小为239bp的为HB98疫苗毒株。第一步PCR的敏感度可以达到2-20TCID50病毒量或0.5ng/ml质粒量,而第二步PCR敏感度达到50TCID50病毒量或者100ng/ml质粒量。该敏感度可以有效的检测出临床病料中是否有伪狂犬病毒感染,并区分出伪狂犬病毒经典毒株或者变异毒株感染,并且准确率高。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物毒株鉴别
,特别涉及一种猪伪狂犬病毒变异毒株的PCR鉴别方法
技术介绍
伪狂犬病毒(PseudorabiesVirus,PRV)是疱疹病毒科,α疱疹病毒亚科的双股DNA病毒,基因组在140kd左右,编码69个开放阅读框。该病毒主要引起母猪流产、死胎及呼吸系统症状,仔猪出现神经症状和腹泻,给养猪业造成了巨大的经济损失。目前,欧美洲很多国家通过免疫接种和净化技术已经根除该病。我国近十多年内通过采用强化免疫和净化技术,该病也得到有效控制。但是,2011年末,我国PRV疫苗免疫猪场再次暴发该病。全基因组分析结果也表明,此次新发的伪狂犬病病毒与之前的经典伪狂犬病毒属于不同的亚群,其抗原性发生了变化,变异毒株位于一个新的基因分支。因此建立PRV变异毒株和经典毒株鉴别方法十分必要。目前现有的检测伪狂犬病毒感染的PCR方法有很多,其中最常用的两种是国标法与伪狂犬gE基因检测法。国标法主要针对伪狂犬病毒gD基因,可以特异的扩增出220bp的片段。>因为gD基因是伪狂本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种猪伪狂犬病毒变异毒株的PCR鉴别方法,其特征在于提取待鉴别病毒DNA,使用引物1F‑C、1F‑V、1R进行第一步扩增,扩增出两条条带的为变异株或HB98疫苗毒株,扩增出1条条带的为经典毒株;扩增出两条条带的病毒DNA再使用引物2F和2R进行第二步扩增,扩增产物分子量大小为293bp的为变异株,扩增产物分子量大小为239bp的为HB98疫苗毒株;引物1F‑C、1F‑V、1R、2F和2R序列如下:1F‑C:5’‑GAGCCCGTCTCGGGGACGAC‑3’,1F‑V:5’‑GCTGCTCGAGGCGGACCACGTC‑3’,1R:5’‑CCGGTGCGCGTGCCTGTGG‑3’,2F: 5...

【技术特征摘要】
1.一种猪伪狂犬病毒变异毒株的PCR鉴别方法,其特征在于提取待鉴别病毒DNA,使用引物1F-C、1F-V、1R进行第一步扩增,扩增出两条条带的为变异株或HB98疫苗毒株,扩增出1条条带的为经典毒株;扩增出两条条带的病毒DNA再使用引物2F和2R进行第二步扩增,扩增产物分子量大小为293bp的为变异株,扩增产物分子量大小为239bp的为HB98疫苗毒株;
引物1F-C、1F-V、1R、2F和2R序列如下:
1F-C:5’-GAGCCCGTCTCGGGGACGAC-3’,
1F-V:5’-GCTGCTCGAGGCGGACCACGTC-3’,
1R:5’-CCGGTGCGCGTGCCTGTGG-3’,
2F:5’-GATGCGGTCACCGTCGGGTTT-3’,
2R:5’-CCGCCGCTCAGCCCCCATCGT-3’。
2.根据权利要求1所述的PCR鉴别方法,其特征在于第一步PCR反应体系:Taqmix12.5μl,0.1μlrTaq,蒸馏水1.5μl,DMSO2.5μl,10uM的上游引物1F-C、下游引物1F-V、鉴别引物1R分别为0.5μl、2μl、5μl,DNA模板1μl。
3.根据权利要求1或2所述的PCR...

【专利技术属性】
技术研发人员:姜平孙涛白娟王先炜李玉峰
申请(专利权)人:南京农业大学
类型:发明
国别省市:江苏;32

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