本发明专利技术提供一种对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定的方法和系统，该方法包括提取未知猪检材DNA，获得所述DNA包括12个常染色体STR基因座、以及性别决定基因座PigSTRAM在内共13个基因座的分型结果，所述12个常染色体STR基因座为SW240、PigSTR13E、PigSTR 15A、S0655、PigSTR 11B、PigSTR 14A、387A12F、PigSTR 4C、PigSTR 17A、PigSTR 5C、PigSTR 7B和S0386；根据未知检材13个基因座的基因型进行个体识别和亲权鉴定。本发明专利技术还提供了对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定的系统。本发明专利技术的方案能实现对未知猪检材的个体识别和亲权鉴定。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种个体识别和亲权鉴定的方法和系统，尤其涉及一种对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定的方法和系统。
技术介绍
微卫星标记(microsatellite)，又称短串联重复序列(short tandem repeats,STRs)或简单重复序列(simple sequence repeats),是指重复单位长度为2-6个碱基的重复序列。由于重复单位的重复次数在个体间呈高度变异性并且数量丰富，因此STR是目前法医DNA分析中最常用的一类遗传标记。法医DNA分析技术除了对人类进行DNA分析外，还可对动物进行种属鉴定、个体识别及亲权关系鉴定。猪是我国农村常见的家畜，随着人们对亲子鉴定技术了解的加深，越来越多的民事及刑事案件中要求对猪进行亲子鉴定和个体识别，另外养猪业也是我国畜牧业和农村支柱产业的重要组成部分，种属分析在猪育种方面也具有重要的作用。专利CN102154280A中公开了一种猪微卫星标记的复合扩增的方法及其专用引物。其选取了10个二核苷酸重复序列，分别为：SW240，SW951，SW857，S0155，S0386，SW902，S0255，S0101，S0227，S0355，构建了十重复合扩增体系，为四色荧光检测系统。但是，上述位点均为二核苷酸重复序列，分型结果中stutter峰比较严重，并且部分位点遗传多态性较差，并且存在累积个体识别率较差的问题。如何提供一种可解决上述问题的检测方法和系统成为有待解决的问题。
技术实现思路
本专利技术提供了一种对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定的方法，能获得未知猪检材包括12个常染色体STR基因座、以及性别决定基因座PigSTRAM在内共13个基因座的分型结果，从而实现对未知猪检材的个体识别和亲权鉴定。本专利技术还提供一种对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定的系统，通过该系统可以实现对未知来源个体针对上述13个基因座的准确分型，从而对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定。本专利技术还提供了一种复合检测体系，所述检测体系能准确获得未知猪检材包括12个常染色体STR基因座和性别决定基因座PigSTRAM在内共13个基因座的分型结果。本专利技术还提供了一种检测试剂盒，包括所述的复合检测体系。本专利技术提供的一种对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定的方法，该方法包括：1)提取未知猪检材的DNA；2)获得所述DNA包括12个常染色体STR基因座、以及性别决定基因座PigSTRAM在内共13个基因座的分型结果，所述12个常染色体STR基因座为SW240、PigSTR13E、PigSTR 15A、S0655、PigSTR 11B、PigSTR 14A、387A12F、PigSTR 4C、PigSTR 17A、PigSTR 5C、PigSTR 7B和S0386；3)根据未知猪检材13个基因座的基因型进行个体识别和亲权鉴定。在本专利技术的方案中，所述13个基因座是申请人通过对大量猪个体的生存环境、种族起源等进行综合分析获得的。所述未知猪检材可以为来自猪的血液、组织等样本，这些样本的个体来源未知。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述2)包括采用与所述13个基因座一一对应的13对扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物的步骤；所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.26的核苷酸序列。在本专利技术的另一个具体实施方式中，其中2)还包括在获得扩增产物后，使用遗传分析仪分析该扩增产物，以获得所述13个基因座的基因型的步骤。在本专利技术的方案中，所述遗传分析仪可以是本领域技术人员常规使用的遗传分析仪，例如ABI3130或ABI3500型遗传分析仪，通过ID-X软件或其他GeneMapper软件等分析该PCR扩增产物中所述13个基因座的基因型。本专利技术提供的一种对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定的系统，所述系统包括DNA提取体系，复合检测体系，以及推断体系；所述DNA提取体系用于提取未知猪检材的DNA；所述复合检测体系用于获得所述DNA包括12个常染色体STR基因座、以及性别决定基因座PigSTRAM在内共13个基因座的分型结果，所述12个常染色体STR基因座为SW240、PigSTR13E、PigSTR 15A、S0655、PigSTR11B、PigSTR 14A、387A12F、PigSTR 4C、PigSTR 17A、PigSTR 5C、PigSTR7B和S0386；所述推断体系用于根据未知猪检材13个基因座的基因型进行个体识别和亲权鉴定。在本专利技术的一个具体实施方式中，所述复合检测体系用于采用与所述13个基因座一一对应的13对扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物，所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.26的核苷酸序列。更进一步的，所述复合检测体系还用于在获得扩增产物后，使用遗传分析仪分析该扩增产物，以获得所述13个基因座的基因型。更进一步的，所述遗传分析仪利用针对各基因座的等位基因的分型标准物来确定未知猪检材DNA中各基因座的基因型。本专利技术提供的一种复合检测体系，所述体系包括未知猪检材DNA，13个基因座，以及扩增引物，所述复合检测体系用于获得所述DNA包括12个常染色体STR基因座、以及性别决定基因座PigSTRAM在内共13个基因座的分型结果，所述12个常染色体STR基因座为SW240、PigSTR13E、PigSTR 15A、S0655、PigSTR11B、PigSTR 14A、387A12F、PigSTR 4C、PigSTR 17A、PigSTR 5C、PigSTR7B和S0386；所述扩增引物由与所述13个基因座一一对应的13对扩增引物组成，所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.26的核苷酸序列。在本专利技术的方案中，所述DNA聚合酶可以是Fast Start DNA聚合酶、TaqDNA聚合酶、Hotstart DNA聚合酶中的一种或多种。本专利技术还提供了一种检测试剂盒，包括所述的复合检测体系。在本专利技术的方案中，本专利技术利用所述复合检测体系进行13个基因座的分型的方法，包括：1)将提取的未知猪检材DNA作为模板；2)使用所述扩增引物对作为模板的未知猪检材DNA进行多重PCR扩增反应以得到扩增产物；3)将所述扩增产物利用遗传分析仪进行分析，以获得13个基因座的分型结果。在本专利技术的方案中，所述13个基因座信息如表1所示：表1本专利技术提供的优选扩增引物序列如下。所述13对扩增引物及其相对应的基因座如下表2所示，PCRU代表上游引物，PCRL代表下游引物；表2本专利技术方案具有以下的优点：1、本专利技术的检测方法和检测系统采用特定的STR基因座组合中二核苷酸重复序列2个，四核苷酸重复序列10个，性别决定基因座1个，减少了现有检测系统的检测结果中存在严重的stutter峰的问题。2、本专利技术的检测方法和检测系统采用特定组合的13个基因座，解决了现有检测系统中遗传多态性差及累积个体识别率和累积非父排除率不高的问题。3、本专利技术的方案可以通过使用荧光标记，利用常规的遗传分析仪，根据所要扩增的基因的分子量和荧光颜色的不同，获得直观的检测结果，并且该结果与现有检测系统相比，准确性为100％。4、本专利技术提供的方案能有效从基因水平实现对未知猪个体来源的推断，为其个体识别及亲权关本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定的方法，其特征在于，该方法包括：1)提取未知猪检材的DNA；2)获得所述DNA包括12个常染色体STR基因座、以及性别决定基因座PigSTRAM在内共13个基因座的分型结果，所述12个常染色体STR基因座为SW240、PigSTR13E、PigSTR 15A、S0655、PigSTR 11B、PigSTR 14A、387A12F、PigSTR 4C、PigSTR 17A、PigSTR 5C、PigSTR 7B和S0386；3)根据未知猪检材13个基因座的基因型进行个体识别和亲权鉴定。
【技术特征摘要】
2016.09.27 CN 20161085668781.一种对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定的方法，其特征在于，该方法包括：1)提取未知猪检材的DNA；2)获得所述DNA包括12个常染色体STR基因座、以及性别决定基因座PigSTRAM在内共13个基因座的分型结果，所述12个常染色体STR基因座为SW240、PigSTR13E、PigSTR 15A、S0655、PigSTR 11B、PigSTR 14A、387A12F、PigSTR 4C、PigSTR 17A、PigSTR 5C、PigSTR 7B和S0386；3)根据未知猪检材13个基因座的基因型进行个体识别和亲权鉴定。2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述2)包括采用与所述13个基因座一一对应的13对扩增引物对其进行扩增以获得扩增产物的步骤；所述扩增引物为序列表中SEQ ID No.1至SEQ ID No.26的核苷酸序列。3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，其中2)还包括在获得扩增产物后，使用遗传分析仪分析该扩增产物，以获得所述13个基因座的基因型的步骤。4.一种对未知猪检材进行个体识别和亲权鉴定的系统，其特征在于，所述系统包括DNA提取体系，复合检测体系，以及推断体系；所述DNA提取体系用于提取未知猪检材的DNA；所述复合检测体系用于获得所述DNA包括12个常染色体STR基因座、以及性别决定基因座PigSTRAM在内共13个基因座的分型结果，所述12个常染色体STR基因座为SW240、PigSTR13E、PigSTR 15A、S0655、PigS...
【专利技术属性】
技术研发人员：马温华，张颖，孙启凡，莫晓婷，张建，白雪，叶健，赵兴春，
申请(专利权)人：公安部物证鉴定中心，
类型：发明
国别省市：北京;11
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