The invention discloses a gene chip for the specific detection of Bacillus coli, which belongs to the technical field of microbial gene detection. According to the reported 16SDNA sequence and the rpoB gene sequence of Bacillus subtilis, the Bacillus subtilis rpoB and 16S specific gene fragments were selected as the target sequences for detection. The corresponding multiplex PCR amplification primer pairs, probes and detection chips were designed. The invention can be used for qualitative and quantitative detection of Bacillus cereus in a short time through the gene detection chip, and can realize the classification and identification of Bacillus species on the level of \seed\. The invention provides a powerful tool for tracing the colonization and reproduction of the bacillus in fertilizer or soil.
【技术实现步骤摘要】
:本专利技术涉及微生物DNA检测技术,具体属于巨大芽孢杆菌DNA检测芯片及其制备,以及在微生物肥料及土壤微生物检测中的应用。技术背景:巨大芽孢杆菌这种功能微生物经常被用来制作生物有机肥以及被用于土壤中来调控微生物区系结构,实现作物的抗病、促生长、提高品质等。但如何定性定量跟踪这种菌在肥料、土壤中的定殖和繁殖行为一直困扰着相关工作者,常规的有效活菌数的检测已经无法满足科研需求和生产需求。通过基因芯片技术对常见的功能菌进行定性定量具有很强的应用价值。目前,传统的微生物检测方法主要为培养法,这种方法检测周期长且不能对亲缘关系近的巨大芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、苏云金芽孢杆菌进行分类鉴定。近些年类似16S DNA的条形码序列也被经常用于微生物的鉴定上,但是16S DNA在种间的差异性非常小,因此仅靠16S DNA进行分类鉴定难免出现特异性差的问题。基因芯片是一种新型DNA识别技术,利用芯片高通量的优势,可以在一张芯片上同时对多个物种的多个DNA条形码进行检测,不仅极大地提高了鉴定的准确性,而且还可以区分微生物种与种之间的微小DNA差异,即基因芯片可以在“种”的水平上对同属不同种的微生物进行准确鉴定。
技术实现思路
:本专利技术的目的在于提供一种巨大芽孢杆菌特异性检测的基因芯片及其制备方法和应用。为实现上述专利技术目的,本专利技术提供如下技术方案:一种巨大芽孢杆菌rpoB特异基因片段,其核苷酸序列为:SEQ ID NO:1。一种巨大芽孢杆菌16S特异基因片段,其核苷酸序列为:SEQ ID NO:2。一种巨大芽孢杆菌rpoB特异基因片段的多重PCR扩增引物对,其核苷酸序 ...
【技术保护点】
一种巨大芽孢杆菌rpoB特异基因片段,其核苷酸序列为:SEQ ID NO:1。
【技术特征摘要】
1.一种巨大芽孢杆菌rpoB特异基因片段,其核苷酸序列为:SEQ ID NO:1。2.一种巨大芽孢杆菌16S特异基因片段,其核苷酸序列为:SEQ ID NO:2。3.一种巨大芽孢杆菌rpoB特异基因片段的多重PCR扩增引物对,其核苷酸序列为:引物1:5’FAM—GTGTAATTTCACGTATTTTACCG—3’引物2:5’—GCTCATGGTCCTCTTCTGAGTCC—3’。4.一种巨大芽孢杆菌16S特异基因片段的多重PCR扩增引物对,其核苷酸序列为:引物1:5’FAM—GATGAACGCTGGCGGCGTGCC—3’引物2:5’—TAGTTAGCCGTGGCTTTCTGG—3’。5.一种巨大芽孢杆菌rpoB特异基因片段的检测探针,其核苷...
【专利技术属性】
技术研发人员:任振兴,王俊红,王梦亮,刘滇生,
申请(专利权)人:山西大学,
类型:发明
国别省市:山西;14
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