一组MSI生物标志物制造技术

本发明专利技术涉及生物技术领域，特别是涉及一组MSI生物标志物及其相关试剂盒。本发明专利技术提供一组MSI生物标志物及其相关试剂盒，所述MSI生物标志物包括：NR21、BAT25、BAT26、NR27、NR24、NR22、CAT25、MONO27、D17S250、D5S436、D2S123、AMEL、CS1PO、D18S51和TPOX。本发明专利技术所提供的检测试剂盒能够有效覆盖各MSI的检测位点，通过和现行数据库对比分析，能够有效提高判断效率，且能够有效提高鉴别样本来源同一性的能力，避免试验中出现结果混淆。

A set of MSI biomarkers

The invention relates to the technical field of biotechnology, in particular to a group of MSI biomarkers and related kits. The present invention provides a set of MSI biomarkers and the related kit, the MSI biomarkers include: NR21, BAT25, BAT26, NR27, NR24, NR22, CAT25, MONO27, D17S250, D5S436, D2S123, AMEL, CS1PO, D18S51 and TPOX. Site detection kit provided by the invention can effectively cover the MSI, through the comparison and analysis of current database, can effectively improve the efficiency of judgment, and can effectively improve the identification ability of the same sample source, to avoid confusion among the test results.

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物
，特别是涉及一组MSI生物标志物及其相关试剂盒。
技术介绍
微卫星不稳定(microsatelliteinstability，MSI)是指与正常组织相比，在肿瘤中某一微卫星由于重复单位的插入或缺失而造成的微卫星长度的任何改变，出现新的微卫星等位基因现象。出现新的微卫星等位基因现象的机制包括DNA多聚酶的滑动导致重复序列中1个或多个碱基的错配以及MS同源重组导致碱基对的丢失和插入。MSI状况的评估对于确定身源鉴定中的计算方法选用有一定参考意义。另外，检测肿瘤组织的MSI状况可以评估肿瘤组织的遗传稳定性特点，作为后续处理的参考依据。1993年，Altonen等首次发现在HNPCC细胞中存在高频率的MSI。1997年NCI制定Bethesda指南推荐检测BAT-25、BAT-26、D5S346、D2S123和D17S250等五个位点来评估MSI状况。2002年NCI依据研究进展推出改进版Bethesda指南，推荐检测的位点BAT-25、BAT-26、NR-21、NR-24和MONO-27来评估MSI状况。近年研究中发现，NR22、NR27和CAT25对判断MSI状况有参考价值。
技术实现思路
鉴于以上所述现有技术的缺点，本专利技术的目的在于提供一组MSI生物标志物及其相关试剂盒，用于解决现有技术中的问题。为实现上述目的及其他相关目的，本专利技术第一方面提供一组MSI生物标志物，所述MSI生物标志物包括：NR21、BAT25、BAT26、NR27、NR24、NR22、CAT25、MONO27、D17S250、D5S436、D2S123、AMEL、CS1PO、D18S51和TPOX。具体的，所述NR21、BAT25、BAT26、NR27、NR24、NR22、CAT25和MONO27为单碱基重复多态性位点；所述D17S250、D5S436和D2S123为双碱基重复多态性位点；所述AMEL为INDEL位点；所述CS1PO、D18S51和TPOX为STR位点。本专利技术第二方面提供所述MSI生物标志物在制备或筛选MSI诊断药物中的用途。优选的，所述MSI为人MSI。本专利技术第三方面提供一种MSI诊断试剂盒，包括针对NR21的特异性引物、针对BAT25的特异性引物、针对BAT26的特异性引物、针对NR27的特异性引物、针对NR24的特异性引物、针对NR22的特异性引物、针对CAT25的特异性引物、针对MONO27的特异性引物、针对D17S250的特异性引物、针对D5S436的特异性引物、针对D2S123的特异性引物、针对AMEL的特异性引物、针对CS1PO的特异性引物、针对D18S51的特异性引物、针对TPOX的特异性引物。具体的，所述针对NR21的特异性引物包括如SEQIDNo：1所示的前引物，序列如SEQIDNo：2所示的后引物。具体的，所述针对BAT25的特异性引物包括如SEQIDNo：3所示的前引物，序列如SEQIDNo：4所示的后引物。具体的，所述针对BAT26的特异性引物包括如SEQIDNo：5所示的前引物，序列如SEQIDNo：6所示的后引物。具体的，所述针对NR27的特异性引物包括如SEQIDNo：7所示的前引物，序列如SEQIDNo：8所示的后引物。具体的，所述针对NR24的特异性引物包括如SEQIDNo：9所示的前引物，序列如SEQIDNo：10所示的后引物。具体的，所述针对NR22的特异性引物包括如SEQIDNo：11所示的前引物，序列如SEQIDNo：12所示的后引物。具体的，所述针对CAT25的特异性引物包括如SEQIDNo：13所示的前引物，序列如SEQIDNo：14所示的后引物。具体的，所述针对MONO27的特异性引物包括如SEQIDNo：15所示的前引物，序列如SEQIDNo：16所示的后引物。具体的，所述针对D17S250的特异性引物包括如SEQIDNo：17所示的前引物，序列如SEQIDNo：18所示的后引物。具体的，所述针对D5S436的特异性引物包括如SEQIDNo：19所示的前引物，序列如SEQIDNo：20所示的后引物。具体的，所述针对D2S123的特异性引物包括如SEQIDNo：21所示的前引物，序列如SEQIDNo：22所示的后引物。具体的，所述针对AMEL的特异性引物包括如SEQIDNo：23所示的前引物，序列如SEQIDNo：24所示的后引物。具体的，所述针对CS1PO的特异性引物包括如SEQIDNo：25所示的前引物，序列如SEQIDNo：26所示的后引物。具体的，所述针对D18S51的特异性引物包括如SEQIDNo：27所示的前引物，序列如SEQIDNo：28所示的后引物。具体的，所述针对TPOX的特异性引物包括如SEQIDNo：29所示的前引物，序列如SEQIDNo：30所示的后引物。所述各特异性引物在一个体系内可以同时正常扩增，相互之间无干扰峰，可以在一个反应使用。在本专利技术一具体实施方式中，所述各特异性引物的浓度范围可以为0.05μM到1μM。具体的，每组特异性引物中，至少有一条引物上标记有荧光标记物。更具体的，所述荧光标记物选自FAM、HEX、TAMRA中的一种或多种的组合。如上所述，本专利技术所提供的检测试剂盒能够有效覆盖各MSI的检测位点，通过和现行数据库对比分析，能够有效提高判断效率，且能够有效提高鉴别样本来源同一性的能力，避免试验中出现结果混淆。附图说明图1显示为本专利技术实施例3中人9947ADNA标准品MSI检测结果示意图。三个通道左侧数值为相对荧光强度，上方数值为产物长度(bp)，通道内标注位点名称。具体实施方式以下通过特定的具体实例说明本专利技术的实施方式，本领域技术人员可由本说明书所揭露的内容轻易地了解本专利技术的其他优点与功效。本专利技术还可以通过另外不同的具体实施方式加以实施或应用，本说明书中的各项细节也可以基于不同观点与应用，在没有背离本专利技术的精神下进行各种修饰或改变。在进一步描述本专利技术具体实施方式之前，应理解，本专利技术的保护范围不局限于下述特定的具体实施方案；还应当理解，本专利技术实施例中使用的术语是为了描述特定的具体实施方案，而不是为了限制本专利技术的保护范围；在本专利技术说明书和权利要求书中，除非文中另外明确指出，单数形式“一个”、“一”和“这个”包括复数形式。当实施例给出数值范围时，应理解，除非本专利技术另有说明，每个数值范围的两个端点以及两个端点之间任何一个数值均可选用。除非另外定义，本专利技术本文档来自技高网...

【技术保护点】
一组MSI生物标志物，所述MSI生物标志物包括：NR21、BAT25、BAT26、NR27、NR24、NR22、CAT25、MONO27、D17S250、D5S436、D2S123、AMEL、CS1PO、D18S51和TPOX。

【技术特征摘要】
1.一组MSI生物标志物，所述MSI生物标志物包括：NR21、BAT25、BAT26、NR27、NR24、
NR22、CAT25、MONO27、D17S250、D5S436、D2S123、AMEL、CS1PO、D18S51和
TPOX。
2.如权利要求1所述的MSI生物标志物，其特征在于，所述MSI为人MSI。
3.如权利要求1-2任一权利要求所述的MSI生物标志物在制备或筛选MSI诊断药物中的用
途。
4.一种MSI诊断试剂盒，包括针对NR21的特异性引物、针对BAT25的特异性引物、针对
BAT26的特异性引物、针对NR27的特异性引物、针对NR24的特异性引物、针对NR22
的特异性引物、针对CAT25的特异性引物、针对MONO27的特异性引物、针对D17S250
的特异性引物、针对D5S436的特异性引物、针对D2S123的特异性引物、针对AMEL的
特异性引物、针对CS1PO的特异性引物、针对D18S51的特异性引物、针对TPOX的特
异性引物。
5.如权利要求4所述的MSI诊断试剂盒，其特征在于，所述针对NR21的特异性引物包括
如SEQIDNo：1所示的前引物，序列如SEQIDNo：2所示的后引物；
和/或，所述针对BAT25的特异性引物包括如SEQIDNo：3所示的前引物，序列如SEQ
IDNo：4所示的后引物；
和/或，所述针对BAT26的特异性引物包括如SEQIDNo：5所示的前引物，序列如SEQ
IDNo：6所示的后引物；
和/或，所述针对NR27的特异性引物包括如SEQIDNo：7所示的前引物，序列如SEQID
No：8所示的后引物；
和/或，所述针对NR24的特异性引物包括如SEQIDNo：9所示的前引物，序列如SEQID
No：10所示的后引物...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈金中，王鸿艳，郭凌晨，
申请(专利权)人：上海允晟医学检验所有限公司，
类型：发明
国别省市：上海;31