一种SLCO1B1 521T>C的检测引物及其组合物制造技术

技术编号:12731438 阅读:58 留言:0更新日期:2016-01-20 15:06
本发明专利技术属于生物检测技术领域,具体涉及一种SLCO1B1 521T>C的检测引物,所述检测引物如下:正向外侧引物F3T:SEQ ID NO:1;反向外侧引物B3T:SEQ ID NO:2;正向内侧引物FIPT:SEQ ID NO:3;反向内侧引物BIPT:SEQ ID NO:4;正向外侧引物F3C:SEQ ID NO:5;反向外侧引物B3C:SEQ ID NO:6;正向内侧引物FIPC:SEQ ID NO:7;反向内侧引物BIPC:SEQ ID NO:8。本发明专利技术步骤简单、扩增反应快速、高效、特异性高、鉴定简便,使该技术有着更广阔的应用前景。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物检测
,具体设及一种化C01B1 521T乂的检测引物及其 组合物。
技术介绍
由SLC01B1基因编码的有机阴离子转运多肤1B1 (0ATP1B1,又称0ATP-C、0ATP2或 LST1),在肝细胞摄取和清除内源性和外源性物质如胆汁酸、非结合型胆红素、甲状腺素、他 汀类药物、瑞格列奈、依那普利拉、替莫普利、鄉沙坦、奥美沙坦、甲氨蝶岭和伊立替康活性 代谢产物SN-38等中发挥重要作用。该基因第5外显子521T乂(rs4149056,Vall74Ala) 多态性是亚洲人群中的主要遗传变异,等位基因频率为10~15%,携带521C等位基因的 SLC01B1所编码的0ATP1B1会显著降低其对底物的摄取能力,使他汀类药物如普伐他汀、阿 托伐他汀和罗苏伐他汀等的血药浓度升高。他汀类药物的严重不良反应包括肝功能下降和 横纹肌溶解症等。因此,携带521C等位基因的患者应用辛伐他汀、西立伐他汀时肌病的发 生风险显著增加。为降低他汀类药物严重不良反应的发生风险,《药物代谢酶和药物作用祀 点基因检测技术指南(试行)》中也建议"临床上根据化C01B1基因型选择他汀类药物进行 治疗。" 现阶段用来检测rs4149056位点的方法有很多,主要集中于PCR-直接测序法、 化qman巧光PCR法、HRM法、核酸杂交法等等,运些方法虽然都能W相对较短的时间准确得 检测rs4149056,但是都需要依赖比较昂贵的仪器和/或试剂,其中测序法操作耗时长且 灵敏度低;高分辨率溶解曲线法(HRM法)对设备要求较高,临床推广存在一定的困难;传 统巧光定量PCR法在临床上应用较为广泛,但该方法对样本数量W及多态性分布有一定要 求,样本量少时不能准确检测。CN102021239A公开了一种化C01B1基因SNP检测特异性引 物和液相忍片,然而运种方法不仅操作繁琐,检测耗时较长,还需要昂贵的检测设备。因此 运些方法都比较难W广泛推广开来,尤其是在偏远的经济欠发达地区。然而,从目前来看, 运种检测需求又非常巨大,因此,有必要寻求一种检测方法,既能做到费用低廉,又能实现 快速准确得检测。 环介导的等溫扩增(LAM巧技术是日本科学家于2000年提出的一种等溫扩增技 术,其主要特点是针对祀基因的6个区域设计4条特异引物,在链置换DNA聚合酶度StDNA polymerase)的作用下进行恒溫扩增,仅需15-90分钟即可产生109-10"数量级的产物。具 有敏感性高、特异性好、操作简便、成本低廉且结果易于判定的优点。
技术实现思路
本专利技术为了克服上述方法的缺陷,提供一种化C01B1 521T乂的检测引物及其组 合物,具有敏感性高、特异性好和操作简便等优点。 为达到此专利技术的目的,本专利技术采用W下技术方案: 第一方面,本专利技术提供一种化C01B1基因的检测引物组,所述检测引物组如下: 正向外侧引物F3T:沈QIDNO: 1 :TAAGTAGAATAATTAAGAGTTTACAAGT; 反向外侧引物B3T:沈QIDN0:2 :CCTTCTTTAGCGAAATCATCAA; 正向内侧引物FIPT:SEQIDN0:3:GACCCAGATTCCTTTAMCAACCTATGTGCTAAAATTMT GTTTAAAATGAAACACTC; 反向内侧引物BIPT:SEQIDN0:4:TGGTCATGGGTAATATGCTTCGTGGTMGAAAGCCCCMT GGTACT; 正向外侧引物F3C:沈QIDN0:5 :AGTAGTTAAATTTGTAATAGAAATGCTA; 反向外侧引物B3C:沈QIDN0:6 :CAATTTAATATTTTGTGTACATTACCTAA; 正向内侧引物FIPC:SEQIDN0:7:GCCTATATCCACATGTATGACCCAGATTAAAATGAAACAC TCTCTTATCTACATAGG; 反向内侧引物BIPC:SEQIDN0:8:CTTCGTGGAATAGGGGAGACTCAAGAAGAATGTCCTTCTT TAGCGo 优选地,所述SEQIDN0:l-4所示的序列是用于检测rs4149056 位点的T等位基 因。 优选地,所述SEQIDNO:5-8所示的序列是用于检测rs4149056位点的C等位基 因。[001引本专利技术中,4条引物的外侧引物记为正向外侧引物F3和反向外侧引物B3,内侧引 物记为正向内侧引物FIP和反向内侧引物BIP,其中FIP包含了Flc和F2,BIP包含了Blc 和B2,上述引物均由在线软件PrimerE邱lorerV4设计。本专利技术在普通LAMP的基础上,W 特异性要求最严格的Flc或Blc的5'端针对rs4149056位点设计等位基因特异引物,分别 检测rs4149056的C等位基因和rs4149056的T等位基因。通过分别在BIPT和FIPC的5' 端第Ξ位引进额外突变,进一步降低非特异性扩增的可能性。 第二方面,本专利技术提供一种检测化C01B1基因的反应体系,所述反应体系包括第 一方面所述的引物组,反应缓冲液,dNTPs,径基糞酪蓝,甜菜碱,BstDNA聚合酶,待检样品 基因组DNA和去离子水。 优选地,所述反应缓冲液包括Tris-肥1,KC1,(畑4)25〇4,Μ拆〇4和Tween-20。 优选地,所述Tris-肥1的浓度为10-30mM,例如可W是10mM、llmM、12mM、13mM、 15mM、16mM、18mM、20mM、22mM、23mM、25mM、26mM、28mM或 30mM,优选为 15-25mM,进一步优选 为 20mM。 优选地,所述KCl的浓度为 10-60mM,例如可W是 10mM、llmM、12mM、15mM、18mM、 20mM、23mM、25mM、30mM、35mM、40mM、45mM、50mM、51mM、52mM、53mM、54mM、55mM或 60mM,优选 为50-55mM,进一步优选为50mM。[002引 优选地,所述(畑4)2504的浓度为5-13mM,例如可W是5mM、6mM、7mM、8mM、9mM、 或 13mM,优选为 8-12mM,进一步优选为lOmM。 优选地,所述Μ拆〇4的浓度为2-8mM,例如可W是2mM、3mM、4mM、5mM、6mM、7mM或 8mM,优选为2-6mM,进一步优选为4mM。[002引优选地,所述Tween-20的体积分数为0. 1-1%,例如可W是0. !%、0. 2%、0. 3%、 0. 4%、0. 5%、0. 6%、0. 7%、0. 8%、0. 9%或 1%,优选为 0. 1%。优选地,所述dNTPs的浓度为l-2mM,例如可W是 2mM、l. 3mM、l. 4mM、 1. 5mM、1. 6mM、1. 7mM、1. 8mM、1. 9mM或 2mM,优选为 1. 2-1. 8mM,进一步优选为 1. 4mM。 优选地,所述径基糞酪蓝的浓度为108-130μΜ,例如可W是108μΜ、109μΜ、 110μΜ、111μΜ、112μΜ、115μΜ、116μΜ、118μΜ、120μΜ、122μΜ、125μΜ、126μΜ、128μΜ 或130μΜ,优选为115-123μΜ,进一步优选为120本文档来自技高网
...

【技术保护点】
一种SLCO1B1521T>C的检测引物,其特征在于,所述检测引物组如下:正向外侧引物F3T:SEQ ID NO:1;反向外侧引物B3T:SEQ ID NO:2;正向内侧引物FIPT:SEQ ID NO:3;反向内侧引物BIPT:SEQ ID NO:4;正向外侧引物F3C:SEQ ID NO:5;反向外侧引物B3C:SEQ ID NO:6;正向内侧引物FIPC:SEQ ID NO:7;反向内侧引物BIPC:SEQ ID NO:8。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:汪大为
申请(专利权)人:北京晋祺生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:北京;11

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1