本发明公开了人工智能和生物信息学技术领域的基于多模态图神经网络的药物发现方法、系统和存储介质，包括以下步骤：步骤S1：分子图编码：将药物分子的SMILES字符串转换为图结构表示，通过图卷积神经网络提取分子的拓扑结构特征；步骤S2：蛋白质...