一种抑郁症用药相关基因的检测方法及试剂盒技术

本发明专利技术公开了一种抑郁症用药相关基因的检测方法及试剂盒，其中，所述检测方法包括以下步骤：S1、根据抑郁症药物的特征，确定影响药效的作用靶点的基因；S2、根据确定的基因选择对应的引物组；S3、提取检测对象的生物样本；S4、将引物组以及提取的生物样本置于含有PGx‑PCR酶的PCR反应体系中进行扩增；S5、将生物样本、扩增产物进行纯化处理后，进行二代测序分析。本发明专利技术可针对多个靶序列在较短时间完成文库构建，仅需要对PCR产物进行简单纯化，就可以进行测序分析。有效的解决了在临床应用中，需要对样本进行步骤繁冗且耗时长的处理的问题，进而为抑郁症用药进行指导。

【技术实现步骤摘要】
一种抑郁症用药相关基因的检测方法及试剂盒
本专利技术涉及一种基因检测方法，尤其涉及一种抑郁症用药相关基因的检测方法及试剂盒。
技术介绍
抑郁症又称抑郁障碍，是常见的精神疾病之一，是由各种原因引起的以抑郁情绪为核心症状的一组心境障碍的疾病，主要表现为情绪的持久低落、意志活动减退、思维迟缓、认知功能损失、睡眠障碍等，严重者伴有反复自杀观念和行为，具有较高的发病率和复发率。每次发作持续至少2周以上、长者甚或数年，多数病例有反复发作的倾向。据WHO统计，全球目前约有3.22亿抑郁症患者，患病率为4.4％，有报到称，在我国抑郁症发病率达到了6.1％。有研究表明，抑郁症患者的亲属患病率比普通家庭高10～30倍，且血缘关系越近，患病率越高，由此可见，抑郁症与遗传有密切关联。在抑郁症患者中，仅有30％～45％的患者在抗抑郁药物治疗下可以获得临床症状的缓解，另有10％的患者对任何种类的抗抑郁药物治疗均无效。导致药物治疗出现巨大个体差异的原因，除了传统上的性别、年龄、病理、生理、身高、体重、依从性等方面外，遗传因素的差异性也是重点关注的因素之一，其中药物代谢酶、转运蛋白、受体和其他药物作用靶点的基因多态性是引起药物效应和毒性个体差异的重要原因。药物基因组学是一门研究个体遗传多态性导致药物应答差异的学科。近年来随着人类基因组学的发展，药物基因组学的发展也突飞猛进，成为了指导临床个性化用药、评估药物严重不良反应风险的重要工具。然而，现有技术中基于药物基因组学的基因检测方法还存在操作复杂、成本高、不利于推广应用的问题。
技术实现思路
鉴于上述现有技术中存在的缺陷，本专利技术的目的是一种抑郁症用药相关基因的检测方法及试剂盒。为了实现上述目的，本专利技术采用了如下技术方案：一种抑郁症用药相关基因的检测方法，其包括以下步骤：S1、根据抑郁症药物的特征，确定影响药效的作用靶点的基因；S2、根据确定的基因选择对应的引物组；S3、提取检测对象的生物样本；S4、将引物组以及提取的生物样本置于含有PGx-PCR酶的PCR反应体系中进行扩增；S5、将生物样本、扩增产物进行纯化处理后，进行二代测序分析。优选地，所述作用靶点的基因包括：CYP2D6、CYP2C19、CYP1A2、CYP3A4、ABCB1、HTR2A、COMT、CYP2B6、HTR1A、MC4R、SLC6A4、ADCY9、ADRA2A、ANKK1、EPM2A、FKBP5、GADL1、GNB3、GRIK4、UGT2B15。优选地，所述作用靶点为所列各基因上的共79个SNP位点。优选地，所述79个SNP位点的信息如下表1所示：表1。优选地，所述引物组包括：ABCB1-1-F、ABCB1-1-R、ABCB1-2-F、ABCB1-2-R、ADCY9-F、ADCY9-R、ADRA2A-F、ADRA2A-R、ANKK1-F、ANKK1-R、COMT-1-F、COMT-1-R、COMT-2-F、COMT-2-R、CYP1A2-1-F、CYP1A2-1-R、CYP1A2-2-F、CYP1A2-2-R、CYP1A2-3-F、CYP1A2-3-R、CYP1A2-4-F、CYP1A2-4-R、CYP1A2-5-F、CYP1A2-5-R、CYP1A2-6-F、CYP1A2-6-R、CYP1A2-7-F、CYP1A2-7-R、CYP1A2-8-F、CYP1A2-8-R、CYP2B6-1-F、CYP2B6-1-R、CYP2B6-2-F、CYP2B6-2-R、CYP2C19-1-F、CYP2C19-1-R、CYP2C19-2-F、CYP2C19-2-R、CYP2C19-3-F、CYP2C19-3-R、CYP2C19-4-F、CYP2C19-4-R、CYP2C19-5-F、CYP2C19-5-R、CYP2C19-6-F、CYP2C19-6-R、CYP2C19-7-F、CYP2C19-7-R、CYP2D6-1-F、CYP2D6-1-R、CYP2D6-2-F、CYP2D6-2-R、CYP2D6-3-F、CYP2D6-3-R、CYP2D6-4-F、CYP2D6-4-R、CYP2D6-5-F、CYP2D6-5-R、CYP2D6-6-F、CYP2D6-6-R、CYP2D6-7-F、CYP2D6-7-R、CYP2D6-8-F、CYP2D6-8-R、CYP2D6-9-F、CYP2D6-9-R、CYP2D6-10-F、CYP2D6-10-R、CYP2D6-11-F、CYP2D6-11-R、CYP2D6-12-F、CYP2D6-12-R、CYP3A4-1-F、CYP3A4-1-R、CYP3A4-2-F、CYP3A4-2-R、CYP3A4-3-F、CYP3A4-3-R、CYP3A4-4-F、CYP3A4-4-R、CYP3A4-5-F、CYP3A4-5-R、CYP3A4-6-F、CYP3A4-6-R、EPM2A-F、EPM2A-R、FKBP5-F、FKBP5-R、GADL1-F、GADL1-R、GNB3-F、GNB3-R、GRIK4-F、GRIK4-R、HTR1A-1-F、HTR1A-1-R、HTR1A-2-F、HTR1A-2-R、HTR2A-1-F、HTR2A-1-R、HTR2A-2-F、HTR2A-2-R、HTR2A-3-F、HTR2A-3-R、MC4R-1-F、MC4R-1-R、MC4R-2-F、MC4R-2-R、UGT2B15-F、UGT2B15-R、SLC6A4-F、SLC6A4-R。优选地，所述引物组中各引物的序列如SEQIDNO.1-SEQIDNO.56所示。优选地，所述PGx-PCR酶包括一个Taq酶和一个高保真酶。优选地，所述Taq酶和高保真酶的比例为1:1-1:5。优选地，所述步骤S5中，纯化分析包括如下步骤：S51、取出纯化磁珠室温平衡30分钟，充分涡旋混匀；S52、取15μLPCR产物至一新的离心管，向PCR产物中补加无核酸酶水至100μL，加入60μL混匀后的磁珠，吹打10次以充分混匀；S53、室温孵育5分钟；S54、将离心管置于磁力架上，室温下静置5分钟至溶液澄清；S55、转移上清液至一个新的无核酸酶管，勿扰动磁珠；S56、向S55中的离心管中加入40μL混匀好的磁珠，吹打10次以充分混匀；S57、室温孵育5分钟；S58、将离心管置于磁力架上，室温下静置5分钟至溶液澄清；S59、弃上清液，勿扰动磁珠；S510、保持离心管在磁力架上，各加入200μL新配制的80％乙醇，勿扰动磁珠；S511、至少静置30秒，后吸去上清液；S512、重复步骤S510-S511，两次80％乙醇清洗；S513、将离心管从磁力架取下，室温干燥5-10分钟，确保乙醇无残留，磁珠不过分干燥；S514、用50μL10mMTris-HCl，pH8.0重悬磁珠；重悬时轻轻吹打混匀，室温静置5分钟后，将离心管置于磁力架上，室温下静置5分钟至溶液澄清，转移上清至一个新的无核酸酶管，勿扰动磁珠；S515、纯化后的文库定量采用2.0Fluorometer或仪器；S516、特异性纯化后的文库使用仪器或传统凝胶电泳进行分析。为了实现上述目的，本专利技术采用了如下技术方案：一种抑郁症用药相关基因检测的试剂盒，其包括：DNA位点富集反应组件，其由引物组组成；PGx-P本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种抑郁症用药相关基因的检测方法，其特征在于，所述检测方法包括以下步骤：S1、根据抑郁症药物的特征，确定影响药效的作用靶点的基因；S2、根据确定的基因选择对应的引物组；S3、提取检测对象的生物样本；S4、将引物组以及提取的生物样本置于含有PGx‑PCR酶的PCR反应体系中进行扩增；S5、将生物样本、扩增产物进行纯化处理后，进行二代测序分析。

【技术特征摘要】
1.一种抑郁症用药相关基因的检测方法，其特征在于，所述检测方法包括以下步骤：S1、根据抑郁症药物的特征，确定影响药效的作用靶点的基因；S2、根据确定的基因选择对应的引物组；S3、提取检测对象的生物样本；S4、将引物组以及提取的生物样本置于含有PGx-PCR酶的PCR反应体系中进行扩增；S5、将生物样本、扩增产物进行纯化处理后，进行二代测序分析。2.根据权利要求1所述的抑郁症用药相关基因的检测方法，其特征在于，所述作用靶点的基因包括：CYP2D6、CYP2C19、CYP1A2、CYP3A4、ABCB1、HTR2A、COMT、CYP2B6、HTR1A、MC4R、SLC6A4、ADCY9、ADRA2A、ANKK1、EPM2A、FKBP5、GADL1、GNB3、GRIK4、UGT2B15。3.根据权利要求2所述的抑郁症用药相关基因的检测方法，其特征在于，所述作用靶点为所列各基因上的共79个SNP位点。4.根据权利要求3所述的抑郁症用药相关基因的检测方法，其特征在于，所述79个SNP位点的信息如下表1所示：表1。5.根据权利要求1所述的抑郁症用药相关基因的检测方法，其特征在于，所述引物组包括：ABCB1-1-F、ABCB1-1-R、ABCB1-2-F、ABCB1-2-R、ADCY9-F、ADCY9-R、ADRA2A-F、ADRA2A-R、ANKK1-F、ANKK1-R、COMT-1-F、COMT-1-R、COMT-2-F、COMT-2-R、CYP1A2-1-F、CYP1A2-1-R、CYP1A2-2-F、CYP1A2-2-R、CYP1A2-3-F、CYP1A2-3-R、CYP1A2-4-F、CYP1A2-4-R、CYP1A2-5-F、CYP1A2-5-R、CYP1A2-6-F、CYP1A2-6-R、CYP1A2-7-F、CYP1A2-7-R、CYP1A2-8-F、CYP1A2-8-R、CYP2B6-1-F、CYP2B6-1-R、CYP2B6-2-F、CYP2B6-2-R、CYP2C19-1-F、CYP2C19-1-R、CYP2C19-2-F、CYP2C19-2-R、CYP2C19-3-F、CYP2C19-3-R、CYP2C19-4-F、CYP2C19-4-R、CYP2C19-5-F、CYP2C19-5-R、CYP2C19-6-F、CYP2C19-6-R、CYP2C19-7-F、CYP2C19-7-R、CYP2D6-1-F、CYP2D6-1-R、CYP2D6-2-F、CYP2D6-2-R、CYP2D6-3-F、CYP2D6-3-R、CYP2D6-4-F、CYP2D6-4-R、CYP2D6-5-F、CYP2D6-5-R、CYP2D6-6-F、CYP2D6-6-R、CYP2D6-7-F、CYP2D6-7-R、CYP2D6-8-F、CYP2D6-8-R、CYP2D6-9-F、CYP2D6-9-R、CYP2D6-10-F、CYP2D6-10-R、CYP2D6-11-F、CYP2D6-11-R、CYP2D6-12-F、CYP2D6-12...

【专利技术属性】
技术研发人员：丁崴，牛艳山，陈书善，张园园，顾梦南，胡于东，汪利，廖正丽，韩励，
申请(专利权)人：苏州艾达康医疗科技有限公司，
类型：发明
国别省市：江苏,32