一种猪等孢球虫rRNA基因序列及其获取方法技术

技术编号:15552048 阅读:171 留言:0更新日期:2017-06-08 02:20
本发明专利技术涉及生物基因工程技术领域,根据Genbank上Is 18S rRNA基因全序列(U97523.1)及Is ITS1基因序列(LC085519.1)设计引物,以Is基因组DNA(gDNA)为模板,PCR方法扩增获得Is‑18S rRNA基因序列;根据所获得Is‑18S rRNA及Is‑ITS1基因序列,分别设计三条同向且退火温度较高的特异性引物,利用Genome walking技术克隆获得Is‑18S‑ITS1‑5.8S‑ITS2‑28S rRNA基因全长序列,从而为猪等孢球虫新一代检测方法的建立打下基础。

RRNA sequence of a pig like coccidia and a method for obtaining the same

The present invention relates to the technical field of bio genetic engineering, according to the Genbank sequence of Is 18S rRNA gene (U97523.1) and Is ITS1 gene sequence (LC085519.1) primers were designed by Is genomic DNA (gDNA) as template, PCR was amplified by Is method 18S rRNA gene sequence; according to the Is 18S rRNA and Is ITS1 gene sequences were designed, three with the higher annealing temperature and specific primers, obtained full-length sequence of Is 18S ITS1 5.8S ITS2 28S rRNA gene using Genome walking cloning, and measuring method for Isospora suis a new generation to build the foundation of inspection.

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物基因工程
,更具体的说,涉及一种猪等孢球虫rRNA基因序列及其获取方法
技术介绍
猪等孢球虫病是一种由等孢属(Isospora)球虫引起的寄生性原虫病,可引起仔猪严重消化道疾病、腹泻、消瘦、发育受阻甚至死亡,其仔猪发病率可高达50%-75%,死亡率高达75%,呈世界性流行,严重危害养猪业发展。核糖体RNA(rRNA)是细胞中含量最多的RNA,约占RNA总量的82%,与多种蛋白质结合组成核糖体,是细胞内蛋白质合成的分子机器。rRNA基因序列既含有高度保守的序列区域,又有中度保守和高度变化的序列区域,但同种生物细胞完全一致或极少差异,且在生物进化的漫长经历中几乎保持不变,因此rRNA基因序列的差异被广泛认为是各类生物亲缘关系的“分子尺”。目前尚未见猪等孢球虫(Isosporasuis,Is)rRNA基因完整序列的研究报道。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题在于提供一种猪等孢球虫rRNA基因序列及其获取方法,根据Genbank上Is18SrRNA基因全序列(U97523.1)及IsITS1基因序列(LC085519.1)设计引物,以Is基因组DNA(gDNA)为模板,PCR方法扩增获得Is-18SrRNA基因序列;根据所获得Is-18SrRNA及Is-ITS1基因序列,分别设计三条同向且退火温度较高的特异性引物,利用Genomewalking技术克隆获得Is-18S-ITS1-5.8S-ITS2-28SrRNA基因全长序列,从而为猪等孢球虫新一代检测方法的建立打下基础。本专利技术所要解决的技术问题采用以下技术方案来实现。一种猪等孢球虫rRNA基因序列,它包括Is-HN18SrRNA-ITS1-5.8S-ITS2-28S基因序列,所述的基因序列为:GATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGCTTTTATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAGTTTATTTGATGGTCTTTACTACATGGATAACCGTGGTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACGTGCCTCTTCCTCAGGAAGGGCAGTGTTTATTAGATACAGAACCAACCCACCTTCTGGTGGTCCTCAGGTGATTCATAGTAACCGAACGGATCGCGTTATGGCTTCGGCCGGCGATGGATCATTCAAGTTTCTGACCTATCAGCTTTCGACGGTACTGTATTGGACTACCGTGGCAGTGACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGATTCAGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAACACTGGAAATTTCATTTCTAGTGATTGGAATGATGGGAATCCAAACCCCTTTCAGAGTAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTGCTGGAAGCAGCCAGTCCGCCCTTAGGGGTGTGTACGTGGTGAAATTCCGGCATCCTCCTGGTGGCGCTTCGCACTTAACTGGGTGGAGTGCTTTTCCAGGACTTTTACTTTGAGAAAATTAGAGTGTTTCAAGCAGGCTTGTTGCCTTGAATACTGCAGCATGGAATAATAAGATAGGATTTCGGCCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACTGAAGTAATGATTAATAGGGACGGTTGGGGGCATTCGTATTTAACTGTCAGAGGTGAAATTCTTAGATTTGTTAAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAAGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGCTCGAAGACGACCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGAGATAGGAAAACGTCATACTTGACTTCTCCTGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGAAAGGATTGACAGATTGATAGCCCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGGATCAGGAACCTCGTGTTCTTGTATCACTTCTTAGAGGGACTTTGCGTGTCTAACGCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCTGCACGCGCGCTACACTGATGCATCCAACGAGTTTATAACCTTGGCCGATAGGTCTAGGTAATCTTGTGAGTATGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAGGCGCAAGTCAGCAGCTTGCGCCGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAGTGTTCCGGTGAATTATTCGGACCGTTCTGTGGCGCGTTCGTGCCCGAGATGGAAAGTTTTGTGAACCTTAACACTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTCACACGTGGCCCTTGAAACATCTTTCAAACCTTTAGCAACTGAATCCCCATATTGATGGTCATAAGGAACAGCCTGCTGAGCGTTCGGGGGAAGCTGTGTTTCCCCGCGCCGCCGGCTGCTTCGAATGGCCGCATAAAGGGCATTAGCCGTTATTGCTGATGTGTTCGCCTACAGGGGACGCTGCAAATTCCTCCCGACATACTCAGACGGCTGAAACAGAATAGGGGTTGTTCTCTTCTCTTCTGTTTGCCCTCTGAGCTATGGAAGGTGAGGAAGCGGTTGTCCGTGTGTGGGGGAGTTTGGACTGCAGCGATGGCTTCCAAGTGCTCTGCTACACACATTCATTGTCTACCGCTTGGTGGTAGGGGCAGTCTGTATCCACTGGGGCCGTCACTCGCATCATGAGAGAGATGTGCTCTGTGGATTTGGACGTCGTCTCGCTTTTCCCACGCGGTAGAGGTGAAGTG本文档来自技高网...
一种猪等孢球虫rRNA基因序列及其获取方法

【技术保护点】
一种猪等孢球虫rRNA基因序列,其特征在于:它包括Is‑HN 18S rRNA‑ITS1‑5.8S‑ITS2‑28S基因序列,所述的基因序列为:GATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGCTTTTATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAGTTTATTTGATGGTCTTTACTACATGGATAACCGTGGTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACGTGCCTCTTCCTCAGGAAGGGCAGTGTTTATTAGATACAGAACCAACCCACCTTCTGGTGGTCCTCAGGTGATTCATAGTAACCGAACGGATCGCGTTATGGCTTCGGCCGGCGATGGATCATTCAAGTTTCTGACCTATCAGCTTTCGACGGTACTGTATTGGACTACCGTGGCAGTGACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGATTCAGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAACACTGGAAATTTCATTTCTAGTGATTGGAATGATGGGAATCCAAACCCCTTTCAGAGTAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTGCTGGAAGCAGCCAGTCCGCCCTTAGGGGTGTGTACGTGGTGAAATTCCGGCATCCTCCTGGTGGCGCTTCGCACTTAACTGGGTGGAGTGCTTTTCCAGGACTTTTACTTTGAGAAAATTAGAGTGTTTCAAGCAGGCTTGTTGCCTTGAATACTGCAGCATGGAATAATAAGATAGGATTTCGGCCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACTGAAGTAATGATTAATAGGGACGGTTGGGGGCATTCGTATTTAACTGTCAGAGGTGAAATTCTTAGATTTGTTAAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAAGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGCTCGAAGACGACCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGAGATAGGAAAACGTCATACTTGACTTCTCCTGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGAAAGGATTGACAGATTGATAGCCCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGGATCAGGAACCTCGTGTTCTTGTATCACTTCTTAGAGGGACTTTGCGTGTCTAACGCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCTGCACGCGCGCTACACTGATGCATCCAACGAGTTTATAACCTTGGCCGATAGGTCTAGGTAATCTTGTGAGTATGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAGGCGCAAGTCAGCAGCTTGCGCCGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAGTGTTCCGGTGAATTATTCGGACCGTTCTGTGGCGCGTTCGTGCCCGAGATGGAAAGTTTTGTGAACCTTAACACTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTCACACGTGGCCCTTGAAACATCTTTCAAACCTTTAGCAACTGAATCCCCATATTGATGGTCATAAGGAACAGCCTGCTGAGCGTTCGGGGGAAGCTGTGTTTCCCCGCGCCGCCGGCTGCTTCGAATGGCCGCATAAAG...

【技术特征摘要】
1.一种猪等孢球虫rRNA基因序列,其特征在于:它包括Is-HN18SrRNA-ITS1-5.8S-ITS2-28S基因序列,所述的基因序列为:GATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTTAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGCTTTTATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAAACAGTTATAGTTTATTTGATGGTCTTTACTACATGGATAACCGTGGTAATTCTATGGCTAATACATGCGCACGTGCCTCTTCCTCAGGAAGGGCAGTGTTTATTAGATACAGAACCAACCCACCTTCTGGTGGTCCTCAGGTGATTCATAGTAACCGAACGGATCGCGTTATGGCTTCGGCCGGCGATGGATCATTCAAGTTTCTGACCTATCAGCTTTCGACGGTACTGTATTGGACTACCGTGGCAGTGACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCTAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCTGATTCAGGGAGGTAGTGACAAGAAATAACAACACTGGAAATTTCATTTCTAGTGATTGGAATGATGGGAATCCAAACCCCTTTCAGAGTAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCTGCTGGAAGCAGCCAGTCCGCCCTTAGGGGTGTGTACGTGGTGAAATTCCGGCATCCTCCTGGTGGCGCTTCGCACTTAACTGGGTGGAGTGCTTTTCCAGGACTTTTACTTTGAGAAAATTAGAGTGTTTCAAGCAGGCTTGTTGCCTTGAATACTGCAGCATGGAATAATAAGATAGGATTTCGGCCCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACTGAAGTAATGATTAATAGGGACGGTTGGGGGCATTCGTATTTAACTGTCAGAGGTGAAATTCTTAGATTTGTTAAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAAGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGGGGCTCGAAGACGACCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGAGATAGGAAAACGTCATACTTGACTTCTCCTGCACCTTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCAGGTCCAGACATAGAAAGGATTGACAGATTGATAGCCCTTTCTTGATTCTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTTAACCTGCTAAATAGGATCAGGAACCTCGTGTTCTTGTATCACTTCTTAGAGGGACTTTGCGTGTCTAACGCAAGGAAGTTTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCTGCACGCGCGCTACACTGATGCATCCAACGAGTTTATAACCTTGGCCGATAGGTCTAGGTAATCTTGTGAGTATGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAGGCGCAAGTCAGCAGCTTGCGCCGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAGTGTTCCGGTGAATTATTCGGACCGTTCTGTGGCGCGTTCGTGCCCGAGATGGAAAGTTTTGTGAACCTTAACACTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTCACACGTGGCCCTTGAAACATCTTTCAAACCTTTAGCAACTGAATCCCCATATTGATGGTCATAAGGAACAGCCTGCTGAGCGTTCGGGGGAAGCTGTGTTTCCCCGCGCCGCCGGCTGCTTCGAATGGCCGCATAAAGGGCATTAGCCGTTATTGCTGATGTGTTCGCCTACAGGGGACGCTGCAAATTCCTCCCGACATACTCAGACGGCTGAAACAGAATAGGGGTTGTTCTCTTCTCTTCTGTTTGCCCTCTGAGCTATGGAAGGTGAGGAAGCGGTTGTCCGTGTGTGGGGGAGTTTGGACTGCAGCGATGGCTTCCAAGTGCTCTGCTACACACATTCATTGTCTACCGCTTGGTGGTAGGGGCAGTCTGTATCCACTGGGGCCGTCACTCGCATCATGAGAGAGATGTGCTCTGTGGATTTGGACGTCGTCTCGCTTTTCCCACGCGGTAGAGGTGAAGTGTGTTTTTTTTTTTTTTCACTTCGCCTGTTTGGTTCCCCTCTAAGAAACGTGGATGATGGGTTTTTGTCTCATTTCTTTTTCCTGTTTCTCGAGAGGTGGGACGAATGTACGTAGTCTGATTTCATTTAAACTTTCAGCAATGGATGTCTTGGTTCGCGCAACGATGAAGGACGCAGCGAAATGCGAAACGCAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATTAGATTTCTGAACGCAAATGGCGCTGCGGGGACATTCCCTGCAGCATGTCTGTTTCAGTGTCTCTGAAGTGTCAAGTTCTGTCCACGCGCTTCTGGGAGTGTTTCTGGAATATGCGTGTGGCAGTGTGATTGGATGTCTTGGGTGTTAAGAAGCAAGCTACTCGTGCTTCTAGAGAGCCGAACGTCATCAGAAATAGTCACAGCGGCGTGTACGCGATCAAACAGTGTTGAGTTGTATCCCGGACATCTTTGAGATACGGTGGTGGAATGCTATTAATTACATCAGAAGATTTCATTGATGGCGGTGATCTACTCGGAGCACTGGTTGGTTGTAACTGAGTATCGTCAGCTCTTAGCTTATGAGGGGGAGATCGGTAGCGGTACCCTTCATGCTCTTCTCTGCAT...

【专利技术属性】
技术研发人员:戚南山林栩慧孙铭飞廖申权吕敏娜吴彩艳李娟张健騑谢明权
申请(专利权)人:广东省农业科学院动物卫生研究所
类型:发明
国别省市:广东;44

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