获取无突变情形下亲缘指数的简便方法技术

技术编号:8453162 阅读:217 留言:0更新日期:2013-03-21 18:00
本发明专利技术公开了一种获取无突变情形下亲缘指数的简便方法,包括,仅有两名鉴定人时的常见亲缘指数(包括二联体亲权指数、叔侄指数、祖孙指数、半同胞指数、第一代堂兄弟或表兄妹指数等);两名被鉴定人间的全同胞指数;和在孩子生母参与情形下,孩子与另一名鉴定人间的常见亲缘指数(包括三联体亲权指数、叔侄指数、祖孙指数、半同胞指数、第一代堂兄弟或表兄妹指数)获取的简便方法。本发明专利技术获取无突变情形下亲缘指数的简便方法,便于进行无突变情形下亲缘指数的获取,并有利于进行批量的获取和计算。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及法医遗传学领域亲缘关系判定中亲缘指数的计算,提供了无突变情形下,两 名被鉴定人和有一方亲本参与情形下的三名被鉴定人间的亲缘指数的简便方法。
技术介绍
亲子鉴定分为孩子(Baby, B)与假设父(Alleged father, A) 二联体鉴定和生母(Mother, Μ)、孩子B与假设父A三联体鉴定。上述亲子鉴定还可推广至被鉴定人B与被鉴定人A之间是否存在全同胞关系、半同胞关系、叔侄关系、祖孙关系、第一代堂兄妹或表兄妹等常见的亲缘关系判定,以及在生母M参与情形下的上述亲缘关系判定(全同胞除外,因为亲权鉴定中通常不考虑生母参与情况下鉴定她的两个孩子是否为全同胞,因为此时计算得到的亲缘指数实际是两个孩子间为全同胞和为半同胞概率的比值)。在亲缘关系判定中,亲缘指数是进行亲缘关系判定所依赖的重要参数之一。亲权鉴定技术规范指出,在生母M-孩子B-假设父A三联体亲权鉴定中,三联体亲权指数(Paternity index in trios,简称PIT)大于10000且不吻合孟德尔遗传规律的STR基因个数小于3个则认定亲权,ΡΙτ〈0. 0001且不吻合孟德尔遗传规律的STR基因个数大于3个则排除亲权。依据被鉴定人常染色体遗传标记的基因型,已有众多学者通过不同的计算原理推导出了仅有两名被鉴定人时,不同基因型组合情形下的相应亲缘指数的计算公式,包括二联体亲权指数(Paternity index in duos,简称 PID)、全同胞指数(Full sibling index,简称FSI)、半同胞指数(Half sibling index,简称HSI)、叔侄指数(Avuncular index,简称Al)、祖孙指数(Grandparental index,简称GI)以及第一代堂/表兄妹关系指数(Istcousin index,简称CSI)等常见亲缘关系对应的亲缘指数,共对应44种不同的基因型组合形式(见表I )。亲权鉴定技术规范也给出了生母M-孩子B-假设父A在不同基因型组合情形下的PIt计算公式(见表2)。从表I和表2所列出的公式看,存在如下几个问题一是,由于基因型组合种类繁多,对应的公式繁多,容易导致误用,从而影响在亲缘关系判定中做出正确的结论。从近年来国内开展亲权鉴定能力验证的反馈信息来看,亲权指数计算公式的误用仍是常见问题之一。二是,由于公式种类繁多,不利于编程实现。三是,目前还没有统一的生母M参与情况下,B与A间的Al、GI、HSI以及CSI等常见亲缘指数计算公式。针对每一具体案例,仍需要依据经典的孟德尔遗传定律和概率原理进行推导,费时费力。表I不同基因型组合下,两名被鉴定人不同亲缘关系对应的亲缘指数的计算公式权利要求1.一种,其特征在于 设有被鉴定人M的基因型为(ml,m2)、鉴定人B的基因型为(bl,b2)和鉴定人A的基因型为(al,a2);等位基因bl的基因频率以fbl表不,等位基因b2的基因频率以fb2表不,并令全文摘要本专利技术公开了一种,包括,仅有两名鉴定人时的常见亲缘指数(包括二联体亲权指数、叔侄指数、祖孙指数、半同胞指数、第一代堂兄弟或表兄妹指数等);两名被鉴定人间的全同胞指数;和在孩子生母参与情形下,孩子与另一名鉴定人间的常见亲缘指数(包括三联体亲权指数、叔侄指数、祖孙指数、半同胞指数、第一代堂兄弟或表兄妹指数)获取的简便方法。本专利技术,便于进行无突变情形下亲缘指数的获取,并有利于进行批量的获取和计算。文档编号G06F19/00GK102982222SQ20111025791公开日2013年3月20日 申请日期2011年9月2日 优先权日2011年9月2日专利技术者赵书民, 李成涛, 张素华, 阙庭志 申请人:司法部司法鉴定科学技术研究所本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种获取无突变情形下亲缘指数的简便方法,其特征在于:设有被鉴定人M的基因型为(m1,m2)、鉴定人B的基因型为(b1,b2)和鉴定人A的基因型为(a1,a2);等位基因b1的基因频率以fb1表示,等位基因b2的基因频率以fb2表示,并令:????,以通用的似然比表示亲缘指数,则有:当仅有鉴定人B与鉴定人A两名被鉴定人时,鉴定人B与鉴定人A间的亲缘指数计算采用:当鉴定人B和/或鉴定人A纯合子时:??????????????????????公式1当鉴定人B和鉴定人A均为杂合子时:????????????????????????公式2公式1和公式2适用于除全同胞外的常见亲缘指数,包括二联体亲权指数、叔侄指数、祖孙指数、半同胞指数以及第一代堂兄弟或表兄妹指数的计算;若鉴定鉴定人B与鉴定人A之间是否存在全同胞关系,则全同胞指数的计算采用以下两个公式:当鉴定人B和/或鉴定人A纯合子时:??????????????????????????????公式3当鉴定人B和鉴定人A均为杂合子时:????????????????????????????公式4公式1至公式4中,G1和G2的幂m、n仅在对应等位基因b1和等位基因b2表现为状态一致性等位基因时才为1,否则为0;当鉴定人B的生母M参与时,鉴定人B与鉴定人A间的亲缘指数计算采用:若等位基因a1、等位基因a2与依据生母M(m1m2)和鉴定人B(b1b2)推断的鉴定人B的生父基因均相同:????????????????公式5若鉴定人a1和鉴定人a2仅有一个与推断的鉴定人B的生父基因相同:??????????????公式6公式5和公式6不但适用于计算三联亲权指数的计算,同样适用于在鉴定人B的生母参与情形下的鉴定人B与鉴定人A的半同胞指数、叔侄指数、祖孙指数以及第一代堂兄妹或表兄妹指数的常见亲缘关系指数的计算;公式5和公式6中G1、G2和G3的幂m、n、k的取值原则为:m、n、k的取值只有1和0两种可能;若等位基因b1为生父基因,则m=1,n=k=0;若等位基因b2为生父基因,则m=k=0,n=1;若不能确定生父基因(即b1和b2均有成为生父基因的可能),则k=1,m=n=0,即m、n和k同一时间只能有一个为1,其余两个为0;公式1至公式6中,r为亲缘系数,父子或母子间的亲缘系数r=1/2;祖孙间、叔侄间以及半同胞间的亲缘系数r=1/4;第一代堂兄妹和表兄妹间的亲缘系数r=1/8。2011102579123100001dest_path_image002.jpg,2011102579123100001dest_path_image004.jpg,dest_path_image006.jpg,dest_path_image008.jpg,dest_path_image010.jpg,dest_path_image012.jpg,dest_path_image014.jpg,dest_path_image016.jpg,dest_path_image018.jpg...

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:赵书民李成涛张素华阙庭志
申请(专利权)人:司法部司法鉴定科学技术研究所
类型:发明
国别省市:

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