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筛选真核细胞基因组内特定基因调控相关机制和分子的方法技术

技术编号:8128401 阅读:257 留言:0更新日期:2012-12-26 23:42
本发明专利技术涉及一种筛选真核细胞基因组内特定基因调控相关机制和分子的方法,1)确定研究所需基因组片段长度;2)对选定的基因组片段进行修饰;3)将修饰后的基因组片段进行大量扩增纯化,并运用转基因手段将修饰后的基因组片段导入目标细胞或目标动物内,分别形成转基因细胞或转基因动物:4)对转基因细胞或转基因动物施以特定刺激;5)从刺激后的转基因细胞或转基因动物中获取基因片段以及结合在这些基因片段上的调控蛋白;6)分离分析与核酸结合的蛋白和相应的核酸序列;本发明专利技术提供了一种能够高效筛选参与指定基因或遗传位点表达调控相关蛋白及其结合位点的高特异性,高灵敏性研究方法。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物学领域,涉及一种筛选基因调控相关机制和分子的研究方法,尤其涉及一种。
技术介绍
真核基因调控,是一种将蕴藏在DNA序列中的遗传信息,显现为有功能的蛋白质或核酸,进而参与各项生命活动的过程。这一过程要求基因组内各基因按特定的次序在特定的时间,空间,以适当的形式和数量进行表达。基因表达调控是生命得以维持和延续的前提。虽然人们对原核基因的表达调控已经有了比较深入的了解,但由于真核基因本身结构 和功能极为复杂,又缺乏有效的研究手段和技术,虽经多年巨大的努力,但相关研究的进展仍极为缓慢。时至今日,人们对真核基因的表达调控,依然所知甚少。真核基因是断裂基因,包括能够编码蛋白质序列的外显子和非编码的内含子序列以及非编码的调控序列。外显子能够经过翻译过程生成蛋白质,调控序列则结合相关的调控因子。在人类基因组内,编码外显子的序列仅占全序列的1%左右,非编码序列中,内含子占24%,剩余的75%为非编码的各种调控序列和大量重复序列。基因的平均长度为27kb,85%的基因长度小于lOOkb。就基因表达调控而言,每一特定基因的表达调控都可以单独进行。基因调控过程中,转录调控是最关键的环本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种筛选真核细胞基因组内特定基因调控相关机制和分子的方法,其特征在于:所述方法包括以下步骤:1)通过查找基因组数据库和相关载体库,找到包含有目的基因或基因组位点的完整基因组序列,并根据以往对该基因或基因位点的相关研究,确定所需基因组片段长度,所述所需基因组片段长度的范围在100kb?300kb之间;2)对步骤1)所选定的基因组片段进行修饰,得到修饰后的基因组片段;3)将步骤2)所得到的修饰后的基因组片段进行大量扩增纯化,并运用转基因手段将修饰后的基因组片段导入目标细胞或目标动物内,并分别形成转基因细胞或转基因动物:4)对步骤3)所得到的转基因细胞或转基因动物施加特定刺激,所述特定刺激能够影响转...

【技术特征摘要】
1.一种筛选真核细胞基因组内特定基因调控相关机制和分子的方法,其特征在于所述方法包括以下步骤 1)通过查找基因组数据库和相关载体库,找到包含有目的基因或基因组位点的完整基因组序列,并根据以往对该基因或基因位点的相关研究,确定所需基因组片段长度,所述所需基因组片段长度的范围在100kb-300kb之间; 2)对步骤I)所选定的基因组片段进行修饰,得到修饰后的基因组片段; 3)将步骤2)所得到的修饰后的基因组片段进行大量扩增纯化,并运用转基因手段将修饰后的基因组片段导入目标细胞或目标动物内,并分别形成转基因细胞或转基因动物 4)对步骤3)所得到的转基因细胞或转基因动物施加特定刺激,所述特定刺激能够影响转基因表达调控机制,使转基因表达发生变化; 5)从步骤4)所得到的刺激后的转基因细胞或转基因动物中获取基因片段以及结合在这些基因片段上的调控蛋白; 6)分离分析与核酸结合的蛋白和相应的核酸序列。2.根据权利要求I所述的筛选真核细胞基因组内特定基因调控相关机制和分子的方法,其特征在于所述步骤2)中的修饰的内容包括向选定的基因组片段内的特定位点插入选择和显示标记以及向选定的基因组片段内的特定位点导入极稀少位点核酸酶的酶切位占. 所述向选定的基因组片段内的特定位点插入选择和显示标记是将抗药性基因和/或荧光蛋白等序列加入基因编码区内,利用这些遗传标记观察转入基因的表达情况,并进行定向筛选,获得成功的转基因细胞和/或动物; 所述向基因组片段内导入的极稀少核酸酶的酶切位点是一段能够为极稀少核酸酶所特异性识别的核酸序列;所述极稀少核酸酶能够识别并结合这些位点并与这些位点结合,并能够在相应的酶切位点处切断双链DNA,制备出有双链断端的DNA ;所述极稀少核酸酶包括但不限于兆位核酸酶类、重组酶以及能够在特定序列处切断DNA的酶类;所述兆位核酸酶类包括内含子核酸内切酶以及归巢子核酸内切酶;所述极稀少核酸酶识别的位点长度在IObp以上; 所述修饰的实现方式是基因组载体重组工程法和/或生物合成法。3.根据权利要求2所述的筛选真核细胞基因组内特定基因调控相关机制和分子的方法,其特征在于所述步骤3)的具体实现方式是 3.I)通过载体在特定宿主菌内扩增或通过吉布森拼接大量合成修饰后的基因组片段; 3.2)通过常规的分子克隆方法对步骤3. I)所得到的大量的修饰后的基因组片段进行分离和纯化; 3.3)运用转基因方法将步骤3. 2)所得到的修饰后的基因组大片段导入目标细胞或目标动物内; 若导入目标细胞时,所述转基因方法包括但不限于脂质体转染或电穿孔转染,利用选择性培养基或标记基因筛选转染阳性细胞,建立稳定的转基因细胞; 若导入目标动物时,所述转基因方...

【专利技术属性】
技术研发人员:许汉鹏
申请(专利权)人:许汉鹏
类型:发明
国别省市:

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