本发明专利技术公开了一种染色体8q24区段多态性检测特异性引物和液相芯片，该液相芯片主要包括有：由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成的特异性引物，所述特异性引物序列分别选自：针对G83T的SEQ?ID?NO.23和SEQ?ID?NO.24、针对C140A的SEQ?ID?NO.25及SEQ?ID?NO.26、针对C160T的SEQ?ID?NO.27及SEQ?ID?NO.28、针对G99A的SEQ?ID?NO.29及SEQ?ID?NO.30、针对C202A的SEQ?ID?NO.31及SEQ?ID?NO.32、针对C296T的SEQ?ID?NO.33及SEQ?ID?NO.34、针对A125C的SEQ?ID?NO.35及SEQ?ID?NO.36、针对T119C的SEQ?ID?NO.37及SEQ?ID?NO.38、针对C149A的SEQ?ID?NO.39及SEQ?ID?NO.40、针对C193T的SEQ?ID?NO.41及SEQ?ID?NO.42、针对G201T的SEQ?ID?NO.43及SEQ?ID?NO.44中的一对以上；所述tag序列选自SEQ?ID?NO.1～SEQ?ID?NO.22中的序列；微球，扩增引物。所制备的染色体8q24区段多态性检测液相芯片具有非常好的信号噪声比，并且所设计的探针以及anti-tag序列之间基本上不存在交叉反应。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于分子生物学领域，涉及医学和生物技术，具体的是涉及一种染色体 8q24区段检测特异性引物和液相芯片。
技术介绍
全基因组关联研究发现，染色体SqM区段的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)与前列腺癌、结肠癌和乳腺癌等多种肿瘤的遗传易感性相关。目前，对染色体8明4区段的单核苷酸多态性进行检测、分析的方法很多，如直接测序法、PCR-RFLP分析法、传统固相芯片等等，其中最常用的是PCR-RFLP分析法。PCR-RFLP 法是基于基因突变造成的限制性内切酶识别位点的改变，如位点丢失或产生新位点，通过 PCR扩增某一特定片段，再用限制性内切酶酶切扩增产物，电泳观察片段的大小，这种方法用于检测酶切位点改变的基因突变，可直接判断基因型，但该法不能用于没有产生新酶切位点的基因突变检测。再次，传统固相芯片因其重复性差不能满足实际应用的需要，而其它基于PCR技术的方法都存在着检测通量的局限性，每次只能检测一种突变类型，不能满足实际应用的需要。本专利技术目标检测的染色体8明4区段突变位点，如表所示权利要求1.一种染色体8明4区段多态性检测液相芯片，其特征是，主要包括有A.针对染色体8明4区段的11种常见多态性位点分别设计的野生型和突变型特异性 ASPE引物，每种ASPE弓丨物由5’端的tag序列和3’端的针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列分别选自针对G83T的SEQ ID NO. 23和SEQ ID NO. 24、针对 C140A 的 SEQ ID NO. 25 及 SEQID NO. 26、针对 C160T 的 SEQ ID NO. 27 及 SEQ ID NO. 28、针对 G99A 的 SEQ ID NO. 29 及 SEQ ID NO. 30、针对 C202A 的 SEQ ID NO. 31 及 SEQ ID NO. 32、针对 C296T 的 SEQ ID NO. 33 及 SEQ ID NO. 34、针对 A125C 的 SEQ ID NO. 35 及 SEQ ID NO. 36、针对 T119C 的 SEQ ID NO. 37 及 SEQ ID NO. 38、针对 C149A 的 SEQ ID NO. 39 及 SEQ ID NO. 40、针对 C193T 的 SEQ ID NO. 41 及 SEQ ID NO. 42、针对 G201T 的 SEQ ID NO. 43 及SEQ ID NO. 44中的一对以上；所述tag序列选自SEQ ID NO. 1 SEQ ID NO. 22中的序列；B.分别包被有特异的anti-tag序列的微球，所述anti-tag序列能相应地与A中所选 tag序列互补配对，所述anti-tag序列选自SEQ ID NO. 45 SEQ ID NO. 66中的序列，所述 anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列，上述每种微球具有不同颜色编码；C.用于扩增具有G83T、C140A、C160T、G99A、C202A、C296T、A125C、Tl 19C、C149A、C193T 和G201T的中的一个以上多态性位点目标序列的引物。2.根据权利要求1所述的染色体8明4区段多态性检测液相芯片，其特征是，所述扩增引物选自针对 G83T 的 SEQ ID NO. 67 和 SEQ ID NO. 68、针对 C140A 的 SEQ ID NO. 69 和 SEQ ID NO. 70、针对 C160T 的 SEQ ID N0. 71 和 SEQ ID N0. 72、针对 G99A 的 SEQ ID N0. 73 和 SEQ ID N0. 74、针对 C202A 的 SEQ ID N0. 75 和 SEQ ID N0. 76、针对 C296T 的 SEQ ID N0. 77 和 SEQ ID N0. 78、针对 A125C 的 SEQ ID N0. 79 和 SEQ ID N0. 80、针对 T119C 的 SEQ ID N0. 81 和 SEQ ID N0. 82、针对 C149A 的 SEQ ID N0. 83 和 SEQ ID N0. 84、针对 C193T 的 SEQ ID N0. 85 和 SEQ ID N0. 86、针对 G201T 的 SEQ ID N0. 87 和 SEQ ID N0. 88 中的一对以上。3.根据权利要求1所述的染色体8明4区段多态性检测液相芯片，其特征是，所述ASPE 引物选自针对G83T的由SEQ ID NO. 1和SEQ ID N0. 23组成的序列及由SEQ ID N0. 2和 SEQ ID NO. M组成的序列、针对C140A的由SEQ ID N0. 3和SEQ ID N0. 25组成的序列及由 SEQ ID N0. 4 和 SEQ ID N0. 26 组成的序列、针对 C160T 的由 SEQ ID N0. 5 和 SEQ ID N0. 27 组成的序列及由SEQ ID N0. 6和SEQ ID N0.观组成的序列、针对G99A的由SEQ ID N0. 7 和SEQ ID N0. 29组成的序列及由SEQ ID N0. 8和SEQ ID N0. 30组成的序列、针对C202A 的由SEQ ID N0. 9和SEQ IDN0. 31组成的序列及由SEQ ID NO. 10和SEQ ID N0. 32组成的序列、针对C296T的由SEQ IDN0. 11和SEQ ID N0. 33组成的序列及由SEQ ID N0. 12和SEQ ID N0. 34组成的序列、针对A125C的由SEQ ID N0. 13和SEQ ID N0. 35组成的序列及由SEQ ID N0. 14 和 SEQ ID N0. 36 组成的序列、针对 T119C 的由 SEQ ID N0. 15 和 SEQ ID N0. 37 组成的序列及由SEQ ID N0. 16和SEQ IDN0. 38组成的序列、针对C149A的由SEQ ID N0. 17 和SEQ ID N0. 39组成的序列及由SEQ IDN0. 18和SEQ ID N0. 40组成的序列、针对C193T 的由 SEQ ID N0. 19 和 SEQ ID N0. 41 组成的序列及由 SEQ ID N0. 20 和 SEQ ID N0. 42 组成的序列、针对G201T的由SEQ ID N0. 21和SEQ IDN0. 43组成的序列及由SEQ ID N0. 22和 SEQ ID N0. 44组成的序列中的一对以上。4.根据权利要求1所述的染色体8明4区段多态性检测液相芯片，其特征是，A.所述特异性ASPE引物为针对G83T的由SEQID NO. 1和SEQ ID NO. 23组成的序列及由SEQID NO. 2和SEQ ID NO. 24组成的序列、针对C140A的由SEQ ID NO. 3和SEQ ID NO. 25组成的序列及由SEQ ID NO. 4和SEQ ID NO. 26组成的序列、针对C160T的由SEQ ID NO. 5和SEQ IDN0. 27组成的序列及由SEQ ID NO. 6和SEQ I本文档来自技高网...
【技术保护点】
１．一种染色体８ｑ２４区段多态性检测液相芯片，其特征是，主要包括有：Ａ．针对染色体８ｑ２４区段的１１种常见多态性位点分别设计的野生型和突变型特异性ＡＳＰＥ引物，每种ＡＳＰＥ引物由５’端的ｔａｇ序列和３’端的针对目的基因多态性位点的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列分别选自：针对Ｇ８３Ｔ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２３和ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２４、针对Ｃ１４０Ａ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２５及ＳＥＱＩＤ ＮＯ．２６、针对Ｃ１６０Ｔ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２７及ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２８、针对Ｇ９９Ａ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２９及ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３０、针对Ｃ２０２Ａ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３１及ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３２、针对Ｃ２９６Ｔ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３３及ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３４、针对Ａ１２５Ｃ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３５及ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３６、针对Ｔ１１９Ｃ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３７及ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３８、针对Ｃ１４９Ａ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．３９及ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．４０、针对Ｃ１９３Ｔ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．４１及ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．４２、针对Ｇ２０１Ｔ的ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．４３及ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．４４中的一对以上；所述ｔａｇ序列选自ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．１～ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．２２中的序列；Ｂ．分别包被有特异的ａｎｔｉ－ｔａｇ序列的微球，所述ａｎｔｉ－ｔａｇ序列能相应地与Ａ中所选ｔａｇ序列互补配对，所述ａｎｔｉ－ｔａｇ序列选自ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．４５～ＳＥＱ ＩＤ ＮＯ．６６中的序列，所述ａｎｔｉ－ｔａｇ序列与微球连接中间还设有间隔臂序列，上述每种微球具有不同颜色编码；Ｃ．用于扩增具有Ｇ８３Ｔ、Ｃ１４０Ａ、Ｃ１６０Ｔ、Ｇ９９Ａ、Ｃ２０２Ａ、Ｃ２９６Ｔ、Ａ１２５Ｃ、Ｔ１１９Ｃ、Ｃ１４９Ａ、Ｃ１９３Ｔ和Ｇ２０１Ｔ的中的一个以上多态性位点目标序列的引物。...
【技术特征摘要】
【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，郭婧，罗小笛，
申请(专利权)人：广州益善生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：81
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