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用于分析DNA的方法和装置制造方法及图纸

技术编号:4888893 阅读:140 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及分析来自靶标生物体的DNA序列中胸腺嘧啶、胞嘧啶、腺嘌呤和鸟嘌呤的分布和/或比的装置的方案和设计。然后,该结果用于确定靶标生物体在诸如人体的宿主里可具有的可能的影响。目标是提供诊断诸如传染病的疾病的有效方法,测试食物和药物的安全性,并且因此产生卫生保健和食物供应的自然和有效的解决办法。例如,根据本发明专利技术配置的DNA分析方法接收DNA序列输入并且将其转化为重装配序列。基于重装配序列的结果可继而被输出。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于分析DNA的方法和装置相关申请本申请要求基于2008年4月16日提交的美国临时专利申请第61/045,511号,名 为“用于分析DNA的方案和装置”的优先权。本申请还要求基于2008年10月6日提交的 美国临时专利申请第61/102,989号,名为“用于分析DNA的方案和装置(2),,的优先权。
技术介绍
当一种不熟悉的传染病在社会上出现时,了解疾病有可能需要对患者的整个病情 进展的观察。例如,诸如联合国世界卫生组织(WHO)和美国疾病控制预防中心(⑶C)的机 构可收到关于在爆发伊始观察到的症状以及可疑因果联系的报告。医院可继续报告疾病的 特征,包括症状的进一步发展、预防技术、患者对不同治疗方法的反应以及任何病原研究的 结果。这些对于疾病的深入了解预计可使医疗从业者更有效果地且有效地治疗受感染的患 者ο然而,对于任何指定疾病,这种期望在现实的时间框架内可能是实际的或不实际 的。换句话说,可能只有在疾病已经扩散至大批相关人群后,才得到适当地治疗疾病所需的 知识。到确定适当的预防和治疗方法时,可能已经难以控制疾病进一步的凶猛扩散。在中医(TCM)的诊治中,医师不但可以根据患者有形的症状而且也可以根据患者 内部生理学的各种表现来评价患者的整体生理状态。例如,医师可在实行其他诊断过程中, 观察患者舌的不同部位和脉搏的当前状态,并测试与不同经络(解释如下)相关的敏感性。 所述诊断不需要任何对于病原体或疾病的标记,并且可在无论患者症状是否与一系列已知 症状一致的情况下应用。因此,可根据TCM理论治疗不熟悉的疾病,甚至当患者具有一系列无法识别的症 状时。然而,所述方法可能在医师方面需要特殊的专业知识,这在世界一些地方可能甚至在 中国都是困难的要求。另外,尽管这种个人诊断手段在许多医疗条件下经常是有优势的,但 是其对于冲击潜在的大面积传播的传染病可能是无效的。这是因为,疾病对患者A和患者B 的影响可能有轻微的不同,因为患者A和患者B在染上疾病前各自的生理学开始可能不同。 因此,TCM医师观察到患者A上产生的影响可能不一定能够精确地预测患者B上产生的影 响。这种患者-特异性方法实际上是TCM诊治的优势,因为这允许医师向每个患者提 供个别制定的治疗方法。然而,在一种新的或不熟悉的传染病的情况下,社会的近期目标 在很大程度上经常是控制疾病以防在人群中传播。因此,有效地确定不依赖于特定的宿主 (例如,人类患者)的特定病原体的作用的能力会是有利的。这种了解可以允许专业医护人 员在疾病扩散至难于控制前迅速地进一步确定合适的疗程。如将看到的,本专利技术以一种巧 妙的方式提供这种解决办法。以下为一些TCM理论的基本观点,其中许多以黄帝经典内科学(或内经)为基础。 内经是写于中国战国时期(476-221BC)的第一本典籍,并且依旧是许多现今TCM学习依据 的教科书。内经中“部分和整体”的概念认为,整个万物是一个整体,并且每个人是该整体的一部分并因此和该整体含有相同的信息。TCM医师在很久以前就采纳了这种概念。例如,他 们将整个人体映射至相应的人类耳朵内部以及头皮。今天,耳部针灸和头皮针灸已经成为 国际标准并且包含在加利福尼亚州针灸医师执业考试内。五行理论(The Five-Element Theory)认为自然界中有已知为五行的火、水、木、 金和土的五种动态性质。万物中所有事物都具有五行性质中的一种。该理论描述五行之间 的“相生-相克(production-subduction) ”的关系以及他们对人体的影响。总结显示于图 1。实线箭头代表“相生”关系,而虚线箭头代表“相克”关系。传统的经络理论认为存在一个包含沿站立姿势的人体纵向运行的十二条主要经 络的经络系统,以及从十二条主要经络延伸至全身的经络网络。十二条经络分为位于上肢 和下肢(手和足)的3条阴经(太阴、少阴和厥阴)和3条阳经(太阳、少阳和阳明)。经 络是能量(在TCM中也称为气和血)运行的通路。自从WHO在1993年公布了 “Standard AcupunctureNomenclature, 2nd Edition”(“标准针灸命名法,第2版”)后,经络理论和361 个穴位被定为国际标准。附图简述附图说明图1显示现有技术的概念。图2显示本专利技术的一个实施方式。图3显示本专利技术的一个实施方式。图4A-B显示本专利技术的一个实施方式。图5显示本专利技术的一个实施方式。图6显示本专利技术的一个实施方式。图7显示本专利技术的一个实施方式。 图8A-C显示本专利技术的一个实施方式。图9显示本专利技术的一个实施方式。图10显示本专利技术的一个实施方式。图11显示本专利技术的一个实施方式。专利技术详述本专利技术涉及分析来自靶标生物体的DNA序列中胸腺嘧啶、胞嘧啶、腺嘌呤和鸟嘌 呤的分布和/或比的装置的方案和设计。然后,该结果用于确定靶标生物体在诸如人体的 宿主里可具有的可能影响。目标是提供诊断诸如传染病的疾病的有效方法,测试食物和药 物的安全性,并且因此产生卫生保健和食物供应的自然和有效的解决办法。例如,如图6所示,根据本专利技术配置的DNA分析方法在602接收DNA序列输入并且 在604将其转化为重装配序列。基于重装配序列的结果可继而在606输出。基础创新理论以下为在本专利技术中新发展的理论,该理论作为本公开的方法和装置的基础。这些 理论的正确性已经通过以下部分中描述的本公开的方法所证实。对于超过30种已知传染 病,预测的结果与WHO和CDC公布的信息良好吻合。以上所述的部分-整体概念可认为是与Benoit Mandelbrot在1975年提出的数 学术语“分形”相似。分形是其中一个整体的每一部分为该整体的缩微拷贝的系统。相应理论(Theory of Correspondency)在分形的情况下,“相应”在相同坐标的两件事物中存在。因此,当一件事物发生变化时,另一个事物也一定受影响。例如,假设A、 B和C是称为S的分形体系中的三种子系统。子系统A的四维性质(Xa、Ya、Za和Ta)对应 于子系统B的性质(Xb、Yb、Zb和Tb)、子系统C的性质(Xe、Yc、Zc和Tc)以及整个系统S 的性质(Xs、Ys、Zs和Ts)。如果Xa有任何扰动,那么Xb,Xc和Xs都将同时受到影响,并且 整个体系将失去平衡。为重新建立平衡,必须在这些对应的位置进行调整。应该注意的是, 以与其他三种维度同样的方式处理时间。也就是说,所有子系统是同步的。天、人和地的概念(HUE概念)人体的三个层次的概念最先描述于内经中。人是 自然的一部分并且处于天和地之间;因此,人也在其自身内模拟自然。三个层次被命名为 天、人和地,其中天通常指身体偏上的部位或覆盖于整个身体的最外层;地通常指身体偏下 的部位或保持所有内容物的身体最内层;并且人指连接天和地的层。此外,基于部分-整体 概念,这三个层次也存在于人体的每一个部位中。经现代科学证实,人类进化从被称为外胚层、中胚层和内胚层的细胞的三个层开 始。外胚层后来发展成为诸如皮肤、毛发、指甲和神经系统的身体外层。中胚层后来发展成 为诸如肌肉、骨骼、腱和循环系统的中层。内胚层后来发展成为诸如胃肠道、呼吸道和内分 泌系统的身体内层。因此,我们可以认为天层包括胚胎的外胚层以及对应的发展出的身体 部位;人层包括胚胎的中胚层以及对应本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种DNA分析系统,该系统包括:  接收DNA序列输入的输入模块;  将所述DNA序列转化成为重装配序列的处理器;  输出基于所述重装配序列的结果的输出模块。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】US 2008-4-16 61/045,511;US 2008-10-6 61/102,989;US1.一种DNA分析系统,该系统包括 接收DNA序列输入的输入模块;将所述DNA序列转化成为重装配序列的处理器; 输出基于所述重装配序列的结果的输出模块。2.如权利要求1所述的DNA分析系统,其中结果输出包括所述重装配序列。3.如权利要求1所述的DNA分析系统,其中所述重装配序列包括三层。4.如权利要求3所述的DNA分析系统,其中所述三层中的第一层包括所述DNA序列中 所有三核碱基代表的第一个,所述三层中的第二层包括所有三核碱基代表的第二个,并且 所述三层中的第三层包括所有三核碱基代表的第三个。5.如权利要求3所述的DNA分析系统,其中所述处理器还将所述重装配序列划分为八相。6.如权利要求5所述的DNA分析系统,其中所述八相中的每一个代表完整时间周期的1/8。7.如权利要求5所述的DNA分析系统,其中所述处理器还将所述重装配序列划分到所 述八相的每一个中的进一步细分的相中。8.如权利要求5所述的DNA分析系统,其中所述处理器还分析多个总和以产生分析结 果,其中所述多个总和中的每一个分别表示在所述三层和八相中的每一个里四个核碱基代 表的每一个的总的出现。9.如权利要求8所述的DNA分析系统,其中所述处理器还分析根据所述多个总和中至 少两个的比。10.如权利要求8所述的DNA分析系统,其中结果输出包括所述分析结果。11.如权利要求1所述的DNA分析系统,其中所述处理器还测定包含输入DNA序列的靶 标生物体对宿主生物体的生理效应,以产生测定结果。12.如权利要求11所述的DNA分析系统,其中所述测定结果基于五行理论、经络理论、 相应理论、人天和地的概念以及四时概念中的一个。13.如权利要求11所述的DNA分析系统,其中结果输出包括所述测定结果。14.如权利要求11所述的DNA分析系统,其中结果输出包括所述测定结果所基于的标准。15.如权利要求1所述的DNA分析系统,其中结果输出包括图形、图表、表格、图和大纲 中的一种。16.一种DNA分析方法,该方法包括 接收DNA序列输入;将所述DNA序列转化成为重装配序列; 输出基于所述重装配序列的结果。17.如权利要求16所述的DNA分析方法,其中结果输出包括所述重装配序列。18.如权利要求16所述的DNA分析方法,其中所述重装配序列包括三层。19.如权利要求18所述的DNA分析方法,其中所述三层中的第一层包括所述DNA序列 中所有三核碱基代表的第一个,所述三层中的第二层包括所有三核碱基代表的第二个,并 且所述三层中的第三层包括所有三核碱基代表的第三个。20.如权利要求18所述的DNA分析方法,该方法还包括 将所述重装配序列划分为八相。21.如权利要求20所述的DNA分析方法,其中所述八相中的每一个代表完整时间周期 的 1/8。22.如权利要求20所述的DNA分析方法,该方法还包括将所述重装配序列划分到所述八相的每一个中的进一步细分的相中。23.如权利要求20所述的DNA分析方法,该方法还包括分析多个总和以产生分析结果,其中所述多个总和中的每一个分别表示在所述三层和 八相中每一个里四个核碱基代表的每一个的...

【专利技术属性】
技术研发人员:迈王
申请(专利权)人:迈王
类型:发明
国别省市:US[美国]

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