翻译效率预测方法、筛选方法、模型训练方法和电子设备技术

技术编号:46512981 阅读:7 留言:0更新日期:2025-09-30 18:42
本说明书涉及生物信息技术领域,尤其涉及一种翻译效率预测方法、筛选方法、模型训练方法和电子设备。其中翻译效率预测方法基于翻译效率预测模型实现,所述翻译效率预测模型包括嵌入模块、编码模块和预测模块;所述方法包括:获取信使核糖核酸的序列数据;通过所述嵌入模块提取序列数据的特征,得到信使核糖核酸的特征表示;将特征表示输入所述编码模块,以通过编码模块对输入的特征表示进行卷积处理,基于注意力机制对卷积结果进行编码,根据编码结果输出更新后的特征表示;通过所述预测模块对更新后的特征表示进行翻译效率预测,得到翻译效率预测结果。本说明书实施例可以准确和高通量预测信使核糖核酸的翻译效率,提高筛选效率,降低筛选成本。

【技术实现步骤摘要】

本说明书涉及生物信息,尤其涉及一种翻译效率预测方法、筛选方法、模型训练方法和电子设备


技术介绍

1、信使核糖核酸(messenger rna,mrna),是携带遗传信息,在蛋白质合成时充当模板的核糖核酸。信使核糖核酸的分子能够在细胞内被核糖体读取,并按照其携带的碱基序列信息来指导氨基酸的连接顺序,从而形成具有特定功能的蛋白质。

2、信使核糖核酸的翻译效率是指信使核糖核酸分子在单位时间内被细胞内核糖体翻译成蛋白质的速度和质量。围绕信使核糖核酸的药物研发需要测量信使核糖核酸的翻译效率。准确测量信使核糖核酸的翻译效率,对于围绕信使核糖核酸的药物研发具有积极的促进作用。已有技术中,一般通过生物实验的方式测定信使核糖核酸的翻译效率。但是通过生物实验的方式测定信使核糖核酸的翻译效率,耗时长,并且成本高。


技术实现思路

1、本说明书实施例提供一种翻译效率预测方法、筛选方法、模型训练方法和电子设备,用深度学习的方式预测信使核糖核酸的翻译效率,减少翻译效率的测量耗时,降低成本。

2、本说明书实施例提供本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种信使核糖核酸的翻译效率预测方法,其特征在于,所述方法基于翻译效率预测模型实现,所述翻译效率预测模型包括嵌入模块、编码模块和预测模块;所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述序列数据包括信使核糖核酸中5'非翻译区的序列数据,所述翻译效率预测结果包括5'非翻译区的平均核糖体负载。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述编码模块包括顺次堆叠的N个编码器,N为大于1的正整数;在将特征表示输入编码模块的步骤中包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在...

【技术特征摘要】

1.一种信使核糖核酸的翻译效率预测方法,其特征在于,所述方法基于翻译效率预测模型实现,所述翻译效率预测模型包括嵌入模块、编码模块和预测模块;所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述序列数据包括信使核糖核酸中5'非翻译区的序列数据,所述翻译效率预测结果包括5'非翻译区的平均核糖体负载。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述方法还包括:

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述编码模块包括顺次堆叠的n个编码器,n为大于1的正整数;在将特征表示输入编码模块的步骤中包括:

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,每个所述编码器包括卷积核,所述n个编码器的卷积核尺寸在指定方向上呈递减趋势,所...

【专利技术属性】
技术研发人员:胡勇潘赛超严志祥
申请(专利权)人:深圳瑞吉生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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