一种在计算机上的用户图形界面，其提供对位置特定数据的分析以及对分析结果的呈现，用于由用户进行视觉比较。将分析结果视觉呈现为图标，所述图标被再划分成区域且被排列，使得用户能够将每个图标与数据位置相关联。所述图标和区域中的结果的视觉呈现允许用户在视觉上根据位置比较在两个或者更多个数据集中的分析结果。所述图形用户界面还提供通过用户与所述分析的图形表示的交互而对所述分析的定义和调整。在一些情况中，所述结果的视觉呈现跟踪分析调整，因此用户可以视觉地观察调整对结果的影响。描述了一种用于与界面交互以定义分析并且表示结果的方法以及一种使用界面呈现两个或者更多个数据集的方法。所述界面可以用于分析并且视觉地比较来自许多源的位置特定数据的结果，且所述界面在流式细胞术应用中被示出。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术一般地涉及分析、显示和视觉比较位置特定的多参数数据集，更具体地，涉 及分析、显示和视觉比较由对生物样本的细胞术询问(cytometric interrogation)而得到 的数据集。
技术介绍
结合数字计算机和数字控制技术的最新发展，分析仪器被设计成自动询问多个样 本并且在询问期间测量两个或更多个参数。在典型的测量方案中，将样本放置于载体上的 位置处并且将载体载入到自动询问所述位置的仪器中。由于每个被询问的样本位于样本载 体上的已知位置处，因此可以将所收集的数据精确地称为位置特定数据。也可以由仪器阵 列产生位置特定数据，所述仪器阵列中的每个仪器以相对于其它仪器的已知的空间关系来 放置。 现代细胞仪是设计成用于自动分析载体上的多个样本的仪器的代表。这些设备通 常通过用一个或者多个激励光束照亮颗粒以及检测由颗粒-光束的相互作用产生的有色 光脉冲来询问含颗粒的样本。流式细胞仪聚焦所述激励光以定义在流式管中的至少一个激 励体积并且由流过管的流体使所述颗粒传输穿过所聚焦的光。扫描细胞仪中的颗粒基本上 是静止的，使所聚焦的激励光扫描经过所述颗粒。在两类仪器中，均可以通过组合不同波长 的光束形成多色激励光束。所述颗粒的信息通过有色光脉冲的波长、幅值和形状来提供。 细胞仪可以用于询问含颗粒的生物样本，所述生物样本包含从活体器官得到的分 子。这种样本中的颗粒可以由固体、液体或者气体介质包围且通常具有附着于所述颗粒 的荧光材料以便于它们的询问。商用的流式细胞仪包括毛细管流式仪器(诸如由位于加 利福尼亚州(CA)海达德市(Hayward)的Guava Technologies制造的EasyCyte-Plus和 PCA-96)以及传统鞘流式仪器(诸如由位于加利福尼亚州圣何西市的BDBiosciences制造 的FACSCalibur)。由位于马萨诸塞州剑桥市的Compucyte制造的iColor成像细胞仪是代 表性的扫描细胞仪。 高级应用需要具有大量检测器的细胞仪，如在Nature Reviewlmmunology (2004) 第4期第649 655页中的Seventeen-colour FlowCytometry(作者S. P. Perfetto 等)及在Nature Medicine (2003)第9期第112 117页中的Beyond Six Colors, a New Era in Flow Cytometry(作者S. C. DeRosa等)中所描述的细胞仪。在2004年1月27 日授予Clifford A. Oostman等人的美国专利6， 683， 357描述了用于高级应用的具有反射 滤波器系统的代表性的多激光细胞仪系统。Oostman的该专利的实施例可具有三个或者更多个激励体积以及多于十二个的检测器。 由于其复杂性，通常使用数字计算机来分析由使用细胞仪对多个样本之一进行的 询问所产生的数据。用于细胞术数据分析的商用软件包包括来自加利福尼亚州洛杉矶市的 DeNovo Software的FCS Express、来自斯坦福Shared FCS facility且经由加利福尼亚州 斯坦福市的斯坦福大学许可的Flow JO以及来自加利福尼亚州圣何塞市的BD Bioscience 的CellQuestPR0。在2001年l月23日颁发给Mario Roederer等的美国专利No. 6， 178,382 以及L. Herzenberg等在Nature Immunology (2006年7月，第7期，第681 685页)中发 表的Interpreting flow cytometry data :aguide for the perplexed，，中也公开了有关 细胞术数据分析的技术。
技术实现思路
本专利技术针对向用户呈现输出数据以实现两个或者更多个数据集的视觉比较。本发 明还针对与提供这种比较的图形界面进行交互。 根据专利技术的一个实施例，用于计算机系统的图形用户界面(GUI)在多元位置特定 的热图的上下文中视觉地表示两个或者更多个输出数据集的数据。所述热图包括代表已经 被询问过以获得位置特定输入数据的样本位置组的图标，所述位置特定输入数据被进行分 析以产生输出数据集。所述热图中图标的空间排列在视觉上类似于样本的物理排列，以使 得每个图标与至少一个样本位置视觉关联。 此外，将至少一个所述图标划分成若干区域，以使得可以在不同的区域视觉地表 示来自不同数据集的数据且对它们进行比较。在某些实施例中，所述图标的形状可以与样 本位置的形状基本上相同，可以将所有的图标划分成区域，或者所述样本和图标的排列可 以是相同的。在其他实施例中，所述输出数据集可以包括来自两个或者更多个样本的数据 且所述区域的数量可以等于所分析的数据集的数量。可以由用户将数据集分配给所述图标 的区域以及由视觉色调或者颜色来表示数据值。可以通过在所述色调或者颜色上叠加阴影 线图案或者通过使用所述色调或者颜色代表所表示的量的对数来进一步增强所述色调或 者颜色表示的数字分辨率。可以从使用流式细胞仪或者扫描细胞仪对含颗粒的生物样本的 询问而得到所述数据集。 在替选实施例中，图形用户界面显示了由对样本排列中的样本进行询问而得到的 数据集分析的表示，并且也显示了所述分析的结果的表示。该实施例包括应用于数据集以 产生结果的至少一个分析的门或者可替选的图形表示。所述分析具有至少一个参数，用户 通过与图形呈现交互来控制所述参数，并且使用多元位置特定的热图向所述分析的结果提 供至少一个附加结果集。在热图中视觉地表示与参数的变化相关联的结果的变化。可选择 地，可以从菜单选择所述参数或者可以通过改变图形中的一、二、三维图像的形状来调整所 述参数。所述分析结果的视觉表示也可以跟踪分析参数的变化，从而允许用户观察与参数 的变化相关联的输出数据的变化。在热图中所分析和呈现的输入数据可以从使用流式或者 扫描细胞仪对含颗粒的生物样本的询问而得到。 本专利技术的另一方面涉及与图形界面交互。用户通过定义至少一个分析、指定用于 所述分析的测量单位、将所述分析应用于数据集以产生结果以及在图标区域中表示所述结 果来与界面交互。该方法可以应用于分析以及显示通过使用流式或者扫描细胞仪对含颗粒5生物样本的询问而产生的数据的分析结果。 本专利技术还被实现为在计算机显示器上呈现两个或者更多个数据集，用于由用户进 行视觉比较，其中，所述数据集由对样本排列的询问的分析得到。所述呈现包括将所述样本 排列与显示器中的视觉图标进行映射，使得每个图标与至少一个样本相关联，并且每个视 觉图标与其他图标的空间关系类似于与所述视觉图标相关联的样本与其他样本的空间关 系，将所述图标再分成区域，且在所述图标的唯一区域中视觉地表示每个数据集。这种呈现 可以用于呈现从使用流式或者扫描细胞仪对含颗粒的生物样本的询问而得到的数据。附图说明 尽管所附权利要求阐明了本专利技术的具有特定性的特征，然而根据以下结合附图的详细描述可以最好地理解本专利技术及其目标和优势，其中 图1示出了用于收集、划分以及检测细胞仪中的光的光学系统。图2示出了在细胞仪数据集的分析中使用的门控直方图。 图3示出了在细胞仪数据集的分析中使用的门控点阵图(dot plot)本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种用于计算机系统的图形用户界面，提供由对样本排列的询问而得到的数据集的分析的视觉表示，其中所述视觉表示使得能够识别所述数据集之间的关系，所述界面包括：图标排列，类似于所述样本排列，以使得每个图标与样本中的至少一个视觉关联；和被划分成区域的所述图标中的至少一个，所述图标的每个区域提供关于数据集的分析的信息，其中所述数据集包括由对与所述图标视觉关联的样本的询问而得到的数据。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】US 2007-4-17 60/912,361一种用于计算机系统的图形用户界面，提供由对样本排列的询问而得到的数据集的分析的视觉表示，其中所述视觉表示使得能够识别所述数据集之间的关系，所述界面包括图标排列，类似于所述样本排列，以使得每个图标与样本中的至少一个视觉关联；和被划分成区域的所述图标中的至少一个，所述图标的每个区域提供关于数据集的分析的信息，其中所述数据集包括由对与所述图标视觉关联的样本的询问而得到的数据。2. 根据权利要求1所述的图形用户界面，其中将所有图标均划分成区域，每个区域表 示数据集的分析，所述数据集包括来自与所述图标视觉关联的样本的数据。3. 根据权利要求1所述的图形用户界面，其中样本和图标的排列相同。4. 根据权利要求1所述的图形用户界面，其中每个数据集包括由对两个或者更多个样 本的询问而得到的数据。5. 根据权利要求1所述的图形用户界面，其中每个图标包括的区域的个数等于所分析 的数据集的个数，所述所分析的数据集包括由对与所述图标视觉关联的样本的询问而得到 的数据。6. 根据权利要求1所述的图形用户界面，其中所述样本是含颗粒的生物样本。7. 根据权利要求1所述的图形用户界面，其中使用流式细胞仪和扫描细胞仪中的一种 来询问所述样本。8. 根据权利要求1所述的图形用户界面，其中所述信息的视觉表示是颜色和视觉色调 中之一的变化。9. 根据权利要求8所述的图形用户界面，其中在所述视觉表示之上叠加阴影线图案。10. 根据权利要求8所述的图形用户界面，其中所述视觉表示与所述信息呈对数关系。11. 根据权利要求1所述的图形用户界面，还包括每个所述数据集的表示，以使得可以 由用户将关于每个所述数据集的分析的信息分配给所述区域，使所述表示中的每一个与所 述区域中的一个相关联。12. 根据权利要求1所述的图形用户界面，其中使所述图标成形为在视觉上看起来具 有与所述样本基本上相同的形状。13. —种用于计算机的图形用户界面，用于定义由对样本排列中的样本进行询问而得 到的数据集的分析并且视觉表示所述分析的结果，其中所述视觉表示使得能够识别不同数 据集之间的关系，所述界面包括应用于数据集以生成结果集的分析的图形呈现，所述分析...
【专利技术属性】
技术研发人员：阿默杜约瑟夫卡皮奥内，雷勒菲弗，尼尔基尔科因，大卫安德鲁京，乔治J狄克逊，
申请(专利权)人：番石榴技术公司，
类型：发明
国别省市：US[美国]
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