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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物工程,具体涉及木薯memyb基因、受ga诱导myb转录因子功能验证的方法。
技术介绍
1、木薯(manihot esculenta crantz)是世界三大薯类作物之一,起源于热带美洲,因其适应性强,耐旱、耐贫瘠等优势而被广泛栽培于热带和部分亚热带地区,是热带湿地低收入农户的主要食粮。自2008年国家木薯产业技术体系成立以来,越来越多的科研工作者致力于木薯研究。木薯全产业链的研究包含木薯种质资源、木薯遗传育种、木薯栽培、木薯采后加工等方面。而关键基因的发掘对木薯育种乃至全产业链的研究有重要意义。myb转录因子是植物代谢网络中最重要的转录调控因子之一,控制植物的生长发育、信号转导、次生代谢以及在生物和非生物胁迫中也产生重要作用。gamyb是一个受赤霉素ga调控的编码一个r2r3-myb dna结合结构域的myb类转录因子,在植物生长发育过程中起着重要作用,是ga信号应答途径中首个被鉴定出来的正向作用的因子。ga是一类重要的植物激素,其在植物开花诱导、果实发育以及次生代谢产物的合成等过程起着重要作用。本研究提供一种受ga调控的myb转录因子,对木薯次生代谢物如花青素、类胡萝卜素等的合成调控有着重要作用。
2、基因功能验证一般采用本底遗传转化的方式,但是存在周期长的缺陷,甚至有一些植物自身遗传转化体系尚未成熟。
技术实现思路
1、针对现有技术存在的不足,本专利技术提供一种受ga诱导myb转录因子功能验证的方法,通过在真核酵母种验证基因功能,具有快速、可靠的优
2、为实现上述目的,采用以下技术方案:提供一种受ga诱导myb转录因子功能验证的方法,包括以下步骤:
3、步骤s1.megamyb基因的克隆;通过pcr方法扩增获得含有碱基序列1533bp片段的木薯megamyb基因;
4、步骤s2.megamyb基因的亚细胞定位;
5、步骤s3.megamyb基因的酵母自激活验证;
6、步骤s4.megamyb基因的ga诱导功能验证;
7、其中,步骤s4具体方法包括:
8、s4-1.采用同源重组方法,将megamyb基因构建到酵母表达载体pdr196中,构建好的重组载体分别命名为pdr196-megamyb,将重组质粒转化至酵母菌株w303;
9、s4-2.pdr196-megamyb酵母表达载体ga3诱导表达。
10、优选地,步骤s1中,采用pcr的方法,sc9木薯叶片cdna为模板,设计特异引物扩增megamyb基因,全长扩增引物的正向引物megamyb-f为atgagcaaaatgacaaatgg,反向引物megamyb-r为ctagcattcgctatcaatat。
11、优选地,步骤s2中,megamyb基因的亚细胞定位引物的正向引物megamyb-gfp-f为
12、agtggtctctgtccagtcctatgagcaaaatgacaaat,反向引物megamyb-gfp-r为
13、ggtctcagcagaccacaagtctagcattcgctatcaatat。
14、优选地,步骤s3中,megamyb基因的酵母自激活引物的正向引物megamyb-bd-f为
15、atggaggccgaattcatgagcaaaatgacaaat,
16、反向引物megamyb-bd-r为
17、cgacggatccccgggctagcattcgctatcaatat。
18、优选地,步骤s4-1具体方法包括:
19、s4-1-1.制备w303感受态细胞
20、保存的w303菌种在固体培养基ypda上划线,30℃培养3天,挑取单菌落接种至ypda液体培养基中,od600达到0.4~0.5后,3000g离心5分钟,弃去上清,用10ml溶液a重悬菌体,3000g离心5分钟,弃去上清;在沉淀中加入1ml1*te/liac进行重悬,即获得酵母感受态细胞,按50μl分装于无菌冻存管备用;
21、s4-1-2.转化w303
22、配置预混液,取360μl预混液加入感受态细胞w303中,高速混匀,使酵母细胞完全悬浮于液体中;置于30℃水浴热激45~60分钟,每10-15分钟混匀一次,结束后3000g离心3分钟,弃上清,用0.9%nacl重悬后涂于sd+葡萄糖固体板上,30℃倒置培养2~3天。
23、优选地,步骤s4-2具体方法为:挑选阳性克隆加入到sd/-ura液体培养基中,30℃,220rpm摇动培养过夜,调整至od600至1.0,依次稀释10倍,100倍,1000倍,分别取5μl点在sd/-ura+10mm ga3平板上,待吸收完全后30℃培养箱中培养3天;以正常培养作为对照,比较转pdr196-megamyb和pdr196空载体质粒的酵母菌株的生长情况;说明megamyb在能在ga3条件下生长比对照好。
24、优选地,megamyb基因的酵母功能验证引物的正向引物megamyb-pdr196-f为
25、atataccccagcctcgatgagcaaaatgacaaat,反向引物megamyb-pdr196-r为
26、cgataagcttgatatcctagcattcgctatcaat。
27、本专利技术另一目的在于提供一种木薯megamyb基因,采用pcr方法扩增得到其核苷酸序列如seq id no:1所示的木薯megamyb基因。
28、本专利技术具有以下的有益效果:
29、1.本专利技术通过pcr方法,设计全长扩增引物扩增获得含有碱基序列1533bp片段的木薯megamyb基因。
30、2.本专利技术通过设计megamyb的亚细胞定位引物,megamyb定位在细胞核中。
31、3.本专利技术通过设计megamyb的自激活引物,采用酵母自激活验证方法,显示与pgbkt7(bd)-megamyb对pgadt7(ad)无激活功能,与空ad/bd一致,不存在互作关系,即megamyb无自激活活性。
32、4.本专利技术通过设计megamyb的酵母功能验证引物,采用ga诱导功能验证方法,以正常培养作为对照,比较转pdr196-megamyb和pdr196空载体质粒的酵母菌株的生长情况。结果显示pdr196-megamyb在ga3条件下生长比对照好,megamyb能受ga诱导。
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1.一种受GA诱导的木薯MYB转录因子功能验证方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的受GA诱导的木薯MYB转录因子功能验证方法,其特征在于:步骤S1中,设计特异引物扩增MeGAMYB基因,全长扩增引物的正向引物MeGAMYB-F为ATGAGCAAAATGACAAATGG,反向引物MeGAMYB-R为CTAGCATTCGCTATCAATAT。
3.根据权利要求1所述的受GA诱导的木薯MYB转录因子功能验证方法,其特征在于:步骤S2中,MeGAMYB基因的亚细胞定位引物的正向引物MeGAMYB-GFP-F为AGTGGTCTCTGTCCAGTCCTATGAGCAAAATGACAAAT,反向引物MeGAMYB-GFP-R为GGTCTCAGCAGACCACAAGTCTAGCATTCGCTATCAATAT。
4.根据权利要求1所述的受GA诱导的木薯MYB转录因子功能验证方法,其特征在于:步骤S3中,MeGAMYB基因的酵母自激活引物的正向引物MeGAMYB-BD-F为ATGGAGGCCGAATTCATGAGCAAAATGACAAAT,反
5.根据权利要求1所述的受GA诱导的木薯MYB转录因子功能验证方法,其特征在于,步骤S4-1具体方法包括:
6.根据权利要求1所述的受GA诱导的木薯MYB转录因子功能验证方法,其特征在于,步骤S4-2具体方法为:挑选阳性克隆加入到SD/-Ura液体培养基中,30℃,220rpm摇动培养过夜,调整至OD600至1.0,依次稀释10倍,100倍,1000倍,分别取5μL点在SD/-Ura+10mM GA3平板上,待吸收完全后30℃培养箱中培养3天;以正常培养作为对照,比较转pDR196-MeGAMYB和pDR196空载体质粒的酵母菌株的生长情况;说明MeGAMYB在能在GA3条件下生长比对照好。
7.根据权利要求6所述的受GA诱导的木薯MYB转录因子功能验证方法,其特征在于:MeGAMYB基因的酵母功能验证引物的正向引物MeGAMYB-pDR196-F为ATATACCCCAGCCTCGATGAGCAAAATGACAAAT,反向引物MeGAMYB-pDR196-R为CGATAAGCTTGATATCCTAGCATTCGCTATCAAT。
8.一种木薯MeGAMYB基因,其特征在于:采用权利要求1的PCR方法扩增得到其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的木薯MeGAMYB基因。
...【技术特征摘要】
1.一种受ga诱导的木薯myb转录因子功能验证方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的受ga诱导的木薯myb转录因子功能验证方法,其特征在于:步骤s1中,设计特异引物扩增megamyb基因,全长扩增引物的正向引物megamyb-f为atgagcaaaatgacaaatgg,反向引物megamyb-r为ctagcattcgctatcaatat。
3.根据权利要求1所述的受ga诱导的木薯myb转录因子功能验证方法,其特征在于:步骤s2中,megamyb基因的亚细胞定位引物的正向引物megamyb-gfp-f为agtggtctctgtccagtcctatgagcaaaatgacaaat,反向引物megamyb-gfp-r为ggtctcagcagaccacaagtctagcattcgctatcaatat。
4.根据权利要求1所述的受ga诱导的木薯myb转录因子功能验证方法,其特征在于:步骤s3中,megamyb基因的酵母自激活引物的正向引物megamyb-bd-f为atggaggccgaattcatgagcaaaatgacaaat,反向引物megamyb-bd-r为cgacggatccccgggctagcattcgctatcaatat。
5.根...
【专利技术属性】
技术研发人员:罗秀芹,韦卓文,薛晶晶,蔡杰,安飞飞,陈松笔,张贝,罗秀平,
申请(专利权)人:中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,
类型:发明
国别省市:
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