【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息学和深度学习,具体是一种融合门控机制与对比学习的化合物-蛋白质相互作用(compound-protein interaction, cpi)预测模型。该模型旨在解决现有cpi预测方法在特征提取和信息融合方面的局限性,通过引入门控机制和对比学习技术,提高cpi预测的准确性和可靠性,从而加速新药研发进程,降低药物研发成本。本专利技术所涉及的涵盖了化合物与蛋白质相互作用的计算预测,包括但不限于生物化学实验方法、基于结构的计算方法以及基于机器学习的预测方法。在此基础上,本专利技术提出了一种新的计算模型,该模型结合了深度学习中的门控机制和对比学习技术,能够更有效地提取和融合化合物与蛋白质的特征信息,实现对cpi的精确预测。
技术介绍
1、本部分的陈述仅仅是提供了与本专利技术相关的
技术介绍
信息,并不必然构成在先技术。在生物医药和药物研发领域,化合物-蛋白质相互作用(compound-proteininteraction, cpi)的预测是药物发现过程中的一个关键环节。cpi的准确预测有助于科研人员快速筛选潜在的药物候选分子,从 ...
【技术保护点】
1.一种融合门控机制与对比学习的化合物-蛋白质相互作用预测方法,其特征是,包括如下过程:
2.如权利要求1所述的一种融合门控机制与对比学习的化合物-蛋白质相互作用预测方法,其特征是,所述编码层对氨基酸序列进行特征提取时,采用n-gram方法对其进行分割,并通过长短期记忆网络(LSTM)捕捉序列中的有序性和长期依赖性。
3.如权利要求1所述的一种融合门控机制与对比学习的化合物-蛋白质相互作用预测方法,其特征是,所述编码层对化合物分子进行特征提取时,利用图神经网络(GNN)提取其原子特征和分子结构信息,充分捕捉分子图中的拓扑关系和局部结构。
...【技术特征摘要】
1.一种融合门控机制与对比学习的化合物-蛋白质相互作用预测方法,其特征是,包括如下过程:
2.如权利要求1所述的一种融合门控机制与对比学习的化合物-蛋白质相互作用预测方法,其特征是,所述编码层对氨基酸序列进行特征提取时,采用n-gram方法对其进行分割,并通过长短期记忆网络(lstm)捕捉序列中的有序性和长期依赖性。
3.如权利要求1所述的一种融合门控机制与对比学习的化合物-蛋白质相互作用预测方法,其特征是,所述编码层对化合物分子进行特征提取时,利用图神经网络(gnn)提取其原子特征和分子结构信息,充分捕捉分子图中的拓扑关系和局部结构。
4.如权利要求1所述的一种融合门控机制与对比学习的化合物-蛋白质相互作用预测方法,其特征是,所述门控机制通过sigmoid激...
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