【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及破膜抗菌肽的筛选方法，具体涉及一种基于机器学习的破膜抗菌肽预测筛选方法，属于生物信息。
技术介绍
1、抗菌肽是一类广泛存在于生物体内天然免疫系统的短肽，其作用机制多样，最主要的是破坏细胞膜，这也是抗菌肽区别于传统小分子抗生素的主要特征。由于抗生素耐药性的加速增长和致病菌的全球扩张，寻找具有广谱杀菌能力且不易引发耐药性的抗菌肽的需求日渐紧迫。破膜抗菌肽具有靶向结合细胞膜与破坏细胞膜的能力，这一特殊的抑菌机制使得抗菌肽具有成为新一代抗菌药物的潜力，可以治疗癌症、细菌与病毒感染等疾病，具有巨大的市场潜力。随着人工智能技术的发展，人们开发具有识别抗菌肽能力的机器学习模型，并从基因组或蛋白质组中成功挖掘出了一系列全新抗菌肽。但这些抗菌肽的具体作用机制需要进一步测定，目前尚无方法直接筛选具有破坏细胞膜机制的抗菌肽。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供一种筛选具有破坏细胞膜机制抗菌肽的方法，并基于机器学习预测其破膜效果。
2、为实现上述目的，本专利技术提出的技术方案是：一...
【技术保护点】
1.一种破膜抗菌肽的预测筛选方法，包括如下步骤：
2.如权利要求1所述的破膜抗菌肽的预测筛选方法，其特征在于，步骤A1从数据库APD3、DBAASP、YADAMP、SATPdb中整理出一定长度区间、带正电、预测为具有膜接触能力的多肽序列，组成正数据集；对Uniref数据库使用关键词检索序列，去除与“抗菌肽”相关的所有序列，获得一定长度区间的多肽序列组成负数据集；正、负数据集序列数量的比例为1:5～1:10。
3.如权利要求2所述的破膜抗菌肽的预测筛选方法，其特征在于，步骤A1中组成正、负数据集的多肽序列长度为10-40个氨基酸残基。
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