一种基于mNGS技术检测微生物基因组RNA的方法技术

技术编号:44553923 阅读:35 留言:0更新日期:2025-03-11 14:16
本发明专利技术公开了一种基于mNGS技术检测微生物基因组RNA的方法。本发明专利技术提供构建RNA测序文库的方法,包括如下:A1)将RNA样本进行片段化,得到片段化RNA;A2)将所述片段化RNA在如下多酶反应体系中进行反转录和末端修复反应,得到末端平整且含A碱基的双链cDNA;A3)将所述末端平整且含A碱基的双链cDNA依次进行连接接头和PCR扩增,得到RNA测序文库。本发明专利技术技术方案操作简单耗时短,反应条件和DNA文库构建相同,可以同时操作和反应,且起始量100pg RNA,满足微生物检测的日常需求。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物,涉及一种基于mngs技术检测微生物基因组rna的方法。


技术介绍

1、高通量测序技术在微生物检测领域的广泛应用使得微生物检测变得越来越方便、快捷。该技术对于传统检测方法无法准确鉴定的微生物(包括新发现微生物物种)也能做到精准鉴别。但目前对于微生物基因组rna的检测仍然存在一些问题。

2、目前宏基因组二代测序(mngs)中使用的rna文库构建方法,大多源自rnaseq的方法。提取纯化后得到的rna,需要经过反转录步骤获取dna。反转录包括cdna第一条链合成和cdna的第二链合成这两个步骤。然后按照dna的方式进行建库。dna建库又包括核酸片段化、末端修复、加a、接头连接、pcr扩增等步骤。该方法发展时间最长,建库效果最好。但是实验周期长(可能>6小时)。由于需要先反转录,再建库。整个流程比从dna开始复杂了很多。如果一个实验人员既有dna建库需求,又有rna文库构建需求,由于不能同时进行,会极大的增加工作量。

3、由于rna天然存在的不稳定性,经过众多从业者的努力,rna的片段化可以使用加热的方式,在反转录本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种构建RNA测序文库的方法,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:

4.根据权利要求1-3中任一所述的方法,其特征在于:

5.根据权利要求1-4中任一所述的方法,其特征在于:

6.根据权利要求1-5中任一所述的方法,其特征在于:所述RNA样本初始量为10pg-500ng。

7.由权利要求1-6任一所述方法制备的RNA测序文库。

8.一种检测待测样本是否含有微生物或其基因组RNA的方法,包括如下步骤:

9.一种构建权利要求7所...

【技术特征摘要】

1.一种构建rna测序文库的方法,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:

4.根据权利要求1-3中任一所述的方法,其特征在于:

5.根据权利要求1-4中任一所述的方法,其特征在于:

6.根据权利要求1-5中任一所述的方法,其特征在于:所述rna样本初始量为10pg-500ng。

7...

【专利技术属性】
技术研发人员:林永权黄涛马珍子宫艳萍
申请(专利权)人:天津华大医学检验所有限公司
类型:发明
国别省市:

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1