一种基于元路径的微生物-疾病关联预测方法技术

技术编号:43985904 阅读:10 留言:0更新日期:2025-01-10 20:08
本发明专利技术提供一种基于元路径的微生物‑疾病关联预测方法,包括如下步骤:S1、分别计算疾病、微生物和药物的相似性;S2、基于微生物、疾病和药物各自的同构网络构建包含微生物节点、疾病节点和药物节点的异构图;S3、通过元路径内注意力聚合微生物节点和疾病节点在同一种元路径下的特征表示;S4、得到微生物节点和疾病节点的最终表征;S5、预测微生物与疾病对的关联概率,区分存在关联关系或者无关联关系。本发明专利技术不仅采用MOSFL融合来自不同相似性网络的特征表示,还通过元路径引入节点的结构和语义信息,并通过局部注意力和全局注意力自适应聚合这些信息,对于实际疾病诊断与治疗以及后续药物的研发存在一定价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及医疗数据处理,具体而言,尤其涉及一种基于元路径的微生物-疾病关联预测方法


技术介绍

1、随着高通量测序技术和微生物组学的发展,许多研究表明微生物与人类疾病之间存在密不可分的关联关系。微生物通过参与代谢、凋亡等重要的生命进程来对人类疾病和身体健康产生影响,比如心血管疾病、自身炎症性疾病以及癌症等。当前对微生物-疾病关联关系主要分为四类。一类是微生物的改变是疾病的直接原因;另一类为微生物和疾病没有直接的关联关系,但是存在一个共同的第三方因素;第三类为疾病能够影响微生物的改变使得其能够作为疾病诊断的生物标记;最后一类为疾病能够影响微生物的改变,其反过来又进一步影响疾病的严重程度。所以,确认微生物与疾病之间的关联关系有助于加深对疾病机制的理解,提高疾病的诊断和治疗效率。如已授权专利cn109920478b等。

2、微生物-疾病关联预测有助于深入理解疾病机理,对药物研发有促进作用。然而传统生物实验方法消耗大量时间及财力,且无法满足高通量的数据需求。最新的解决方法是采用相似性计算方法,计算微生物之间及疾病之间的相似性关系,以构建相似性网络,本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,S1中:

3.根据权利要求1所述的基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,S2具体包括如下步骤:

4.根据权利要求1所述的基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,S3具体包括如下步骤:

5.根据权利要求1所述的基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,S4具体包括如下步骤:

6.根据权利要求1所述的基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,S5包括...

【技术特征摘要】

1.一种基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,s1中:

3.根据权利要求1所述的基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,s2具体包括如下步骤:

4.根据权利要求1所述的基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,s3具体包括如下步骤:

5.根据权利要求1所述的基于元路径的微生物-疾病关联预测方法,其特征在于,s4具体包括如下步骤:

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【专利技术属性】
技术研发人员:邹婷婷郑欣艺吴文旭刘祥玉马乔玲赵志文
申请(专利权)人:大连海事大学
类型:发明
国别省市:

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