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一种基于多模态对比学习的P-糖蛋白抑制剂和底物预测方法技术

技术编号:43965672 阅读:49 留言:0更新日期:2025-01-07 21:51
本发明专利技术公开了一种基于多模态对比学习的P‑糖蛋白抑制剂和底物预测方法,包括:构建P‑糖蛋白抑制剂和底物的数据集;利用深度学习方法构建P‑糖蛋白抑制剂和底物预测模型;输入到构建的P‑糖蛋白抑制剂和底物预测模型中,将对比损失和分类损失联合得到总损失函数,通过总损失函数训练并优化P‑糖蛋白抑制剂和底物预测模型的参数;将待预测的化合物数据输入到优化后的P‑糖蛋白抑制剂和底物预测模型,输出最终的分类结果,判断化合物是否为P‑糖蛋白抑制剂和底物。本发明专利技术提升了模型预测精度和泛化性能,并实现了模型的可解释性,为药物开发中的分子设计提供可靠的科学依据。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及深度学习预测药物性质领域,具体涉及一种基于多模态对比学习的p-糖蛋白抑制剂和底物预测方法。


技术介绍

1、p-糖蛋白是一种位于细胞膜上的跨膜蛋白,在肝、肾、小肠、血脑屏障等多种组织中广泛表达,参与药物的吸收、分布、代谢和排泄等过程。它负责将许多有害物质从细胞内排出到细胞外空间,但它也将许多药物推出细胞,其可显著限制或破坏许多药物的活性。鉴于p-gp在药物外排和多药耐药中的关键作用,研究p-gp抑制剂和底物的预测具有重要意义。p-gp抑制剂或底物的活性评估可以通过体内或体外实验获得,然而这些方法具有周期较长、成本高、实验条件不稳定等缺点。因此,迫切需要研发计算方法来辅助p-gp抑制剂和底物的实验筛选。

2、近年来,随着人工智能和化学信息学和发展,机器学习和深度学习方法被越来越多地应用于p-gp抑制剂和底物的预测。然而当前的研究中面临几个显著的挑战。首要挑战在于数据瓶颈,p-gp抑制剂和底物相关的研究数据由于实验环境标准难以统一、存在噪音大等特性,导致现有数据集的质量参差不齐且规模相对有限,这一现状直接限制了预测模型的准确性与泛化能力本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于多模态对比学习的P-糖蛋白抑制剂和底物预测方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于多模态对比学习的P-糖蛋白抑制剂和底物预测方法,其特征在于,步骤1)中,构建P-糖蛋白抑制剂和底物的数据集,具体包括:

3.根据权利要求1所述的基于多模态对比学习的P-糖蛋白抑制剂和底物预测方法,其特征在于,步骤2)中,所述的P-糖蛋白抑制剂和底物预测模型,具体包括:

4.根据权利要求3所述的基于多模态对比学习的P-糖蛋白抑制剂和底物预测方法,其特征在于,步骤2)中,提取分子SMILES序列特征,具体步骤包括:

5.根据权利要...

【技术特征摘要】

1.一种基于多模态对比学习的p-糖蛋白抑制剂和底物预测方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于多模态对比学习的p-糖蛋白抑制剂和底物预测方法,其特征在于,步骤1)中,构建p-糖蛋白抑制剂和底物的数据集,具体包括:

3.根据权利要求1所述的基于多模态对比学习的p-糖蛋白抑制剂和底物预测方法,其特征在于,步骤2)中,所述的p-糖蛋白抑制剂和底物预测模型,具体包括:

4.根据权利要求3所述的基于多模态对比学习的p-糖蛋白抑制剂和底物预测...

【专利技术属性】
技术研发人员:康玉张忆雪侯廷军吴佳璐吴振兴方美静
申请(专利权)人:浙江大学
类型:发明
国别省市:

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