一种用于基因编辑材料检测的方法及系统技术方案

技术编号:43965064 阅读:21 留言:0更新日期:2025-01-07 21:50
本发明专利技术的目的是提供一种用于基因编辑材料检测的方法,该方法包括:构建多种特异性识别序列;根据所述特异性识别序列对基因片段进行测序;采用SuperDecode软件对测序结果进行解码。本发明专利技术可快速对大批量样本的基因编辑结果进行检测,全方面检测基因编辑材料中所有类型的突变,同时方便不熟练运用各种计算机编程语言的科研人员能够短时间内对测序结果进行突变分析。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因编辑结果检测,具体涉及一种用于基因编辑材料检测的方法。


技术介绍

1、基因编辑结果的检测主要包括基于sanger测序的扩增子检测以及基于二代测序(next-generation sequencing,ngs)的扩增子检测。sanger测序技术能检测700到1000bp长度大小的片段,且其准确率高,因此sanger测序是目前基因型检测的金标准。同时,随着生物信息学的发展,各种基于sanger测序的突变分析软件也相继得到开发,如tide、ice、dsdecode等。但sanger测序一次只能检测一个样品,对于大规模样本的基因型鉴定,其效率低,测序成本较高,且对于复杂的突变类型以及多倍体样品,sanger测序难以检测其结果,无法满足目前各种科学研究对编辑材料基因型检测的各种需求。2006年,ngs技术的发展解决了sanger测序通量低且无法检测复杂突变类型的问题。其原理为将dna片段打断后接上接头,并固定在芯片上,通过添加含有荧光信号的dntp进行扩增,对荧光信号进行检测从而确定目的样品的基因型。长片段测序也称为第三代测序技术(third-ge本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于基因编辑材料检测的方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的一种用于基因编辑材料检测的方法,其特征在于,所述构建多种特异性识别序列包括:

3.根据权利要求1所述的一种用于基因编辑材料检测的方法,其特征在于,所述根据所述特异性识别序列对基因片段进行测序包括:

4.根据权利要求1所述的一种用于基因编辑材料检测的方法,其特征在于,所述采用SuperDecode软件对测序结果进行突变分析包括对Sanger测序结果进行突变分析,具体为:

5.根据权利要求1所述的一种用于基因编辑材料检测的方法,其特征在于,所述采用SuperDeco...

【技术特征摘要】

1.一种用于基因编辑材料检测的方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的一种用于基因编辑材料检测的方法,其特征在于,所述构建多种特异性识别序列包括:

3.根据权利要求1所述的一种用于基因编辑材料检测的方法,其特征在于,所述根据所述特异性识别序列对基因片段进行测序包括:

4.根据权利要求1所述的一种用于基因编辑材料检测的方法,其特征在于,所述采用superdecode软件对测序结果进行突变分析包括对sanger测序结果进行突变分析,具体为:

5.根据权利要求1所述的一种用于基因编辑材料检测的方法,其特征在于,所述采用superdecode软件对测序结果进行突变分析包括对ngs结果进行突变分析,具体为:

【专利技术属性】
技术研发人员:谢先荣刘耀光李福权
申请(专利权)人:华南农业大学
类型:发明
国别省市:

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