一种控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法技术

技术编号:43863800 阅读:20 留言:0更新日期:2024-12-31 18:51
本发明专利技术涉及一种控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,属于基因测序技术领域。本方法在建库时使用1对微生物qPCR引物评估核酸样本中微生物的含量(不额外增加样本处理时间与人工),并根据Ct值确定探针杂交富集时各个文库的进入量,经过探针杂交捕获富集与测序后,获得较为均一的数据量分布。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,属于基因测序。


技术介绍

1、靶向宏基因组测序(tngs)技术是一种前沿的病原微生物分子诊断方法,它凭借其灵敏性高、检测范围广的特性,在感染性疾病诊断中起到的临床意义愈加显著。相比与普通宏基因组测序(mngs),tngs在面对临床样本中微量的病原序列时,能够精准地识别并定位这些潜在的病原体,为临床工作者提供更为准确的诊断依据。

2、tngs目前的技术路径主要包括多重pcr法和探针杂交捕获法,后者通过设计特异性的探针与样本中的病原靶标进行互补结合,从而实现病原体的高效富集。与多重pcr相比,探针杂交捕获法可以在单次反应中检测更多的病原靶标,提高了检测效率和准确性。

3、然而,探针杂交捕获法在实际应用中也面临着一些挑战。由于临床样本中病原微生物含量的差异,不同样本在多样本杂交捕获过程中可能会展现出不同的富集效果。这就导致了在后续测序过程中样本间的数据量会出现严重偏差。这种偏差不仅会影响测序结果的准确性,还可能给数据分析带来极大的困难。尽管使用单样本杂交可以避免该问题,但单样本杂交本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,其特征在于,A取1-10M。

3.根据权利要求1所述的控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,其特征在于,所述的通用引物是由样本中的待测微生物物种种类所确定得到。

4.根据权利要求1所述的控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,其特征在于,所述的通用引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1-2所示,或者具有相同功能的序列。

5.根据权利要求1所述的控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,其特征在于,所述...

【技术特征摘要】

1.一种控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,其特征在于,包括如下步骤:

2.根据权利要求1所述的控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,其特征在于,a取1-10m。

3.根据权利要求1所述的控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,其特征在于,所述的通用引物是由样本中的待测微生物物种种类所确定得到。

4.根据权利要求1所述的控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,其特征在于,所述的通用引物的核苷酸序列如seq id no.1-2所示,或者具有相同功能的序列。

5.根据权利要求1所述的控制病原微生物靶向测序数据量分布的方法,其特征在于,所述的具有相同功能...

【专利技术属性】
技术研发人员:邵阳蒋文朱淼蔡旭燊郭垚
申请(专利权)人:迪飞医学科技南京有限公司
类型:发明
国别省市:

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