肉牛APOB基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法技术

本发明专利技术适用于肉牛分析技术领域，提供了肉牛APOB基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法，包括以下具体操作步骤：S1、样品选取：选择三个中国肉牛品种：CYH，中国草原红牛，n＝98；YH，延黄牛，n＝113；YB，延边牛，n＝109，均为各个牛场30月龄的核心群母牛；S2、采样：采集牛尾静脉血，本发明专利技术肉牛APOB基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法，通过实验探索了APOB基因在肉牛生产性能和拷贝数变异的关联性分析，为肉牛的遗传改良提供了新的分子标记和潜在的育种目标，同时，使用公共数据库的全基因组测序结果进行基因选择，不仅可以减少人力物力的投入，还可以利用高质量的数据资源，避免数据资源的浪费。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及肉牛分析，更具体地说，它涉及肉牛apob基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法。

技术介绍

1、拷贝数变异是一种基因组结构变异，通过改变基因剂量和转录结构等来调节有机体的可塑性，是个体表型多样性和群体适应性进化的主要遗传基础之一，目前，拷贝数变异也用于动物育种中，西北农林科技大学反刍动物全基因组拷贝数变异数据库建成，构建了反刍动物拷贝数变异数据集，并对其遗传与进化机制进行了解析，发现在群体高度分化的拷贝数变异数据集，与反刍动物的免疫、蜱虫抗性、耐药性和肌肉发育等多种重要的生命活动相关，可用于指导分子标记育种，在荷斯坦奶牛中从47头荷斯坦公牛的阵列比较基因组杂交数据中鉴定出24个cnvrs与母牛犊怀孕率显著相关，在杜洛克猪中结合gwas和cnv分析发现了与活产仔猪数量相关的16个基因组区域。

2、利用全基因组选择信号技术鉴定波尔山羊特定的结构变异并分析其肌肉发育相关候选基因遗传基础，结果发现17号染色体1.1mb的重复拷贝结构变异与波尔山羊骨骼肌发育相关的区域，动脉粥样硬化的形成主要与血浆中的脂蛋白颗粒有关，这些颗粒中的每一个都含有本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.肉牛APOB基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法，其特征在于：包括以下具体操作步骤：

2.根据权利要求1所述的肉牛APOB基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法，其特征在于：所述S1中测量试验牛的表型指标，包括体重(BW)、体高(BH)、体斜长(BL)、胸围(HG)、腹围(AC)、背膘厚(BA)和眼肌面积(EM)，用于进一步联合分析。

3.根据权利要求2所述的肉牛APOB基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法，其特征在于：所述DNA浓度及纯度用Nanodrop超微量分光光度计进行检测，将1μL样品点在仪器的上样口上，盖上盖子，仪器会自动检测显示数据，具体操作...

【技术特征摘要】

1.肉牛apob基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法，其特征在于：包括以下具体操作步骤：

2.根据权利要求1所述的肉牛apob基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法，其特征在于：所述s1中测量试验牛的表型指标，包括体重(bw)、体高(bh)、体斜长(bl)、胸围(hg)、腹围(ac)、背膘厚(ba)和眼肌面积(em)，用于进一步联合分析。

3.根据权利要求2所述的肉牛apob基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法，其特征在于：所述dna浓度及纯度用nanodrop超微量分光光度计进行检测，将1μl样品点在仪器的上样口上，盖上盖子，仪器会自动检测显示数据，具体操作步骤如下：

4.根据权利要求1所述的肉牛apob基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法，其特征在于：所述s5中实时荧光定量pcr检测基因cnv：以三个肉牛品种的血液dna为模板，以btf3为内参进行实时荧光定量pcr，检测拷贝数的变异。反应体系为20μl：sgexcelfastsybr预混液10μl，pcr grade h2o 8μl，上、下游引物(10μmol/l)各0.5μl，模板1μl，反应条件：95℃预变性5min，95℃变性10s，60℃退火60s，72℃延伸20s，共45个循环，95℃、5s，65℃、1min。

5.根据权利要求1所述的肉牛apob基因拷贝数变异与生长性状的关联分析方法，其特征在于：所述s6中利用log22-△△c(t)和2-△△c(t)法...

【专利技术属性】
技术研发人员：罗晓彤，韩越，刘洪亮，张聪聪，李轩宇，刘基伟，李春宇，李瑞冬，李胜男，朱永超，
申请(专利权)人：吉林省农业科学院中国农业科技东北创新中心，
类型：发明
国别省市：