一种基于基因杂交捕获方法监测沉积物中入侵鱼种eDNA的探针及应用技术

本发明专利技术属于环境生态监测技术领域，本发明专利技术提供一种杂交捕获探针组合，包括如SEQ ID No.1～169所示序列的探针，该探针组合能杂交捕获入侵鱼种罗非鱼和/或食蚊鱼线粒体DNA。本发明专利技术的探针组合稳定性高、灵敏度高、容错性高、制备成本低，可在复杂的环境样本中精确地富集目标物种罗非鱼和/或食蚊鱼的线粒体序列，富集到的线粒体序列覆盖范围广。本发明专利技术的探针组合可应用于监测水体环境中的入侵鱼种罗非鱼和食蚊鱼，对于保护本地鱼类和生物多样性，评估水体生态等方面具有很好的应用价值。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于环境生态监测。更具体地，涉及一种基于基因杂交捕获方法监测沉积物中入侵鱼种edna的探针及应用。

技术介绍

1、食蚊鱼是世界百种恶性入侵物种之一，它的入侵导致了许多土著水生生物濒危。而罗非鱼有很强的适应能力和繁殖能力，所以常会对当地的水生环境产生影响，对其他生物造成威胁。食蚊鱼与罗非鱼均是我国国内常见的水生外来入侵物种，因此对其进行监测具有重要意义。

2、环境dna(edna)技术可以通过对样本中的dna序列提取和扩增，是一种新兴的高效的技术，大大缩短了人工监测所需要的成本。虽然目前基于pcr扩增的edna可以有效实现入侵物种的检测，但由于分类群之间的扩增不均衡(pcr偏倚)和假阳性(pcr错误突出导致的序列错误)而遭受偏差，进而导致生物多样性清单存在偏差。其次，短片段会(通常为150-450个碱基对)阻碍用于全面系统发育重建的数据使用。此外，不完善的参考数据库会限制序列的分配。因此，需要高质量的参考数据来改善一般的分类识别。宏基因组测序在一定程度上可以解决这些局限性，但这种方法成本较高、耗时耗力且同样会受到参考数据库的限制。...

【技术保护点】

1.一种入侵鱼种罗非鱼和/或食蚊鱼线粒体DNA的杂交捕获探针组合，其特征在于，包括如SEQ ID No.1～169所示序列的探针。

2.根据权利要求1所述杂交捕获探针组合，其特征在于，所述探针的5’端标记生物素。

3.权利要求1或2所述杂交捕获探针组合在杂交捕获罗非鱼和/或食蚊鱼线粒体DNA中的应用，或在制备杂交捕获罗非鱼和/或食蚊鱼线粒体DNA产品中的应用。

4.权利要求1或2所述杂交捕获探针组合在鉴定罗非鱼和/或食蚊鱼中的应用，或在制备鉴定罗非鱼和/或食蚊鱼产品中的应用。

5.权利要求1或2所述杂交捕获探针组合在确定罗非鱼和/或食蚊鱼存...

【技术特征摘要】

1.一种入侵鱼种罗非鱼和/或食蚊鱼线粒体dna的杂交捕获探针组合，其特征在于，包括如seq id no.1～169所示序列的探针。

2.根据权利要求1所述杂交捕获探针组合，其特征在于，所述探针的5’端标记生物素。

3.权利要求1或2所述杂交捕获探针组合在杂交捕获罗非鱼和/或食蚊鱼线粒体dna中的应用，或在制备杂交捕获罗非鱼和/或食蚊鱼线粒体dna产品中的应用。

4.权利要求1或2所述杂交捕获探针组合在鉴定罗非鱼和/或食蚊鱼中的应用，或在制备鉴定罗非鱼和/或食蚊鱼产品中的应用。

5.权利要求1或2所述杂交捕获探针组合在确定罗非鱼和/或食蚊鱼存活年份及其变化中的应用，其特征在于，通过杂交捕获沉积物样本dna进行确认。

6.一种入侵鱼种罗非鱼和/或食蚊鱼线粒体dna的杂交捕获试...

【专利技术属性】
技术研发人员：李飞龙，吴竞泽，张远，李波，郭芬，杜青平，高伟，闵星月，朱星遇，
申请(专利权)人：广东工业大学，
类型：发明
国别省市：