一种新型冠状病毒的变异分析方法技术

本发明专利技术公开了一种新型冠状病毒的变异分析方法，属于病毒分析检测技术领域，本发明专利技术的目的在于解决现有技术中如何快速对病毒变异进行分析的问题。主要方法是：对新型冠状病毒进行核酸提取及检测复核；对新型冠状病毒进行全基因组靶向扩增；对新型冠状病毒进行全基因组测序；对新型冠状病毒进行基因分型；对获得的fasta文件进行序列质量评估，并对序列进行筛选；对筛选过的优质序列进行核苷酸和氨基酸突变位点进行分析。本发明专利技术从基因和蛋白分子层面分析了毒株变异规律并可以依据变异规律来对关键变异对病毒传播和适应性影响进行预测；本发明专利技术的变异方法所利用的工具都是现有的工具，可以很好的提高实效，并提供快速的初步的变异分析。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及病毒检测分析，具体涉及一种新型冠状病毒的变异分析方法。

技术介绍

1、众所周知，新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus2，sars-cov-2)的快速传播引发了全球性的公共卫生事件，其是一种rna病毒，在其广泛传播过程中以容易发生变异。其中，新冠病毒的一些变异株突破了既往感染和疫苗赋予的免疫屏障，迅速成为全球主要流行株，尤其是omicron变异株以及其变异株的分支，例如jn.1系列变异株等。为了对变异的新冠病毒进行分析，目前的研究主要是关注介导病毒入侵的刺突s蛋白区关键位点的变异趋势，包括受体结合域rbd、受体结合模体rbm、n末端结构域ntd、furin裂解点、融合肽fp等。因此，对于新型冠状病毒的变异风险评估就十分重要。

技术实现思路

1、为此，本专利技术提供一种新型冠状病毒的变异分析方法，以解决现有技术中的上述问题。

2、为了实现上述目的，本专利技术提供如下技术方案：

3、根据本专利技术的第一方面，一本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种新型冠状病毒的变异分析方法，其特征在于，具体包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的一种新型冠状病毒的变异分析方法，其特征在于，所述步骤S2的具体方法是：采用超敏新型冠状病毒全基因组捕获试剂盒与PCR仪，完成核酸反转录、新冠病毒全基因组的靶向扩增，靶向扩增采用1200bp引物体系分两个引物池完成。

3.根据权利要求2所述的一种新型冠状病毒的变异分析方法，其特征在于，所述PCR仪的PCR扩增反应条件为：98℃30s；98℃15s，63℃5min，5个循环；98℃15s，65℃4min，25个循环；72℃2min，1个循环。

4.根据权利要求1所述...

【技术特征摘要】

1.一种新型冠状病毒的变异分析方法，其特征在于，具体包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的一种新型冠状病毒的变异分析方法，其特征在于，所述步骤s2的具体方法是：采用超敏新型冠状病毒全基因组捕获试剂盒与pcr仪，完成核酸反转录、新冠病毒全基因组的靶向扩增，靶向扩增采用1200bp引物体系分两个引物池完成。

3.根据权利要求2所述的一种新型冠状病毒的变异分析方法，其特征在于，所述pcr仪的pcr扩增反应条件为：98℃30s；98℃15s，63℃5min，5个循环；98℃15s，65℃4min，25个循环；72℃2min，1个循环。

4.根据权利要求1所述的一种新型冠状病毒的变异分析方法，其特征在于，所述步骤s3的具体方法是：采用纳米孔测序平台完成新冠病毒的全基因组序列测定工作，使用快速条码测序试剂盒完成文库构建，包括dna片段化及加标签、合并含条码样本、连接测序接头、芯片预处理及上样。

5.根据权利要求4所述的一种新型冠状病毒的变异分析方法，其特征在于，所述文库的构建具体...

【专利技术属性】
技术研发人员：张然，朱丽，何建安，赵纯中，叶颖，叶健忠，崔丽丽，邓炜，张思祺，
申请(专利权)人：深圳国际旅行卫生保健中心深圳海关口岸门诊部，
类型：发明
国别省市：