癌症标志物的筛选方法及装置制造方法及图纸

本发明专利技术提供了一种用于癌症诊断的标志物的筛选方法及装置。本发明专利技术的筛选方法包括以下步骤：(1)将癌症组织样本的与癌症相关的CpG区域与对照样本的对应区域进行比较，筛选出CpG标志物组合；(2)将癌症组织样本的与癌症相关的DMR区域与对照样本的对应区域进行比较，筛选出DMR标志物组合；和(3)将所述CpG标志物组合和所述DMR标志物组合进行合并和去重处理，得到所述甲基化标志物。本发明专利技术的标志物还包括基因突变标志物采用本发明专利技术提供的筛选标志物的方法包括通过迭代算法和分型筛选法对初步的DMR进行降维处理，其能够有效筛选出具有高性能的多组学标志物组合，从而提升癌症诊断筛查的灵敏度和特异性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物医学，具体涉及一种癌症标志物的筛选方法，以及用于实施该方法的装置。

技术介绍

1、近年来基于液体活检的癌症早筛技术逐渐兴起，其因侵犯性低、准确性高的特点而备受关注。其中循环肿瘤dna(circulatingtumordna，ctdna)是肿瘤细胞死亡时释放至循环系统内的dna分子，通过检测其携带的分子信息可进一步对癌症的发生进行预测。

2、多样的高通量测序技术为血浆中ctdna的肿瘤分子信号检测打下了基础。研究者们首先对循环核酸(circulating free dna，cfdna)中微量的突变信息进行探索研究，发现这些基因突变信号虽然具有强大的标志物潜力，但其在血中比例十分低，难以精确检出，针对这一问题，研究者们开发了提高目标突变检出灵敏度的cfdna靶向测序，但依然存在早期癌症信号弱、难以检测出的局限性。

3、越来越多的研究证明癌症基因的甲基化水平异常往往伴随出现在癌症的早期，其通过调控基因的表达和沉默来参与癌症的发生发展，同时同一区域内的甲基化位点往往存在共同甲基化的现象，这进一步加强了癌症信号的识别。研究者本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种癌症标志物的筛选方法，所述筛选方法包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤(1)中，所述对照样本包括癌旁组织样本、良性病变组织样本和/或全血样本；和/或

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤(2)包括如下步骤：

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤(a1)中，所述第一簇集合包含至少2个簇，优选包含2-10个簇，更优选包含3-5个簇。

5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤(a2)中，所述筛选包括：根据贡献比为95％-100％，且满足显著性差异筛选癌症特异性低甲基化标志物；根据贡献比大...

【技术特征摘要】

1.一种癌症标志物的筛选方法，所述筛选方法包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤(1)中，所述对照样本包括癌旁组织样本、良性病变组织样本和/或全血样本；和/或

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤(2)包括如下步骤：

4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤(a1)中，所述第一簇集合包含至少2个簇，优选包含2-10个簇，更优选包含3-5个簇。

5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤(a2)中，所述筛选包括：根据贡献比为95％-100％，且满足显著性差异筛选癌症特异性低甲基化标志物；根据贡献比大于85％-90％，且满足显著性差异筛选癌症特异性低甲基化标志物。

6.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，步骤(a3)中，所述去重处理包括对贡献比相同且贡献样本相同的标志物进行去重，和/或

7.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，步骤(2)包括如下步骤：

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，步骤(b3)中，通过所述第二簇集合中每一簇的整体贡献比及统计检验的p值、deltam和方差依次做初始优先级排序，选择排序第一位的标志物；和/或

9.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述dmr标志物组合包括根据权利要求3-6中任一项所述的方...

【专利技术属性】
技术研发人员：杨玲，易鑫，管彦芳，刘涛，钟贤宇，李盼松，马梦亚，曾晓玲，
申请(专利权)人：苏州吉因加生物医学工程有限公司，
类型：发明
国别省市：