System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind()
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于微生物检测,具体涉及一种可视化快速检测猪肠病毒g型的rt-lamp引物组及试剂盒。
技术介绍
1、猪肠病毒g型(porcine enterovirus g,ev-g)属于小rna病毒科(picornaviridae)肠病毒属(enterovirus)病毒,最早的原型毒株“ukg/410/73”于1973年从英国出现皮肤症状的猪只中分离获得。各年龄段的家猪及野猪均易感,ev-g感染仔猪,可导致肠道黏膜和皮肤损伤,出现腹泻和皮肤丘疹等临床症状,同时ev-g具有很强的噬神经性,可侵染被感染仔猪的脊髓和大脑,导致仔猪出现后肢麻痹、异常兴奋等神经症状,ev-g感染对仔猪健康生长造成潜在威胁。目前,ev-g在世界范围猪群中呈现广泛流行的态势,在英国、美国、巴西、德国、匈牙利、西班牙、捷克、中国、日本、韩国、泰国、越南等国家均已被发现。
2、ev-g基因组为单股正链rna,长度约7400-7500nt,由一个开放阅读框(openreading frame,orf)和5’端、3’端非编码区(untranslated region,utr)组成,orf区编码1个多聚蛋白,被自身携带的特异性蛋白酶切割为4种结构蛋白(vp1、vp2、vp3、vp4)和7种非结构蛋白(2apro、2b、2c、3a、3b、3cpro、3dpol)。不同ev-g毒株vp1基因核苷酸序列差异度较大,据此可将ev-g分为不同的基因型,目前世界范围共发现20种基因型(ev-g-1至ev-g-20)。近年来,世界各地陆续报道了一种ev-g与猪环曲病毒(p
3、目前,关于ev-g的检测方法主要有抗体检测和核酸检测两种。抗体检测方法为基于ev-g vp2、vp3蛋白多克隆抗体的间接elisa检测方法,但elisa检测包括抗原包被、封闭、一抗孵育、酶标二抗孵育、显色和测定等多个步骤,操作过程繁琐,整体耗时较长,且血清中的特异性病毒抗体通常在病毒感染后5至10天才产生,因此,抗体elisa检测方法无法在病毒感染初期使用。核酸检测方法主要有常规rt-pcr和实时荧光定量rt-pcr方法。目前,ev-g常规rt-pcr检测方法耗时长(2至3小时),灵敏度低,检测结果需进行电泳检测才能判定。同时,ev-g的实时荧光定量rt-pcr检测方法相较于常规rt-pcr,虽然实时荧光定量rt-pcr的检测灵敏度和检测效率都有较大提高,但是实时荧光定量rt-pcr检测,需要使用荧光定量pcr仪等昂贵的仪器设备,不适合基层及现场快速检测。
4、病原的现场可视化快速检测,对于快速、准确、有效地处置疫情具有十分重要的意义,因此,现场可视化“病原快速检测技术”已成为传染病诊断、防控的重要手段。2000年,日本科学家专利技术了一种核酸扩增方法:环介导等温扩增(loop mediated isothermalamplification, lamp)技术。该方法利用bst dna聚合酶的链置换活性,针对靶基因的6个保守区域设计4条特异性引物,在64℃恒温条件下反应约1h即可完成扩增,加入环引物后还可大大缩短反应时间,仅需20至30min左右即可完成扩增过程。在反应体系中加入ph指示剂“酚红”或者“钙黄绿素和mn2+”等,通过肉眼观察反应液颜色变化,即可实现检测结果的现场判定。lamp检测方法与其它病原检测技术相比,无需昂贵的仪器设备,反应过程在恒温水浴锅中即可完成,检测速度快,肉眼即可判定结果,非常适合病原的现场快速检测,已广泛应用于多种病原微生物的检测。然而国内外尚未建立ev-g rt-lamp检测方法,极大的制约了ev-g的现场流行病学调查。因此如何克服现有技术的不足是目前微生物检测
亟需解决的问题。
技术实现思路
1、本专利技术的目的是为了解决现有技术的不足,提供一种可视化快速检测猪肠病毒g型的rt-lamp引物组及试剂盒。
2、为实现上述目的,本专利技术采用的技术方案如下:
3、一种可视化快速检测猪肠病毒g型的rt-lamp引物组,包括5条引物,分别为两条外引物、两条内引物和一条环引物;
4、所述的两条外引物为正向外引物ev-g/p5-f3和反向外引物ev-g/p5-b3;
5、所述的两条内引物为正向内引物ev-g/p5-fip和反向内引物ev-g/p5-bip;
6、所述的环引物为上游环引物ev-g/p5-lf;
7、所述5条引物的核苷酸序列如下:
8、正向外引物ev-g/p5-f3:5’-tgtacccacggccgaag-3’(seq id no.1);
9、反向外引物ev-g/p5-b3:5’-ccggaggactaccaactagc-3’(seq id no.2);
10、正向内引物ev-g/p5-fip:5’-tgagcgaaacgccaagacagattatccggccagctacttcg-3’(seq id no.3);
11、反向内引物ev-g/p5-bip:5’-gatgggtctccgcathccccacatggcgtcctatggctttc-3’(seq id no.4);
12、上游环引物ev-g/p5-lf:5’-ctttgatgytactaggcttc-3’(seq id no.5)。
13、进一步,引物组中,ev-g/p5-f3、ev-g/p5-b3、ev-g/p5-fip、ev-g/p5-bip和ev-g/p5-lf的摩尔比为1:1:4:4:3。
14、本专利技术同时提供上述可视化快速检测猪肠病毒g型的rt-lamp引物组的rt-lamp试剂盒。
15、进一步,包括rt-lamp反应预混液、阳性对照和阴性对照;
16、rt-lamp反应预混液包含:浓度为5 μm的正向外引物ev-g/p5-f3 1μl、浓度为5 μm的反向外引物ev-g/p5-b3 1μl;浓度为20 μm的正向内引物ev-g/p5-fip 1μl、浓度为20 μm的反向内引物ev-g/p5-bip 1μl;浓度为15 μm的上游环引物ev-g/p5-lf 1μl,rt-lamp反应液12.5μl和nuclease-free水4.5μl;
17、所述的阳性对照为含有ev-g扩增靶序列的重组质粒,其中,ev-g扩增靶序列的核苷酸序列见seq id no.7所示;阴性对照为nuclease-free水。
18、进一步,含有ev-g扩增靶序列的重组质粒的拷贝数为4.68×105拷贝/ul。
19、进一步,rt-lamp试剂本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种可视化快速检测猪肠病毒G型的RT-LAMP引物组,其特征在于,包括5条引物,分别为两条外引物、两条内引物和一条环引物;
2.根据权利要求1所述的可视化快速检测猪肠病毒G型的RT-LAMP引物组,其特征在于:引物组中,EV-G/P5-F3、EV-G/P5-B3、EV-G/P5-FIP、EV-G/P5-BIP和EV-G/P5-LF的摩尔比为1:1:4:4:3。
3.含有权利要求1或2所述可视化快速检测猪肠病毒G型的RT-LAMP引物组的RT-LAMP试剂盒。
4.根据权利要求3所述的含有可视化快速检测猪肠病毒G型的RT-LAMP引物组的RT-LAMP试剂盒,其特征在于,包括RT-LAMP反应预混液、阳性对照和阴性对照;
5.根据权利要求4所述的含有可视化快速检测猪肠病毒G型的RT-LAMP引物组的RT-LAMP试剂盒,其特征在于,含有EV-G扩增靶序列的重组质粒的拷贝数为4.68×105拷贝/uL。
6.根据权利要求4所述的含有可视化快速检测猪肠病毒G型的RT-LAMP引物组的RT-LAMP试剂盒,其特征在于:
>7.根据权利要求4所述的含有可视化快速检测猪肠病毒G型的RT-LAMP引物组的RT-LAMP试剂盒,其特征在于:RT-LAMP扩增的反应程序为:64℃恒温30min,80℃恒温10min终止反应。
8.一种用于非疾病诊断与治疗目的的鉴别待检病毒是否为猪肠病毒G型的方法,采用权利要求4所述的含有可视化快速检测猪肠病毒G型的RT-LAMP引物组的RT-LAMP试剂盒,其特征在于,包括如下步骤:
9.一种用于非疾病诊断与治疗目的的鉴定待检样本是否含有猪肠病毒G型的方法,采用权利要求4所述的含有可视化快速检测猪肠病毒G型的RT-LAMP引物组的RT-LAMP试剂盒,其特征在于,包括如下步骤:
...【技术特征摘要】
1.一种可视化快速检测猪肠病毒g型的rt-lamp引物组,其特征在于,包括5条引物,分别为两条外引物、两条内引物和一条环引物;
2.根据权利要求1所述的可视化快速检测猪肠病毒g型的rt-lamp引物组,其特征在于:引物组中,ev-g/p5-f3、ev-g/p5-b3、ev-g/p5-fip、ev-g/p5-bip和ev-g/p5-lf的摩尔比为1:1:4:4:3。
3.含有权利要求1或2所述可视化快速检测猪肠病毒g型的rt-lamp引物组的rt-lamp试剂盒。
4.根据权利要求3所述的含有可视化快速检测猪肠病毒g型的rt-lamp引物组的rt-lamp试剂盒,其特征在于,包括rt-lamp反应预混液、阳性对照和阴性对照;
5.根据权利要求4所述的含有可视化快速检测猪肠病毒g型的rt-lamp引物组的rt-lamp试剂盒,其特征在于,含有ev-g扩增...
【专利技术属性】
技术研发人员:李占鸿,宋建领,朱沛,张振兴,李卓然,
申请(专利权)人:云南省畜牧兽医科学院,
类型:发明
国别省市:
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。