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基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法、介质及设备技术

技术编号:42858004 阅读:25 留言:0更新日期:2024-09-27 17:23
本申请公开了一种基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法、介质及设备,涉及单细胞转录组数据分析领域。构建包含多种癌症类型的癌症组织、对应的癌旁组织以及来源于正常人体对应组织的单细胞泛肿瘤转录组图谱,有助于发现跨不同癌症类型的共同药物靶点;通过重新分群注释,能够精确区分不同细胞类型,特别是恶性细胞与正常细胞之间的差异,有助于发现针对特定细胞类型的药物;基于单细胞泛肿瘤转录组图谱,结合预处理后的细胞扰动数据矩阵,训练深度学习模型,实现了对药物处理下细胞响应的精准预测,能够快速识别泛肿瘤药物及肿瘤特异性药物,发现已上市药物和候选药物的新适应症,评估药物的副作用,发现药物的潜在作用机制。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及单细胞转录组数据分析领域,尤其涉及一种基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法、介质及设备


技术介绍

1、在癌症研究领域,肿瘤的异质性及其与微环境的相互作用是理解癌症发生、发展及临床治疗效果的关键。肿瘤不仅仅是由单一的癌细胞群体构成,而是一个由多种细胞类型及其细胞外基质组成的复杂生态系统。这种异质性在肿瘤的进展、治疗响应及耐药性方面发挥着至关重要的作用。

2、然而,当前抗肿瘤药物的大规模筛选方法仍存在显著缺陷。一方面,这些方法大多依赖于传统的转录组测序数据,无法全面捕获肿瘤内部的异质性及其与微环境的相互作用;另一方面,许多研究仍局限于单一癌症类型,忽视了泛肿瘤数据中蕴含的共性特征。这些限制不仅影响了药物筛选的精确性和有效性,还限制了新治疗策略的发现和临床应用。


技术实现思路

1、为了解决
技术介绍
中提到的至少一个技术问题,本申请的目的在于提供一种基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法、介质及设备,可以在单细胞水平实现抗肿瘤药物的大规模筛选,并解析药物的潜在作用机制及其副作用。

本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法,其特征在于,得到所述单个细胞的注释信息矩阵的步骤,包括:

3.根据权利要求2所述的基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法,其特征在于,所述针对初次分群中的上皮细胞谱系,识别并注释其中的恶性细胞的步骤,包括:

4.根据权利要求1所述的基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法,其特征在于,所述获取细胞扰动数据并对所述细胞扰动数据进行筛选,得到预处理后的细胞扰动数据矩阵的步骤,包括:

5.根据权利要求1所述的基...

【技术特征摘要】

1.一种基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法,其特征在于,得到所述单个细胞的注释信息矩阵的步骤,包括:

3.根据权利要求2所述的基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法,其特征在于,所述针对初次分群中的上皮细胞谱系,识别并注释其中的恶性细胞的步骤,包括:

4.根据权利要求1所述的基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法,其特征在于,所述获取细胞扰动数据并对所述细胞扰动数据进行筛选,得到预处理后的细胞扰动数据矩阵的步骤,包括:

5.根据权利要求1所述的基于单细胞转录组图谱的药物筛选分析方法,其特征在于,所述构建深度学习模型,并利用单细...

【专利技术属性】
技术研发人员:郭国骥张霈婧梅雨晴王雪怡傅雨婷韩晓平
申请(专利权)人:浙江大学
类型:发明
国别省市:

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