用于多重基因分型的通用组合物和方法技术

技术编号:42835125 阅读:56 留言:0更新日期:2024-09-24 21:08
本申请涉及核酸分子的多重检测。本申请提供了用荧光团和猝灭剂标记的通用型寡核苷酸,以及具有与多个变异基因座或多个核酸样品的检测普遍相匹配的靶结合区的寡核苷酸。此外,本公开还描述了通过不对称标记的扩增标记检测靶并区分靶序列的方法。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及遗传变异多靶标检测,具体涉及通过核酸杂交检测遗传变异的引物和探针以及方法。本申请还涉及诊断、预后和药品/治疗效率监测的领域。


技术介绍

1、多重rt-pcr的成本低且易使用性高,其通常通过引入几对扩增引物和检测报告探针实现(参见文献r.j.dikdan,s.a.e.marras,a.p.field,a.brownlee,a.cironi,d.a.hill,s.tyagi,multiplex pcr assays for identifying all major severe acuterespiratory syndrome coronavirus 2variants,j.mol.diagnostics.24(2022)309-319.https://doi.org/10.1016/j.jmoldx.2022.01.004)。常规rt-pcr的每个反应的测试通量是关键问题,因为pcr热循环仪的荧光通道限制在5至6个。作为可选方案,结合了基于探针的熔解曲线分析的pcr扩增解决了通量问题,因为可以通过设计具有不同熔解温度和不同荧光修饰的探针来提高测本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种用于靶核苷酸序列的多重基因分型的方法,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述M1寡核苷酸的长度为约25个至约60个碱基,所述M1寡核苷酸的与所述猝灭剂标记的通用型寡核苷酸互补的核苷酸序列的长度为约5个至约50个碱基,并且所述M1寡核苷酸的与所述靶核苷酸序列互补的核苷酸序列的长度为约5个至约50个碱基。

3.根据权利要求1所述的方法,其中所述M1寡核苷酸的与所述靶核苷酸序列互补的核苷酸序列为与所述靶核苷酸序列的约40%至100%互补。

4.根据权利要求1所述的方法,其中所述M2寡核苷酸的长度为约25个至约60个碱基,所述M2寡核苷...

【技术特征摘要】

1.一种用于靶核苷酸序列的多重基因分型的方法,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述m1寡核苷酸的长度为约25个至约60个碱基,所述m1寡核苷酸的与所述猝灭剂标记的通用型寡核苷酸互补的核苷酸序列的长度为约5个至约50个碱基,并且所述m1寡核苷酸的与所述靶核苷酸序列互补的核苷酸序列的长度为约5个至约50个碱基。

3.根据权利要求1所述的方法,其中所述m1寡核苷酸的与所述靶核苷酸序列互补的核苷酸序列为与所述靶核苷酸序列的约40%至100%互补。

4.根据权利要求1所述的方法,其中所述m2寡核苷酸的长度为约25个至约60个碱基,所述m2寡核苷酸的与所述荧光团标记的通用型寡核苷酸互补的核苷酸序列的长度为约5个至约50个碱基,并且所述m2寡核苷酸的与所述靶核苷酸序列互补的核苷酸序列的长度为约5个至约50个碱基。

5.根据权利要求1所述的方法,其中所述m2寡核苷酸的与所述靶核苷酸序列互补的核苷酸序列为与所述靶核苷酸序列的约40%至100%互补。

6.根据权利要求1所述的方法,其中所述荧光团标记的通用型寡核苷酸的长度为约15个至约35个碱基,并且所述猝灭剂标记的通用型寡核苷酸的长度为约15个至约35个碱基。

7.根据权利要求1所述的方法,其中各m1寡核苷酸和各m2寡核苷酸的熔解温度在约30℃至约80℃之间。

8.根据权利要求1所述的方法,包括:

9.根据权利要求8所述的方法,其中各m1寡核苷酸和各m2寡核苷酸的熔解温度在约30℃至约80℃之间。

10.一种用于靶核苷酸序列的多重基因分型的方法,所述方法包括:

11.根据权利要求10所述的方法,其中所述m1'寡核苷酸的长度为约25个至约60个碱基,所述m1'寡核苷酸的与所述猝灭剂标记的通用型寡核苷酸互补的核苷酸序列的长度为约5个至约50个碱基,并且所述m1'寡核苷酸的与所述靶核苷酸序列互补的核苷酸序列的长度为约5个至约50...

【专利技术属性】
技术研发人员:邢怡铭庄鑫宇
申请(专利权)人:香港科技大学
类型:发明
国别省市:

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