【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及传染病分析,尤其是涉及一种实时估算新发传染病变异病原传播优势的统计学方法。
技术介绍
1、传染病病原体(如病毒)在人群中的传播能力主要取决于其自身的传染性。病毒在自然选择的作用下,自身基因位点发生突变使其适应力增加,往往伴随毒力以及传染性的增加,使其便于在人群中持续传播。
2、由于新型变体不断增强的传染性,使以早发现、早隔离为基准制定的防控措施(如接触者追踪措施)控制疫情的效果大大降低,对各地公共卫生系统造成不小的压力。对于新发传染病的暴发,即时了解病原体在人群中的传播能力对于评估防控措施有效性、指导并改进防控策略的制定至关重要。传统上常用再生数(reproduction number [r])来表示病原体的传播能力,r的定义为由一个感染病例引起的平均二代病例数;通常采用时变再生数(time-varying reproduction number [rt])来描述病原体的实时传播能力。然而,传染病疫情的发生发展可能伴随不同变体(如sars-cov-2变异株)或不同种类病毒(如通常在冬季流行的呼吸道合胞病毒以及流
...【技术保护点】
1.一种实时估算新发传染病变异病原传播优势的统计学方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的一种实时估算新发传染病变异病原传播优势的统计学方法,其特征在于,步骤S1中,过往的不同病原株的观测比例包括原始株的观测比例和变异株的观测比例。
3.根据权利要求2所述的一种实时估算新发传染病变异病原传播优势的统计学方法,其特征在于,更新方程的表达式为:
4.根据权利要求3所述的一种实时估算新发传染病变异病原传播优势的统计学方法,其特征在于,步骤S2中,根据各变异株的观测比例分布构建变异株分布的似然函数,具体流程如下:
< ...【技术特征摘要】
1.一种实时估算新发传染病变异病原传播优势的统计学方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的一种实时估算新发传染病变异病原传播优势的统计学方法,其特征在于,步骤s1中,过往的不同病原株的观测比例包括原始株的观测比例和变异株的观测比例。
3.根据权利要求2所述的一种实时估算新发传染病变异病原传播优势的统计学方法,其特征在于,更新方程的表达式为:...
【专利技术属性】
技术研发人员:赵时,孙生志,王凯,国子豪,曹望楠,庄家俊,王开发,汤乃军,
申请(专利权)人:天津医科大学,
类型:发明
国别省市:
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