【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物医学检测。更具体地，涉及一种用于驱动基因阴性肺腺癌预后评估的试剂盒和模型。
技术介绍
1、肺癌是最常见的恶性肿瘤之一，其发病率和死亡率均居于首位，严重威胁着人类健康。肺癌患者中，约有80～85％属于非小细胞肺癌，而肺腺癌是非小细胞癌中最常见的病理类型，约占所有肺癌的40％。
2、与癌症发生发展相关的重要基因被称为驱动基因，驱动基因突变状态是靶向治疗疗效的重要预测因子。驱动基因突变，如egfr、alk、ros1、braf等的突变是肺腺癌的重要治疗靶点，但对未发现明确驱动基因突变的肺腺癌患者，目前仍缺乏有效的靶向治疗手段。因此，有必要挖掘可用于“驱动基因阴性”肺腺癌疗效预测或预后评估的标志物，建立相关的评估模型，这对患者个体化治疗方案的制定，提高治疗效果和改善病人预后方面有着十分重要的意义。
技术实现思路
1、本专利技术要解决的技术问题是如何提供一种用于驱动基因阴性肺腺癌预后评估的试剂盒和模型。
2、本专利技术的第一个目的是提供用于检测tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的试剂在肺腺癌预后评估方面的应用。
3、本专利技术的第二个目的是提供用于检测tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平
4、本专利技术的第三个目的是提供一种用于检测tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的引物组合。
5、本专利技术的第四个目的是提供一种用于肺腺癌预后评估的试剂盒。
6、本专利技术的第五个目的是提供一种用于肺腺癌预后评估的模型。
7、本专利技术的第六个目的是提供一种用于肺腺癌预后评估的系统。
8、本专利技术上述目的通过以下技术方案实现：
9、甲基化是一种常见的表观遗传学修饰，其通过影响dna的结构稳定性而调节基因的表达，从而导致蛋白的表达出现异常。甲基化异常已被证明与多种恶性肿瘤的发生和发展密切相关，部分特异性甲基化位点已被用于肺癌、结直肠癌或胶质瘤等恶性肿瘤的早期诊断和预后评估。本专利技术发现tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平可用于预测“驱动基因阴性”肺腺癌患者的预后生存状态，可通过检测cg17437939、cg11873482、cg16353006和cg25800765这四个位点的甲基化水平对这类特殊分子亚型的患者进行合理的危险度分层。
10、因此，本专利技术请求保护用于检测tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的试剂在肺腺癌预后评估方面的应用。
11、具体地，所述tac1基因cpg位点cg17437939的基因组位置为：chr7:97361252，所述tac1基因cpg位点cg11873482的基因组位置为：chr7:97361244，所述lhx9基因cpg位点cg16353006的基因组位置为：chr1:197882469，所述alx1基因cpg位点cg25800765的基因组位置为：chr12:85673347。
12、本专利技术还请求保护用于检测tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的试剂在制备用于肺腺癌预后评估的产品中的应用。
13、具体地，所述肺腺癌为驱动基因阴性肺腺癌。
14、更具体地，所述驱动基因阴性肺腺癌是指缺乏egfr、alk、ros1、kras、braf、her2、met和ret驱动基因突变的肺腺癌。
15、具体地，所述试剂包括引物和探针。
16、可选地，所述用于检测tac1基因cpg位点cg17437939的甲基化水平的引物为seqid no.1～2所示引物对和seq id no.3所示扩增引物；用于检测tac1基因cpg位点cg11873482的甲基化水平的引物为seq id no.4～5所示引物对和seq id no.6所示扩增引物；用于检测lhx9基因cpg位点cg16353006的甲基化水平的引物为seq id no.7～8所示引物对和seq id no.9所示扩增引物；用于检测alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的引物为seq id no.10～11所示引物对和seq id no.12所示扩增引物。
17、可利用上述引物组合，通过焦磷酸测序获得所述4个cpg位点的甲基化水平。焦磷酸测序是dna甲基化定量分析的金标准，通过高效、准确地检测特定甲基化位点，可以稳定量评估患者的单碱基甲基化水平，为预后评估提供有效信息。
18、本专利技术还提供了一种用于检测tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的引物组合，包括用于检测tac1基因cpg位点cg17437939的甲基化水平的seq id no.1～2所示引物对和seq idno.3所示扩增引物；用于检测tac1基因cpg位点cg11873482的甲基化水平的seq id no.4～5所示引物对和seq id no.6所示扩增引物；用于检测lhx9基因cpg位点cg16353006的甲基化水平的seq id no.7～8所示引物对和seq id no.9所示扩增引物；用于检测alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的seq id no.10～11所示引物对和seq id no.12所示扩增引物。
19、本专利技术还提供了一种用于肺腺癌预后评估的试剂盒，所述试剂盒中含有用于检测tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的试剂。
20、具体地，所述试剂盒中含本专利技术上述引物组合。
21、本专利技术还提供了一种用于肺腺癌预后评估的模型，所述模型是以tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平作为标记物。
22、具体地，模型预后评估所用公式如下所示：
23本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.用于检测TAC1基因CpG位点cg17437939和cg11873482、LHX9基因CpG位点cg16353006和ALX1基因CpG位点cg25800765的甲基化水平的试剂在肺腺癌预后评估方面的应用。
2.用于检测TAC1基因CpG位点cg17437939和cg11873482、LHX9基因CpG位点cg16353006和ALX1基因CpG位点cg25800765的甲基化水平的试剂在制备用于肺腺癌预后评估的产品中的应用。
3.根据权利要求1或2所述应用，其特征在于，所述试剂包括引物和探针。
4.根据权利要求3所述应用，其特征在于，所述用于检测TAC1基因CpG位点cg17437939的甲基化水平的引物为SEQ ID NO.1～2所示引物对和SEQ ID NO.3所示扩增引物；用于检测TAC1基因CpG位点cg11873482的甲基化水平的引物为SEQ ID NO.4～5所示引物对和SEQID NO.6所示扩增引物；用于检测LHX9基因CpG位点cg16353006的甲基化水平的引物为SEQID NO.7～8所示引物对和SEQ ID N
5.一种用于检测TAC1基因CpG位点cg17437939和cg11873482、LHX9基因CpG位点cg16353006和ALX1基因CpG位点cg25800765的甲基化水平的引物组合，其特征在于，包括用于检测TAC1基因CpG位点cg17437939的甲基化水平的SEQ ID NO.1～2所示引物对和SEQ IDNO.3所示扩增引物；用于检测TAC1基因CpG位点cg11873482的甲基化水平的SEQ ID NO.4～5所示引物对和SEQ ID NO.6所示扩增引物；用于检测LHX9基因CpG位点cg16353006的甲基化水平的SEQ ID NO.7～8所示引物对和SEQ ID NO.9所示扩增引物；用于检测ALX1基因CpG位点cg25800765的甲基化水平的SEQ ID NO.10～11所示引物对和SEQ ID NO.12所示扩增引物。
6.一种用于肺腺癌预后评估的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中含有用于检测TAC1基因CpG位点cg17437939和cg11873482、LHX9基因CpG位点cg16353006和ALX1基因CpG位点cg25800765的甲基化水平的试剂。
7.根据权利要求6所述试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中含有权利要求4所述引物组合。
8.一种用于肺腺癌预后评估的模型，其特征在于，所述模型是以TAC1基因CpG位点cg17437939和cg11873482、LHX9基因CpG位点cg16353006和ALX1基因CpG位点cg25800765的甲基化水平作为标记物。
9.根据权利要求8所述模型，其特征在于，模型的预后评估所用公式如下所示：
10.一种用于肺腺癌预后评估的系统，其特征在于，包括：
...【技术特征摘要】
1.用于检测tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的试剂在肺腺癌预后评估方面的应用。
2.用于检测tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的试剂在制备用于肺腺癌预后评估的产品中的应用。
3.根据权利要求1或2所述应用，其特征在于，所述试剂包括引物和探针。
4.根据权利要求3所述应用，其特征在于，所述用于检测tac1基因cpg位点cg17437939的甲基化水平的引物为seq id no.1～2所示引物对和seq id no.3所示扩增引物；用于检测tac1基因cpg位点cg11873482的甲基化水平的引物为seq id no.4～5所示引物对和seqid no.6所示扩增引物；用于检测lhx9基因cpg位点cg16353006的甲基化水平的引物为seqid no.7～8所示引物对和seq id no.9所示扩增引物；用于检测alx1基因cpg位点cg25800765的甲基化水平的引物为seq id no.10～11所示引物对和seq id no.12所示扩增引物。
5.一种用于检测tac1基因cpg位点cg17437939和cg11873482、lhx9基因cpg位点cg16353006和alx1基因cpg位点cg25800765的甲...
【专利技术属性】
技术研发人员：柯尊富，舒曼，
申请(专利权)人：中山大学附属第一医院，
类型：发明
国别省市：
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