核酸富集方法、染色质互作分析方法及试剂盒技术

技术编号:42659754 阅读:34 留言:0更新日期:2024-09-10 12:18
本申请涉及核酸富集方法、染色质互作分析方法及试剂盒,属于生物技术领域。其中,核酸富集方法包括:a.采用限制性内切酶对待富集染色质进行酶切处理;b.对酶切处理产物进行PCR扩增处理;c.采用甲基转移酶对PCR扩增处理产物进行甲基化修饰处理;d.富集甲基化修饰处理产物;其中,所述限制性内切酶的酶切位点适于被所述甲基转移酶进行甲基化修饰。基于本方法进行核酸富集能够避免染色质互作信号的损失,避免测序数据浪费,显著降低染色质互作检测成本。

【技术实现步骤摘要】

本申请属于生物,具体地,本申请涉及核酸富集方法、染色质互作分析方法及试剂盒


技术介绍

1、在真核细胞中,染色质有序地折叠成复杂的三维结构。其中,高维染色质结构与长距离基因调控相关,基因调控又控制着发育和细胞命运。染色质空间结构在基因表达和细胞功能调控中参与如转录、复制、dna修复和染色体转移等过程,其空间结构异常可能导致发育缺陷和人类疾病的发生。因此,研究染色质空间结构对理解细胞功能和疾病发生具有重要意义。

2、过去,基因组捕获技术(如染色质构象捕获、chromosome conformation capture,3c)是最早用于研究三维基因组结构的技术。然而,这些技术需要事先了解相互作用区域,才能量化基因组中基因座之间的相互作用,其检测特征为一对一检测。随后发展出的染色体构象捕获芯片(4c)和染色体构象捕获碳拷贝(5c)等技术在一定程度上解决了这一限制,但仍存在覆盖范围有限的问题。

3、为了克服这些限制,高通量基因组捕获技术hi-c(high-throughput/resolutionchromosome conformatio本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种核酸富集方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述待富集染色质预先经过交联处理;

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述限制性内切酶选自DpnII、MboI、AluI、MspI、HpaII、HhaI、TaqI、BamHI、EcoRI及同裂酶中的至少之一。

4.根据权利要求1~3任一项所述的方法,其特征在于,在所述酶切处理之后,PCR扩增处理之前,进一步包括:采用所述核酸连接酶对酶切处理产物进行连接处理;

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述打断处理选自内切酶打断,在所述打断处理后,进一...

【技术特征摘要】

1.一种核酸富集方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述待富集染色质预先经过交联处理;

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述限制性内切酶选自dpnii、mboi、alui、mspi、hpaii、hhai、taqi、bamhi、ecori及同裂酶中的至少之一。

4.根据权利要求1~3任一项所述的方法,其特征在于,在所述酶切处理之后,pcr扩增处理之前,进一步包括:采用所述核酸连接酶对酶切处理产物进行连接处理;

5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述打断处理选自内切酶打断,在所述打断处理后,进一步包括:对打断处理产物进行末端加a处理;

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,在所述接头连接处理前,进一步包括:对末端加a处理产物进行解交联处理;

7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在所述pcr...

【专利技术属性】
技术研发人员:唐冲陈智超谢烨明谭陈
申请(专利权)人:深圳华大基因股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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