【技术实现步骤摘要】
本申请具体涉及巴马香猪dna条形码及其相关的生物材料和应用。
技术介绍
1、巴马香猪，是广西壮族自治区特有的小型猪地方品种，被列入《国家级畜禽品种资保护名录》中，以其优良的肉品质著称。巴马香猪外貌清秀，个体矮、小、短、圆。主要表现为两头黑、中间白，部分个体背腰部稍带黑斑，额头有白线或倒三角型白斑，俗称“两头乌”。巴马香猪具有耐粗饲、适应力强和肉质优等特点。但也存在其选育程度低、体型小、产仔数不高，生长缓慢等问题，巴马香猪的产业化发展受到了严重制约。
2、随着猪基因组测序和高密度芯片的开发，使得全基因组关联分析能够对众多重要、特异性状的候选基因进行鉴定。根据全基因组范围内单核苷酸多态性基因分型，筛选出相关snp标记。然而，目前仍缺少功能明确、效应显著且可直接或间接用于巴马香猪育种的snp标记。
技术实现思路
1、本申请解决的技术问题是提供一种能够鉴定或辅助鉴定巴马香猪的生物学标记。
2、为了解决上述问题，本申请提供了下述应用。
3、检测snp1至snp39这39个snp的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定巴马香猪，或，制备鉴定或辅助鉴定巴马香猪的产品，或，猪育种或制备猪育种产品中的应用；
4、所述snp1是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.1的第5.位核苷酸，其为t或g；seq id no.1为tcgagtatct或tcgattatct；
5、所述snp2是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id n
6、所述snp3是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.3的第5位核苷酸，其为g或c；seq id no.3为ctttcatgtt或ctttgatgtt；
7、所述snp4是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.4的第5位核苷酸，其为a或c；seq id no.4为gtacctacct或gtacatacct；
8、所述snp5是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.5的第5位核苷酸，其为a或c；seq id no.5为gcaacggctt或gcaaaggctt；
9、所述snp6是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.6的第5位核苷酸，其为t或g；seq id no.6为cccaggagag或cccatgagag；
10、所述snp7是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.7的第5.位核苷酸，其为a或g；seq id no.7为gcaggaaata或gcagaaaata；
11、所述snp8是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.8的第5位核苷酸，其为c或t；seq id no.8为gctgtgccca或gctgcgccca；
12、所述snp9是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.9的第5位核苷酸，其为t或c；seq id no.9为tgcacgtgaa或tgcatgtgaa；
13、所述snp10是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.10的第5位核苷酸，其为g或a；seq id no.10为atgtaatgga或atgtgatgga；
14、所述snp11是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.11的第5位核苷酸，其为a或g；seq id no.11为gtaggtgtga或gtagatgtga；
15、所述snp12是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.12的第5位核苷酸，其为g或a；seq id no.12为tggtatgtag或tggtgtgtag；
16、所述snp13是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.13的第5位核苷酸，其为c或t；seq id no.13为agcatacaaa或agcacacaaa；
17、所述snp14是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.14的第5位核苷酸，其为a或g；seq id no.14为atttgtttta或atttatttta；
18、所述snp15是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.15的第5位核苷酸，其为a或g；seq id no.15为gtgagtaaaa或gtgaataaaa；
19、所述snp16是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.16的第5位核苷酸，其为t或a；seq id no.16为tcccaaggag或tccctaggag；
20、所述snp17是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.17的第5位核苷酸，其为a或g；seq id no.17为aaatgatatt或aaataatatt；
21、所述snp18是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.18的第5.位核苷酸，其为c或g；seq id no.18为ttgtgaataa或ttgtcaataa；
22、所述snp19是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.19的第5位核苷酸，其为g或a；seq id no.19为acaaaccata或acaagccata；
23、所述snp20是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.20的第5位核苷酸，其为a或g；seq id no.20为ctgagagggt或ctgaaagggt；
24、所述snp21是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.21的第5位核苷酸，其为t或c；seq id no.21为tcaacagcaa或tcaatagcaa；
25、所述snp22是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.22的第5位核苷酸，其为c或a；seq id no.22为gcttatctct或gcttctctct；
26、所述snp23是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.23的第5位核苷酸，其为g或a；seq id no.23为tgtaaattat或tgtagattat；
27、所述snp24是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.24的第5位核苷酸，其为c或t；seq id no.24为aatctatctg或aatccatctg；
28、所述snp25是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.25的第5位核苷酸，其为c或t；seq id no.25为ttattagtgg或ttatcagtgg；
29、所述snp26是猪基因组的一个snp，为序列表中seq id no.26的第5位核苷酸，其为a或g；seq id no.26为tactgaggaa或tactaaggaa；<本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.检测SNP1至SNP39这39个SNP的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定巴马香猪，或，制备鉴定或辅助鉴定巴马香猪的产品，或，猪育种或制备猪育种产品中的应用；
2.鉴定或辅助鉴定猪种质的方法，所述包括检测待测猪中权利要求1中所述SNP1-SNP39这39个SNP的基因型，对每个SNP的基因型进行记分，所述39个SNP的基因型的记分之和大于等于100分的待测猪为巴马香猪或候选为巴马香猪，所述39个SNP的基因型的记分之和小于100分的待测猪为非巴马香猪或候选为非巴马香猪；
3.权利要求2所述的方法在巴马香猪育种中的应用。
4.产品，其特征在于，所述产品含有权利要求1中所述检测猪基因组SNP1-SNP39这39的多态性或基因型的物质的产品，且为下述G1)-G3)中的任一种：
5.权利要求4所述的产品在巴马香猪育种或改良中的应用。
6.根据权利要求1或3所述的应用、权利要求2所述的方法、权利要求4所述的产品，其特征在于，所述育种的目的包括巴马香猪改良。
7.权利要求1、3或5任一所述的应用、权利要求2所述的方
8.权利要求2所述的方法在巴马香猪遗传改良中的应用。
9.巴马香猪DNA条形码，其特征在于，所述DNA条形码为权利要求1中所述的39个SNP。
10.权利要求9所述的DNA条形码在鉴定或辅助鉴定猪种质，或，制备鉴定或辅助鉴定猪种质的产品，或，猪育种或制备猪育种产品中的应用。
...【技术特征摘要】
1.检测snp1至snp39这39个snp的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定巴马香猪，或，制备鉴定或辅助鉴定巴马香猪的产品，或，猪育种或制备猪育种产品中的应用；
2.鉴定或辅助鉴定猪种质的方法，所述包括检测待测猪中权利要求1中所述snp1-snp39这39个snp的基因型，对每个snp的基因型进行记分，所述39个snp的基因型的记分之和大于等于100分的待测猪为巴马香猪或候选为巴马香猪，所述39个snp的基因型的记分之和小于100分的待测猪为非巴马香猪或候选为非巴马香猪；
3.权利要求2所述的方法在巴马香猪育种中的应用。
4.产品，其特征在于，所述产品含有权利要求1中所述检测猪基因组snp1-snp39这39的多态性或基因型的物质的产品，且为下述g1)-g3)中的任一种：
5.权利要...
【专利技术属性】
技术研发人员：唐中林，黎旺长，王子帅，王伟，杨小淦，
申请(专利权)人：佛山鲲鹏现代农业研究院，
类型：发明
国别省市：
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