一种基于液态芯片的SNP检测方法技术

本申请涉及生物技术领域，特别涉及一种基于液态芯片的SNP检测方法。本申请提供一种基于液态芯片的SNP检测引物，包括上游引物和下游引物；上游引物从5’端到3’端依次包括tag序列、间壁修饰、第一特异序列和第一酶切序列；下游引物从5’端到3’端依次包括检测基团、第二特异序列和第二酶切序列，第一酶切序列或第二酶切序列中含有匹配目标基因SNP位点的RNA碱基。本申请通过在引物上设计酶切序列，由于引物中的RNA碱基只有在上游引物、下游引物与目标基因完全匹配后才能被RNase酶切割，进而正常延伸，因此减少了引物二聚体和其他非特异性扩增产物，实现PCR的单管多重扩增；通过量子点微球可以进行多个目标检测，可以实现多重SNP位点的同时检测。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及生物，特别涉及一种基于液态芯片的snp检测方法。

技术介绍

1、聚合酶链式反应(pcr)是一种用于扩增特定的dna片段的分子生物学技术，pcr的最大特点是能将微量的dna大幅增加。pcr基本原理由变性-退火-延伸三个基本反应步骤构成：(1)模板dna的变性：模板dna经加热至93℃左右一定时间后，使模板dna双链或经pcr扩增形成的双链dna解离，使之成为单链，以便它与引物结合，为下轮反应作准备；(2)模板dna与引物的退火(复性)：模板dna经加热变性成单链后，温度降至55℃左右，引物与模板dna单链的互补序列配对结合；(3)引物的延伸：dna模板-引物结合物在72℃、dna聚合酶(如taqdna聚合酶)的作用下，以dntp为反应原料，靶序列为模板，按碱基互补配对与半保留复制原理，合成一条新的与模板dna链互补的半保留复制链。重复循环变性-退火-延伸三过程就可获得更多的“半保留复制链”，而且这种新链又可成为下次循环的模板。

2、单核苷酸多态性(snp)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性。它是人类可遗传的本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于液态芯片的SNP检测引物，其特征在于，包括上游引物和下游引物；所述上游引物从5’端到3’端依次包括tag序列、间壁修饰、第一特异序列和第一酶切序列；所述下游引物从5’端到3’端依次包括检测基团、第二特异序列和第二酶切序列，所述第一酶切序列或第二酶切序列中含有匹配目标基因SNP位点的RNA碱基。

2.如权利要求1所述的基于液态芯片的SNP检测引物，其特征在于，所述第一酶切序列从5’端到3’端均依次包括第一RNA碱基、第三特异性序列、错配碱基和3’block修饰；所述第二酶切序列从5’端到3’端均依次包括第二RNA碱基、第四特异性序列、错配碱基和3’block修饰；所...

【技术特征摘要】

1.一种基于液态芯片的snp检测引物，其特征在于，包括上游引物和下游引物；所述上游引物从5’端到3’端依次包括tag序列、间壁修饰、第一特异序列和第一酶切序列；所述下游引物从5’端到3’端依次包括检测基团、第二特异序列和第二酶切序列，所述第一酶切序列或第二酶切序列中含有匹配目标基因snp位点的rna碱基。

2.如权利要求1所述的基于液态芯片的snp检测引物，其特征在于，所述第一酶切序列从5’端到3’端均依次包括第一rna碱基、第三特异性序列、错配碱基和3’block修饰；所述第二酶切序列从5’端到3’端均依次包括第二rna碱基、第四特异性序列、错配碱基和3’block修饰；所述第一特异序列和/或第三特异性序列适于特异性结合目标基因的第一链；所述第二特异序列和/或第四特异性序列适于特异性结合目标基因的第二链，所述第一rna碱基或第二rna碱基匹配snp位点；

3.如权利要求1所述的基于液态芯片的snp检测引物，其特征在于，

4.如权利要求1所述的基于液态芯片的snp检测引物，其特征在于，所述上游引物包含匹配snp位点的rna碱基，所述上游引物包括1条野生型上游引物和2～3条突变型...

【专利技术属性】
技术研发人员：李雅雅，沙海天，白艳军，
申请(专利权)人：上海万子健生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：