【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物领域，具体地说，涉及基于edn1信号轴促进胰腺癌发生机制的实验方法。
技术介绍
1、目前，诊断和治疗方面的各种进展已开始对胰腺癌产生积极影响。但胰腺癌是一种高度复杂和侵袭性的恶性肿瘤，具有早期局部侵袭和转移的特点，对大多数治疗都有耐药性，故这些都被认为是其预后极差的原因。
2、内皮素-1（edn1）是肿瘤细胞产生的一种生长因子，在肿瘤发生发展过程中起重要作用，edn1被发现与细胞死亡和存活的生物学功能有关。edn1经常由许多实体瘤分泌，包括前列腺、结肠直肠、肝脏、乳腺和卵巢癌症。在这些肿瘤细胞中，edn1已被证明可以促进细胞增殖、抑制细胞凋亡、促进转移、促进血管生成。在腹膜癌患者中，edn1表达水平与腹痛呈正相关。在动物肿瘤模型中，内皮素受体拮抗剂抑制肿瘤生长有显著效果。在临床试验中，这些拮抗剂显著延缓激素难治性前列腺癌的转移。这些观察结果表明edn1的异常表达是肿瘤发生的关键步骤。了解edn1在肿瘤细胞中的表达机制可能使新的抑制癌症的治疗策略发生和发展。当前，癌症中edn1的病理合成机制尚不得知，我们假设...
【技术保护点】
1.基于EDN1信号轴促进胰腺癌发生机制的实验方法，其特征在于，包括步骤：
2.根据权利要求1所述的基于EDN1信号轴促进胰腺癌发生机制的实验方法，其特征在于，所述S1中，找出胰腺癌和正常组织中基因表达存在差异的基因，具体是采取了GEO数据库进行了胰腺癌芯片数据挖掘，选用GSE107610数据集来进行二次挖掘；对GSE107610数据集的基因分析结果中将高表达和低表达的基因绘制表达量热图。
3.根据权利要求1所述的基于EDN1信号轴促进胰腺癌发生机制的实验方法，其特征在于，所述S2中对基因进行功能富集和通路分析，具体的，对全部的差异基因进行KE...
【技术特征摘要】
1.基于edn1信号轴促进胰腺癌发生机制的实验方法，其特征在于，包括步骤：
2.根据权利要求1所述的基于edn1信号轴促进胰腺癌发生机制的实验方法，其特征在于，所述s1中，找出胰腺癌和正常组织中基因表达存在差异的基因，具体是采取了geo数据库进行了胰腺癌芯片数据挖掘，选用gse107610数据集来进行二次挖掘；对gse107610数据集的基因分析结果中将高表达和低表达的基因绘制表达量热图。
3.根据权利要求1所述的基于edn1信号轴促进胰腺癌发生机制的实验方法，其特征在于，所述s2中对基因进行功能富集和通路分析，具体的，对全部的差异基因进行kegg/go富集，寻找差异基因可能参与的生物学功能，确定与胰腺癌的转染有着紧密的联系的差异基因，将这些差异基因导入到cytospace3.6.1软件中，对互作网络进行重注释、结构优化操作，对模块进行二次富集，得到了互作网络中最活跃基因，在互作网络模式图中，找到 edn1以及与它相联系的基因，随后，利用cytoscape软件中的cytohubba插件筛选出与胰腺癌相关的前十基因中，将前五与之相关的基因在geo数据中做出箱式图。
4.根据权利要求1所述的基于edn1信号轴促进胰腺癌发生机制的实验方法，其特征在于，所述s3中通过体外培养和基因敲除实验来确认这些基因对edn1表达的影响，具体是以胰腺癌肿瘤细胞为载体，来进行体外培养和扩增，最终确认靶mrna并观察它所影响的mrna，敲除有可能使edn1在胰腺癌肿瘤中高表达或低表达从而起到抑制肿瘤生长或预后效果显著的mrna。
5.根据权利要求1所述的基于edn1信号轴促进胰腺癌发生机制的实验方法，其特征在于，所述s4中，通过wgcna算法来使用tcga的数据对预测结果进行验证，具体的，将tcga中所得到的数据进行标准化为fpkm格式后，计算不同样本间的基因表达的方差，并选择方差值前1/4的基因，进行样本聚类树的构建、表达...
【专利技术属性】
技术研发人员：夏佳琪，李奕辰，李帅，朱徽胤，和静，
申请(专利权)人：佳木斯大学，
类型：发明
国别省市：
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