一种模式生物组学数据的下游知识解读引擎系统、方法、平台及程序产品技术方案

技术编号:42457811 阅读:20 留言:0更新日期:2024-08-21 12:47
本发明专利技术公开了一种模式生物组学数据的下游知识解读引擎系统,该系统包括,模式生物组学数据知识库;第一解读主引擎,基于模式生物本体知识解读主引擎,依托模式生物的生物本体知识,该第一解读主引擎接入所述模式生物组学数据知识库;第二解读主引擎,基于模式生物分子网络知识解读主引擎,依托模式生物分子网络知识,该第二解读主引擎接入所述模式生物组学数据知识库;以及人机交互模块,接收检索词,并将检索词输入至第一解读主引擎或第二解读主引擎,接收并展示各解读主引擎的解读结果。所述模式生物组学数据知识库由模式生物的本体知识子库、模式生物的生物分子网络知识子库、模式生物的多模态功能组学知识子库组成。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物信息,特别涉及一种模式生物组学数据的下游知识解读引擎系统、方法、平台及程序产品


技术介绍

1、当代生物医学研究领域的核心是以疾病为主体展开的基础研究,受限于生物进化的保守性和人类伦理道德的约束,科学家们自然而然地将目光投向模式动物,将其作为疾病研究的理想对象。模式生物具有繁殖快、易培养、与人类基因组相似度高等特点,利用模式生物建立的疾病模型在模拟人类疾病过程方面具有独特优势。然而,尽管小鼠、斑马鱼、线虫、果蝇等模式生物被广泛应用于疾病模型的建立,但现有模型仍然存在与人类不完全吻合的情况。举例来说,某些病原体引发的免疫反应只针对人类细胞,难以在小鼠身上复现。这些问题制约了传统小鼠模型在药效评价和安全性评价上的准确性和有效性,迫使我们寻求对模型进行进一步改进的途径,这也是当前研究面临的一个重要挑战。此外,模式生物相关的基础研究积累了大量数据,一些相关数据库已对这些数据进行了整合和归纳。然而,如何利用这些多样格式的数据资源,发掘其中蕴藏的生物学意义,并实现从模式动物到人类的跨越,成为当前研究的另一个瓶颈。

2、模式生物组学汇总数据本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种模式生物组学数据的下游知识解读引擎系统,其特征在于,所述系统包括,

2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述模式生物组学数据知识库由模式生物的本体知识子库、模式生物的生物分子网络知识子库、模式生物的多模态功能组学知识子库组成。

3.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述第一解读主引擎包括第一解读子引擎和第二解读子引擎,所述第二解读主引擎包括第三解读子引擎、第四解读子引擎和第五子引擎,

4.根据权利要求3所述的系统,其特征在于,所述人机交互模块由交互层、前端UI层和访问层组成,

5.根据权利要求4所述的系统,其特征在于,所述...

【技术特征摘要】

1.一种模式生物组学数据的下游知识解读引擎系统,其特征在于,所述系统包括,

2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述模式生物组学数据知识库由模式生物的本体知识子库、模式生物的生物分子网络知识子库、模式生物的多模态功能组学知识子库组成。

3.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述第一解读主引擎包括第一解读子引擎和第二解读子引擎,所述第二解读主引擎包括第三解读子引擎、第四解读子引擎和第五子引擎,

4.根据权利要求3所述的系统,其特征在于,所述人机交互模块由交互层、前端ui层和访问层组成,

5.根据权利要求4所述的系统,其特征在于,所述系统的解读过程...

【专利技术属性】
技术研发人员:王珊包超慧方海
申请(专利权)人:上海交通大学医学院附属瑞金医院
类型:发明
国别省市:

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