【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
1、核酸测序可能涉及从一个或多个核酸样品制备核酸文库。制备在下一代测序中使用的核酸文库的方法可能需要将长核酸样品片段化至适合于所使用的测序方法的长度,添加用于dna测序的接头核酸,以及用一个或多个短的鉴定(例如条形码)序列标记每个文库片段以便鉴定和分析。这些方法可能包括多个步骤,其间需要纯化,这既会增加制备时间,也会在最终测序结果中引入误差。本文提供了解决这个问题的试剂盒和方法。
技术实现思路
1、总的来说,本专利技术涉及用于制备核酸文库(例如适合于通过下一代测序(ngs)技术进行核酸测序的核酸文库)的试剂盒和方法。
2、一方面,本专利技术提供了一种试剂盒。所述试剂盒包括:第一组合物,其包括dna聚合酶;第二组合物,其包括:包括第一转座酶和第一接头寡核苷酸的第一突触复合物;和包括第二转座酶和第二接头寡核苷酸第二突触复合物;其中所述第二组合物不包括镁离子(例如mg2+);和镁离子(例如mg2+),其在第三组合物中或在所述第一组合物中。
3、在某些实施方式中
...【技术保护点】
1.一种试剂盒,其包含:
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其中:
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其中所述第一接头寡核苷酸包含第一接头引发区,并且所述第二接头寡核苷酸包含第二接头引发区。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其进一步包含:
5.一种在第一反应容器中的一锅反应中从包含靶核酸的核酸样品产生文库的方法,其中所述方法包括使用根据权利要求2所述的试剂盒扩增所述核酸样品以产生测序寡核苷酸,所述测序寡核苷酸包含:
6.根据权利要求5所述的方法,其进一步包括:
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述转
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种试剂盒,其包含:
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其中:
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其中所述第一接头寡核苷酸包含第一接头引发区,并且所述第二接头寡核苷酸包含第二接头引发区。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其进一步包含:
5.一种在第一反应容器中的一锅反应中从包含靶核酸的核酸样品产生文库的方法,其中所述方法包括使用根据权利要求2所述的试剂盒扩增所述核酸样品以产生测序寡核苷酸,所述测序寡核苷酸包含:
6.根据权利要求5所述的方法,其进一步包括:
7.根据权利要求6所述的方法,其中所述转座反应在25-65℃之间的转座反应温度下发生,和/或所述聚合反应在55-95℃之间的聚合反应温度下发生。
8.根据权利要求6所述的方法,其中所述转座反应发生1至30分钟之间的第一反应持续时间,和/或所述聚合反应发生1至60分钟之间的第二反应持续时间。
9.根据权利要求6所述的方法,其中所述核酸样品、所述第一接头寡核苷酸、所述第二接头寡核苷酸、所述一对中间核酸和/或所述测序寡核苷酸包含dna。
10.根据权利要求9所述的方法,其中所述核酸样品包含双链dna(dsdna)。
11.根据权利要求6所述的方法,其进一步包括在所述第一反应容器中,在使用第一通用引物和第二通用引物的pcr反应中扩增所述文库,其中所述第一通用引物包含与所述第一通用引物区同源的序列,并且所述第二通用引物包含与所述第二通用引物区同源的序列,从而产生扩增的文库。
12.根据权利要求11所述的方法,其中所述文库、所述第一通用引物和所述第二通用引物包含dna。
13.一种在第一反应容器中的一锅反应中从核酸样品产生文库的方法,其中所述方法包括使用根据权利要求4所述的试剂盒扩增所述核酸样品,以产生扩增子,所述扩增子包含:
14.根据权利要求13所述的方法,其进一步包括:
15.根据权利要求14所述的方法,其中所述转座反应在25-65℃之间的转座反应温度下发生。
16.根据权利要求14所述的方法,其中所述转座反应发生5至30分钟之间的第一反应持续时间。
17.根据权利要求14所述的方法,其中所述pcr反应包含1-35个循环。
18.根据权利要求14所述的方法,其中所述核酸样品、所述第一接头寡核苷酸、所述第二接头寡核苷酸、所述第一扩增物寡核苷酸、所述第二扩增物寡核苷酸、所述中间核酸和/或所述扩增子包含dna。
19.根据权利要求18所述的方法,其中所述核酸样品包含双链dna(dsdna)。
20.根据权利要求14所述的方法,其进一步包括在所述第一反应容器中,在使用第一通用引物和第二通用引物的pcr反应中扩增所述文库,其中所述第一通用引物包含与所述第一通用引物区同源的序列,并且所述第二通用引物包含与所述第二通用引物区同源的序列,从而产生扩增的文库。
21.根据权利要求20所述的方法,其中所述文库、所述第一通用引物和所述第二通用引物包含dna。
22.一种在第一反应容器中的一锅反应中从核酸样品产生包含扩增子的文库的方法,所述方法包括:
23.根据权利要求22所述的方法,其中所述转座反应在25-65℃之间的转座反应温度下发生。
24.根据权利要求22所述的方法,其中转座反应发生5至30分钟之间的第一反应持续时间。
25.根据权利要求22所述的方法,其中所述pcr反应包含1-35个循环。
26.根据权利要求22所述的方法,其中所述核酸样品、所述第一接头寡核苷酸、所述第二接头寡核苷酸、所述第一扩增物寡核苷酸和所述第二扩增物寡核苷酸、所述一对中间核酸和所述扩增子包含dna。
27.根据权利要求26所述的方法,其中所述核酸样...
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