DNA组合物及相关方法技术

技术编号:42189054 阅读:16 留言:0更新日期:2024-07-30 18:39
本披露提供了例如不形成长于100个碱基对的双链结构的单链共价闭合的DNA。ssDNA可以编码效应子序列,例如治疗性蛋白。ssDNA可以包含核靶向序列(NTS)。在一些实施例中,ssDNA显示了与其他类似的dsDNA相比减少的先天性免疫系统的激活。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】


技术介绍

1、需要新颖治疗方式来解决未满足的医疗需求。


技术实现思路

1、本文描述了药物dna组合物,构建体,制剂,使用这样的组合物、构建体和制剂的方法,及其制备方法。

2、在一些方面,本披露提供了药物配制品,其包含:含有单链dna(ssdna)的lnp,其中所述ssdna:(a)编码治疗性蛋白,(b)是共价闭合的,(c)不形成长于100个碱基对的双链结构,(d)长度超过200个核苷酸,并且(e)不包含蛋白端粒酶靶序列;其中所述药物配制品基本上不含线性dna和蛋白质。在一些实施例中,ssdna不形成长于40个碱基对的双链结构。

3、在一些实施例中,ssdna包含与编码治疗性多肽的序列可操作地连接的启动子序列。在一些实施例中,治疗性蛋白选自由以下组成的组:转录因子、染色质重塑因子、抗原、肽、激素、酶、抗体、受体配体、受体、凝血因子和膜蛋白。在一些实施例中,ssdna具有30%-40%、40%-50%、50%-60%或60%-70%的gc含量。

4、在一些实施例中,ssdna本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种制备环状ssDNA的方法,所述方法包括:

2.一种制备环状ssDNA的方法,所述方法包括:

3.一种制备环状ssDNA的方法,所述方法包括:

4.一种制备环状ssDNA的方法,所述方法包括:

5.如权利要求2-4中任一项所述的方法,其中所述环状dsDNA:

6.如权利要求1和3-5中任一项所述的方法,其中b)包括在允许选自Nb.BsrDI或Nt.BspQI的切口核酸内切酶切割所述dsDNA中的切口识别位点的条件下,使所述环状dsDNA与识别所述dsDNA中的所述位点的所述切口核酸内切酶接触,从而产生带切口的dsDNA。<...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种制备环状ssdna的方法,所述方法包括:

2.一种制备环状ssdna的方法,所述方法包括:

3.一种制备环状ssdna的方法,所述方法包括:

4.一种制备环状ssdna的方法,所述方法包括:

5.如权利要求2-4中任一项所述的方法,其中所述环状dsdna:

6.如权利要求1和3-5中任一项所述的方法,其中b)包括在允许选自nb.bsrdi或nt.bspqi的切口核酸内切酶切割所述dsdna中的切口识别位点的条件下,使所述环状dsdna与识别所述dsdna中的所述位点的所述切口核酸内切酶接触,从而产生带切口的dsdna。

7.如权利要求1、2和4-6中任一项所述的方法,其中c)包括在允许所述带切口的链降解(例如,完全降解)的条件下,使所述带切口的dsdna与t7外切核酸酶接触。

8.如权利要求1-3和5-7中任一项所述的方法,所述方法进一步包括:d)对所述环状ssdna进行凝胶纯化。

9.如权利要求1-8中任一项所述的方法,其中产生所述环状dsdna包括以下中的一项或多项(例如,2、3、4或全部):

10.如权利要求1-9中任一项所述的方法,所述方法包括一个或多个纯化步骤,例如,凝胶纯化或者使用dna纯化柱。

11.如权利要求10所述的方法,其中对以下进行所述纯化步骤:

12.如权利要求1-11中任一项所述的方法,所述方法不包括有机萃取步骤(例如,苯酚-氯仿萃取步骤)。

13.如权利要求1-12中任一项所述的方法,其中c)包括使所述带切口的dsdna与所述外切核酸酶(例如,所述t7外切核酸酶)接触15-120分钟,例如,20-60分钟,例如,约30分钟。

14.如权利要求1-13中任一项所述的方法,其中将不连续性引入所述环状dsdna的一条链中包括在两个相邻的核苷酸之间引入切口。

15.如权利要求1-14中任一项所述的方法,其中将不连续性引入所述环状dsdna的一条链中包括去除核苷酸,例如,其中所述核苷酸是尿嘧啶。

16.一种组合物(例如,药物组合物),其包含:

17.一种组合物(例如,药物组合物),其包含:

18.一种组合物(例如,药物组合物),其包含:

19.一种组合物(例如,药物组合物),其包含:

20.一种组合物(例如,药物组合物),其包含至少1、2、3、4、5、6、7、8、9或10mg的含有效应子序列的共价闭合的单链dna(ssdna)。

21.一种组合物(例如,药物组合物或制造中间体),其包含:

22.如权利要求16-21中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna不置于载剂中。

23.如权利要求16-21中任一项所述的组合物,所述组合物进一步包含载剂。

24.如权利要求23所述的组合物,其中所述载剂是基于脂质的载剂。

25.如权利要求24所述的组合物,其中所述基于脂质的载剂是脂质纳米颗粒(lnp)。

26.如权利要求16-22中任一项所述的组合物,将其配制用于裸施用。

27.如权利要求16-26中任一项所述的组合物,将其配制用于肠胃外施用。

28.如权利要求16-26中任一项所述的组合物,将其配制用于局部施用。

29.如权利要求16-26中任一项所述的组合物,其基本上不含选自由以下组成的组的杂质或副产物:内毒素、单核苷酸、经修饰的单核苷酸、双链dna、dna片段或截短物、蛋白质(例如酶,例如连接酶、限制酶)。

30.一种评估包含ssdna的组合物的样品的方法,所述方法包括确定是否满足条件,其中所述条件选自:

31.如权利要求30所述的方法,所述方法进一步包括如果满足所述条件,则对所述组合物进行下游加工步骤,其中任选地所述下游加工步骤选自:将所述组合物分成部分,将所述组合物包装,将所述组合物标记,将所述组合物运输,将所述组合物分配,将所述组合物储存或将所述组合物投入商业中。

32.如权利要求30或31所述的方法,其中所述组合物是如权利要求16-29中任一项所述的组合物。

33.如权利要求30-32中任一项所述的方法,其中所述组合物是通过如权利要求1-15中任一项所述的方法制备的。

34.一种将效应子递送至受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用如权利要求16-29中任一项所述的组合物。

35.一种调节细胞、组织或受试者中的生物学参数的方法,所述方法包括向所述细胞、组织或受试者施用如权利要求16-29中任一项所述的组合物。

36.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna不形成长于100个碱基对的双链结构。

37.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna包含化学修饰,例如,对糖的化学修饰、对碱基的化学修饰或对核酸主链的化学修饰。

38.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna不是噬菌体基因组。

39.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna缺乏噬菌体包装位点。

40.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna缺乏噬菌体复制起点。

41.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna不编码噬菌体衣壳基因。

42.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna不是通过滚环扩增产生的。

43.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna不是通过链置换扩增产生的。

44.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna不包含蛋白端粒酶靶序列。

45.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna不包含发夹结构。

46.如前述权利要求中任一项所述的组合物或方法,其中所述ssdna不包含与第二序列杂交的第一序列,其中所述第一序列和所述第二序列为至少5nt长,并且其中所述第一序列和所述第二序列的位置彼此相距小于6...

【专利技术属性】
技术研发人员:亚历山德拉·雷切尔·斯奈德雅各布·罗森布鲁姆·鲁本斯纳拉哈里·苏班纳·普贾尔莫莉·克里桑·吉布森本杰明·安德鲁·波特尼杰弗里·A·冯·马尔扎恩卡米洛·阿亚拉·布雷顿
申请(专利权)人:旗舰创业创新七公司
类型:发明
国别省市:

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