【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生信分析领域，更具体地，涉及一种基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法、系统、设备、计算机可读存储介质及其应用。
技术介绍
1、核心基因组多位点序列分型(core genome multilocus sequence typing，cgmlst)是一种分子流行病学方法，用于研究和描述原核生物的种群结构和进化关系。该方法基于核心基因组的多位点序列差异，通过比较不同微生物菌株的核心基因组序列差异，来确定它们之间的遗传关系和进化历史。cgmlst方法主要应用于微生物流行病学研究和临床感染控制等领域，可以用来追踪和识别微生物的传播路径，如疫情爆发的溯源分析、食源性疾病的调查和控制、医院内感染的追踪和控制等。此外，cgmlst方法还可以应用于研究微生物的种群结构和进化关系，评估抗生素耐药性的扩散和演化。
2、在真核生物中，由于可变剪接、同义突变和多拷贝基因的存在，导致真核生物的基因组序列在不同样本之间存在较大的差异，使得cgmlst方法难以建立一致性的分型标准，缺少一致性的分型标准限制了cgmlst方法在真核生物中的
【技术保护点】
1.一种基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法，其特征在于，所述方法还包括：
3.根据权利要求1所述的基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法，其特征在于，所述方法还包括：
4.根据权利要求1所述的基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法，其特征在于，所述方法还包括：
5.根据权利要求1所述的基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法，其特征在于，所述分型结果通过构建进化树实现待分析样本之间的亲缘关系的可视化，所述亲缘...
【技术特征摘要】
1.一种基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法，其特征在于，所述方法还包括：
3.根据权利要求1所述的基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法，其特征在于，所述方法还包括：
4.根据权利要求1所述的基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法，其特征在于，所述方法还包括：
5.根据权利要求1所述的基于核心基因组多位点序列的真核生物分型方法，其特征在于，所述分型结果通过构建进化树实现待分析样本之间的亲缘关系的可视化，所述亲缘关系的分析过程中，将待分析样本的背景信息纳入相关性评估，得到背景信息与等位基因谱的关系；所述背景信息包括以下...
【专利技术属性】
技术研发人员：杨英，王宇辰，马腾，张欣然，胡珊，周星辰，
申请(专利权)人：中国人民解放军军事科学院军事医学研究院，
类型：发明
国别省市：
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