【技术实现步骤摘要】
本申请主要涉及生物分子的分析,并具体涉及检测样品中一种或多种生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法、成分和分析系统。
技术介绍
1、在接下来的讨论中,出于背景介绍的目的描述了一些具体的文章和方法。本文包含的任何内容都不应被解释为对现有技术的“承认”。申请人特别保留了在适当的情况下做出如下证明的权利:根据适用的法律规定,本文引用的文章和方法不构成现有技术。
2、综合的基因表达分析和蛋白分析已经成为了解生物机制的有用工具。使用这些工具可以鉴定发育过程中和各类疾病(例如癌症和自身免疫疾病)中涉及的基因和蛋白。传统的方法,例如不同转录物的原位杂交和其它多重检测,已经揭示了基因表达的空间分布,并帮助阐明了发育和疾病的分子基础。可以对每份样品中的多个rna序列进行定量分析的其它技术包括微阵列(详见shi et al.,nature biotechnology,24(9):1151-61(2006);和slonim and yanai,plos computational biology,5(10):e1000543(2009))
...【技术保护点】
1.一种确定样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法,其中所述生物靶标为核酸,所述方法包括:
2.一种确定样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法,其中所述生物靶标为核酸,所述方法包括:
3.一种分析样品中生物靶标的方法,其中所述生物靶标为核酸,所述方法包括:
4.一种分析样品中生物靶标的方法,其中所述生物靶标为核酸,所述方法包括:
5.一种确定样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法,包括:
6.一种确定样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法,包括:
...【技术特征摘要】
1.一种确定样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法,其中所述生物靶标为核酸,所述方法包括:
2.一种确定样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法,其中所述生物靶标为核酸,所述方法包括:
3.一种分析样品中生物靶标的方法,其中所述生物靶标为核酸,所述方法包括:
4.一种分析样品中生物靶标的方法,其中所述生物靶标为核酸,所述方法包括:
5.一种确定样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法,包括:
6.一种确定样品中生物靶标的丰度、表达和/或活性的空间分布的方法,包括:
7.一种分析样品中生物靶标的方法,包括:
8.一种分析样品中生物靶标的方法,包括:
9.用于确定样品中多个位点上的一种或多种生物靶标的丰度、表达、和/或活性的空间分布的系统,包括:
10.根据权利要求9所述的系统,其中所述第二模块包括用于传递所述地址标签的一个或多个微流控装置。
11.根据权利要求10所述的系统,其中所述一个或多个微流控装置包括第一组复合寻址通道和第二组复合寻址通道,所述第一组复合寻址通道中的每一条通道向所述样品传递不同的第一地址标签,所述第二组复合寻址通道中的每一条通道向所述样品传递不同的第二地址标签。
12.根据权利要求1-8任一所述的方法,还包括:在步骤(a)和(b)之间,使所述探针与所述生物靶标杂交。
13.根据权利要求1-8或12任一所述的方法,还包括:使用所述生物靶标作为模板延伸所述探针,由此产生包含所述探针的至少一部分和所述生物靶标的至少一部分的寡核苷酸序列。
14.根据权利要求1-8,12或13任一所述的方法,其中所述探针还包括第一连接区域,所述地址标签包括第二连接区域;通过所述第一连接区域和所述第二连接区域之间的连接,所述探针与所述地址标签结合。
15.根据权利要求4,8或12-14任一所述的方法,其中位于所述样品中所述第一位点和所述第二位点的交点处的所述第一地址标签和所述第二地址标签是相同的。
16.根据权利要求4,8或12-14任一所述的方法,其中位于所述样品中所述第一位点和所述第二位点的交点处的所述第一地址标签和所述第二地址标签是不同的。
17.根据权利要求1-8或12-16任一所述的方法,其中所述探针包括多个结合部,所述多个结合部能够特异性地结合所述生...
【专利技术属性】
技术研发人员:马克·S·朱,大卫·罗腾伯格,
申请(专利权)人:普罗格诺西斯生物科学公司,
类型:发明
国别省市:
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