巢式多重PCR高通量测序文库制备方法及试剂盒技术

技术编号:41880464 阅读:17 留言:0更新日期:2024-07-02 00:34
一种巢式多重PCR高通量测序文库制备方法及试剂盒,该方法包括:使用正向引物和反向引物对目标区域进行扩增,正向引物是正向特异性序列,反向引物包括3’端的反向特异性序列和5’端的第一通用测序序列;对第一轮PCR扩增的产物进行纯化;使用巢式引物、第一标签引物和第二通用引物对纯化后的产物进行扩增,其中巢式引物位于正向引物的下游,巢式引物包括5’端的第二通用测序序列和3’端的特异性序列,第一标签引物3’端序列和反向引物5’端的部分或全部序列相同,且第一标签引物还包括第一标签序列,第二通用引物3’端序列和巢式引物5’端的部分或者全部序列相同。本发明专利技术有效避免多重PCR扩增过程中产生的二聚体,并且采用巢式扩增方法大大增加PCR扩增的特异性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及文库制备,具体涉及一种巢式多重pcr高通量测序文库制备方法及试剂盒。


技术介绍

1、随着测序技术的发展,对基因组候选区段的重测序需求日益增加,人们对序列的关注超过了少数的snp,候选区段的范围可能在5kb-10m之间。使用传统sanger法或目标区域杂交捕获测序价格昂贵,使用目标区域捕获测序很好地解决了这一难题。目标区域捕获技术可大致分为两种:一种是基于杂交的捕获测序技术,另一种是基于多重pcr的捕获技术。两者通过多重探针或者引物对感兴趣的基因区域一次性捕获,结合高通量测序技术,多样本同时测序,得到目标区域的序列信息。相对于全基因组测序,目标捕获测序技术在大样本量筛查的同时极大地降低成本。但前者的实验流程繁琐,探针成本较高,限制了其在临床上的应用,后者实验操作简单,灵活性强,适用于孟德尔遗传性疾病的筛查和诊断、gwas候选区段重测序、qtl定位区段重测序、精准医疗研究与应用等领域。

2、高通量snp检测服务结合多重pcr和高通量测序技术,对需要检测的位点设计特异性引物,在单管内进行多重pcr扩增,不同的样本以不同的标签(barco本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种检测低频突变的巢式多重PCR扩增方法,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述反向引物中包含的标签序列为分子标签或样本标签。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第二轮PCR扩增中进一步包括使用第二通用引物。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述第二通用引物3’端序列和所述巢式引物5’端的第二通用测序序列部分或者全部序列相同。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在第二轮PCR扩增之后,进一步包括测序步骤:将第二轮PCR扩增产物进行核酸序列测定,获得测序数据。>

6.根据权利...

【技术特征摘要】

1.一种检测低频突变的巢式多重pcr扩增方法,所述方法包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述反向引物中包含的标签序列为分子标签或样本标签。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述第二轮pcr扩增中进一步包括使用第二通用引物。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述第二通用引物3’端序列和所述巢式引物5’端的第二通用测序序列部分或者全部序列相同。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,在第二轮pcr扩增之后,进一步包括测序步骤:将第二轮pcr扩增产物进行核酸序列测定,获得测序数据。

6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,通过对测序数据的比对分析,获得样本低频突变信息。

7.一种多样本目标区域的巢式多重pcr扩增方法,所述方法包括:

8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述第一标签序列用于区分待测核酸的样本来源。

9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,第二轮pcr扩增进一步包括使用第二通用引物,所述第二通用引物3’端序列和所述巢式引物5’端的第二通用测序序列部分或者全部序列相同。

10.根据权利要求7-9任一项所述的方法,其特征在于,在进行第二轮pcr扩增之前,将第一轮pcr扩增产物混合。

11.根据权利要求10所述的方法,其特征在于,所述第一轮pcr扩增产物携带第一标签序列。

12.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,在第二轮pcr扩增之后,进一步包括测序步骤:将第...

【专利技术属性】
技术研发人员:杨林张艳艳陈芳蒋慧
申请(专利权)人:深圳华大智造科技股份有限公司
类型:发明
国别省市:

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