一种SARS-CoV-2抗原表位的筛选方法技术

本发明专利技术提供了一种SARS‑CoV‑2抗原表位和其靶向TCR序列的筛选方法及其应用。特别是，所述的方法成功识别并筛选出尚未发现的抗原表位和识别抗原的TCR序列，同时联合应用TCR测序、GLIPH2和T细胞报告系统的方法大大提高了抗原表位和其特异性TCR筛选的效率，SARS‑CoV‑2抗原特异性TCR对开发TCR‑T疗法有重要影响，SARS‑CoV‑2抗原表位也有助于开发基于T细胞的疫苗。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物医药，具体涉及一种sars-cov-2抗原表位的筛选方法。

技术介绍

1、sars-cov-2表现出一系列疾病严重程度，从无症状到危及生命的肺炎和多器官衰竭。为应对爆发的covid-19，许多制药公司和研究实验室致力于开发有效的冠状病毒疫苗，目前200多种疫苗正在开发中。大多数研究人员非常关注针对sars-cov-2刺突蛋白(s)的中和抗体的生产。然而，在covid-19患者中，体液免疫反应的变异性和稳定性不如细胞免疫反应，这凸显了t细胞反应的重要性。许多研究表明，t细胞与sars-cov-2感染有关，但有效的反应尚不清楚。

2、t细胞介导的免疫反应是适应性免疫系统对抗病毒病原体的主要防御机制之一。在病毒感染期间，cd8+t细胞识别病毒肽并通过释放颗粒酶和穿孔素介导对感染细胞的杀伤，参见文献：regulating the adaptive immune response to respiratory virusinfection(nat rev immunol,12(4)，2012)。然而，人们对sars-cov-2反应性t细本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种SARS-CoV-2抗原表位的筛选方法，其特征在于，所述的筛选方法包括构建TCR表达细胞，并将其与aAPC共培养，所述的aAPC表达SARS-CoV-2抗原表位。

2.根据权利要求1所述的筛选方法，其特征在于，所述的aAPC还表达HLA-DM、CD80分子和/或候选HLA等位基因；优选的，所述的候选HLA等位基因选自HLAI类基因或HLAII类基因，进一步优选的，所述的候选HLA等位基因选自HLAI类基因，所述的HLAI类基因包括HLA-A*02:01、HLA-A*24:02或HLA-A*11:01。

3.根据权利要求1或2所述的筛选方法，其特征在于，所述...

【技术特征摘要】

1.一种sars-cov-2抗原表位的筛选方法，其特征在于，所述的筛选方法包括构建tcr表达细胞，并将其与aapc共培养，所述的aapc表达sars-cov-2抗原表位。

2.根据权利要求1所述的筛选方法，其特征在于，所述的aapc还表达hla-dm、cd80分子和/或候选hla等位基因；优选的，所述的候选hla等位基因选自hlai类基因或hlaii类基因，进一步优选的，所述的候选hla等位基因选自hlai类基因，所述的hlai类基因包括hla-a*02:01、hla-a*24:02或hla-a*11:01。

3.根据权利要求1或2所述的筛选方法，其特征在于，所述的aapc基因组中缺失内源i类hla分子。

4.根据权利要求1-3任一所述的筛选方法，其特征在于，所述的sars-cov-2抗原表位来源于nsp1蛋白、nsp2蛋白、nsp3蛋白、nsp5蛋白、nsp6蛋白、nsp7蛋白、nsp8蛋白、nsp9蛋白、orf9b蛋白、orf9c蛋白、orf10蛋白、spike 1蛋白、m蛋白或n2蛋白；

5.根据权利要求1-4任一所述的筛选方法，其特征在于，所述的aapc选自cos-7细胞或k562细胞。

6.根据权利要求1-5任一所述的筛选方法，其特征在于，所述的tcr表达细胞包含tcrα链和/或tcrβ链的编码序列；

7.根据权利要求6所述的筛选方法，其特征在于，所述的tcrα链和/或tcrβ链通过分离患者pbmc以构建cdna文库，然后进行tcr转录测序获得。

8.根据权利要求1-7任一所述的筛选方法，其特征在于，所述的构...

【专利技术属性】
技术研发人员：王锋，许梦原，
申请(专利权)人：上海交通大学医学院，
类型：发明
国别省市：