一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备制造方法及图纸

技术编号:41770310 阅读:21 留言:0更新日期:2024-06-21 21:47
本发明专利技术提供了一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备,涉及基因技术领域,该方法包括:获取待测样本的测序数据;对测序数据进行预处理,获得目标测序数据;将目标测序数据与物种数据库进行比对,获得目标物种序列数据集,对目标物种序列数据集进行序列组装,获得组装结果;对组装结果进行基因预测,获得基因预测结果;对各个基因预测结果进行去冗余处理,得到各个非冗余基因序列;将每个非冗余基因序列与耐药基因数据库进行比对,获得每个非冗余基因序列对应的注释结果;基于每个非冗余基因序列对应的注释结果在各个非冗余基因序列中确定出耐药基因序列。应用本发明专利技术实施例提供的方法,能够准确地确定出耐药基因序列。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因,特别涉及一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备


技术介绍

1、随着生物科学技术的发展,抗生素也得到了广泛应用,抗生素能够有效的灭杀病原菌;然而,随着抗生素的广泛使用,使得微生物对一些抗生素产生免疫力,从而造成疾病的发病率和死亡率以及治疗的成本大量增加。因此,识别和理解抗菌素耐药性对于治疗耐药菌感染以及限制耐药菌扩散的临床和公共卫生实践至关重要;通过耐药基因预测病原菌对抗菌药物的敏感性以及病原体的致病力,可为临床的抗感染治疗提供参考依据。

2、现有技术中,在对耐药基因进行识别时,往往采用基于机器学习的预测模型进行耐药基因的识别,能够考虑到序列在整个耐药基因数据库中的相异性分布,从而可以预测出数量较多的耐药基因;然而,采用机器学习的方式,往往需要大量标记数据进行训练,在模型的训练样本质量较差的情况下,会使得模型对耐药基因的预测准确率低。


技术实现思路

1、本专利技术所要解决的技术问题是提供一种基因数据处理方法、装置、存储介质及电子设备,能够准确地确定出耐药基因序列。具体方本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基因数据处理方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对各个所述测序数据进行预处理,获得各个目标测序数据,包括:

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述目标物种序列数据集进行序列组装,获得组装结果,包括:

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述组装结果进行基因预测,获得每个所述目标物种序列分别对应的预测结果信息,包括:

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于每个所述非冗余基因序列对应的注释结果确定出耐药基因序列,包括:

6.根据权利要求1所述的方法,其...

【技术特征摘要】

1.一种基因数据处理方法,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对各个所述测序数据进行预处理,获得各个目标测序数据,包括:

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述目标物种序列数据集进行序列组装,获得组装结果,包括:

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对所述组装结果进行基因预测,获得每个所述目标物种序列分别对应的预测结果信息,包括:

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述基于每个所述非冗余基因序列对应的注释结果确定出耐药基因序列,包括:

6.根据权利要求1所述的方法,其...

【专利技术属性】
技术研发人员:张栋杜斌徐英春彭劲民杨启文刘瑞婷赵颖奕巧莲张戈李瑞琳拔素苹
申请(专利权)人:中国医学科学院北京协和医院
类型:发明
国别省市:

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